HDAC9基因SNPs与大动脉粥样硬化缺血性卒中的相关性研究

目的探讨组蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9,HDAC9)在动脉粥样硬化缺血性卒中易感区域单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与基因型和生物学表型的相关性。方法利用Haploview软件和千人基因组计划提供的遗传学数据,对HDAC9基因SNPs位点的最小等位基因频率(minor allele frequency,MAF)、单体域和单体型以及标签SNPs(haplotype tagging SNPs,ht SNPs)进行分析。结果在HDAC9基因Chr7:18930kb-19020kb区域共测定75个SNPs,其中Hardy-Weinberg平衡P>0.05,且MAF P>0.05的SNPs共51个。基于confidence intervals,four Gamete rule和solid spine of LD算法分别构建了11、14和8个单体域,其中rs2717356位点连锁不平衡程度低,且不在单体域内,属于HDAC9基因的重组热点区域。取r2≥0.8,且LOD值≥3.0确定30个SNPs为ht SNPs,且MAF均大于0.10;在ht SNPs中发现rs2526630位点[C/T]位于HDAC9的3'UTR区域,与hsa-mi R-545,hsa-mi R-616等micro RNAs结合。结论 30个标签ht SNPs作为人群HDAC9基因易感SNPs位点筛查和重复验证的依据。HDAC9基因rs2526630位点影响与mi RNA的结合在动脉粥样硬化缺血性卒中的发病中可能相关。

中国老年人HDAC9和PPP3CA基因多态性与衰弱的关联

目的探讨组蛋白去乙酰化酶9(histone deacetylase 9,HDAC9)rs2074633及钙调神经磷酸酶催化亚基A(calcineurin catalytic subunit A,PPP3CA)rs17030795的多态性与中国老年人衰弱发生的关联。方法本研究纳入衰弱组665例,对照组3388例。基于基因型频率及五种遗传模型(共显性、加性、显性、隐性和超显性),评估rs2074633及rs17030795多态性与衰弱之间的关联。结果在共显性模型中,与携带rs2074633 TT基因型相比,携带TC型(OR=1.99,95%CI:1.36~2.90)、CC型(OR=2.15,95%CI:1.48~3.13)的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95%CI:1.11~1.47)、显性(OR=2.07,95%CI:1.44~2.98)及隐形模型(OR=1.21,95%CI:1.01~1.45)中rs2074633多态性均增加衰弱的发生风险;在共显性模型中,与携带rs17030795 AA基因型相比,携带AG(OR=1.72,95%CI:1.19~2.51)、GG(OR=1.98,95%CI:1.37~2.87)型的个体发生衰弱的风险增加;在加性(OR=1.28,95%CI:1.11~1.48)、显性(OR=1.85,95%CI:1.29~2.66)及隐性(OR=1.25,95%CI:1.04~1.50)中rs17030795多态性均增加衰弱的发生风险。结论HDAC9 rs2074633及PPP3CA rs17030795多态性与中国老年人衰弱发生风险有关。

GWAS支持的遗传变异rs2107595多态性影响缺血性中风风痰瘀阻证的血脂代谢

本研究旨在探索rs2107595多态性与中国南方汉族人缺血性中风风痰瘀阻证的发生及血脂水平的关联。方法:纳入缺血性中风风痰瘀阻证患者311例、健康对照组605例,采用Sequenom技术进行基因分型,运用PLINK统计软件进行遗传关联分析。结果:HDAC9基因rs2107595多态性与缺血性中风风痰瘀阻证的关联无统计学意义(均P>0.05),但是,rs2107595多态性与缺血性中风风痰瘀阻证患者的血清总胆固醇(TC)水平显著关联(加性模型:Padj=0.006;显性模型:Padj=0.003)。结论:GWAS支持的遗传变异rs2107595多态性可能影响缺血性中风风痰瘀阻证的血脂代谢。