HES7基因多态性与先天性脊柱侧凸的关联分析

目的：探讨我国汉族人群HAIRY-AND-ENHANCER-OF-SPLIT-7（HES7）基凶多态性与先天性脊柱侧凸（congenital scoliosis，CS）的关联性。方法：2005年9月-2007年5月在我院住院治疗的性别与年龄完全匹配的CS患者和非发育性畸形疾病患者（对照组）各123例，均为汉族，从外周血中提取基因组DNA。从美国国立生物技术信息中心（NCBI）数据库选取HES7基因rs3027279和rs1442849两个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）位点，采用超高通量SNP分型系统对这两个位点进行基因分型，对检测的结果进行Hardy-Weinberg（H-W）平衡检验、卡方（X^2）检验、连锁不平衡（linkage disequilibrium，LD）分析、单位点非条件Logistic回归分析和多位点单倍型非条件Logistic回归分析，判断日ES7多态性与CS易感性是否存在关联性。结果：两个SNP位点都具有多态性，且均符合H-W平衡。rs3027279位点中，C和A两种等位基因的频率在对照组和CS组间的差异具有显著性（X^2=4.651，P〈0.05）；C／C和C／A两种基因型在两组间的差异具有显著性（X^2=5.857，P〈0.05）。rs1442849位点中，A和G两种等位基因在两组间的差异具有显著性（X^2=7.963，P〈0.05）；G／G、G／A和A／A三种基因型在两组间的差异有统计学意义（X^2=7.919，P〈0.05）。非条件Logistic回归分析表明rs1442849位点的A／A基因型对CS可能具有保护作用（P=0.018〈0.05，OR=0.35，95％CI=0.17-0.74），而rs3027279位点的C／A基因型可能会增加CS的发病风险（P=0.015〈0.05，OR=1.93，95％CI=1.13-3.30）。LD分析示该两位点存在连锁不平衡关系（D′=0.923，r^2=0.3812），单倍型非条件Logistic回归分析表明单倍型Hap3-GA可能会增加CS的发病风险（P=0.008〈0.01，OR=2.14，95％CI=1.23-3.74）。结论：中国汉族人群HES7的rs3027279和rs1442849两个位点存在多态性，该两个位点的多态性可能与CS的易感性有一定关联性。

基因HES7在结直肠癌中的表达及预后分析

目的分析基因HES7的表达与结直肠癌患者临床病理特征以及预后的相关性。方法从肿瘤基因组计划(TCGA)数据库下载结直肠癌组织和正常组织基因表达数据和相关的临床病理数据。利用R软件提取HES7基因表达数据,然后分析HES7在结直肠癌及癌旁组织中的差异表达。将基因HES7的表达数据分别与年龄、性别、Stage分期、TNM分期等临床病理数据合并并进行相关性分析,进一步进行多因素Cox分析和生存分析。并用GSEA富集分析软件对基因HES7进行通路富集(KEGG)分析。结果HES7在结直肠癌组织中明显高表达(W=6449.00,P<0.05);HES7低表达组中肿瘤T、N分期患者数量明显高于HES7高表达组,差异均有统计学意义(χ2分别=8.40、3.90,P均<0.05),并且HES7表达与患者性别、年龄、M分期和Stage分期无关(χ2分别=0.09、1.87、4.75、6.56,P均>0.05),基因HES7、年龄和T分期可作为评价患者预后的危险因子(HR分别=1.47、1.05、1.76,P均<0.05);HES7高表达可缩短结直肠癌患者的生存时间(χ2=5.34,P<0.05);HES7主要在过氧化物酶体、丙酸代谢、JAK/STAT信号通路、TOLL样受体信号通路等信号通路中被富集(P均<0.05),这些信号通路异常与多种恶性肿瘤的发生发展有关。结论基因HES7可能参与结直肠癌发生发展,可作为调节结直肠癌进展并影响患者预后的潜在靶标。

先天性脊柱侧凸发状分裂相关增强子-7基因外显子突变的筛查

目的:探讨汉族人群中发状分裂相关增强子-7(hairy-and-enhancer-of-split-7,HES7)基因外显子(exon)突变与先天性脊柱侧凸(congenital scoliosis,CS)发病的关系。方法:2009年6月～2010年12月在我院行手术治疗且有完整影像学资料的汉族散发非综合征型CS患者60例(病例组),其中男23例,女37例,年龄12.9±4.4岁;对照组为80例正常汉族人,其中男32例,女48例,年龄13.7±3.2岁。从每例受检者外周血中提取基因组DNA,设计引物扩增HES7基因exon(共4个:exon 1～4)序列,目的产物纯化后DNA自动测序,应用DNAstar软件的MegAlign将两组测序结果进行对比,并与美国NCBI基因库所公布的HES7基因exon序列进行比对分析,比较两组exon突变情况。结果:病例组和对照组HES7基因exon 1和exon 4序列均与基因库HES7基因exon序列一致;exon 2第81位点在两组中均存在G/A多态性,但基因多态性分布频率无显著性差异(P=0.727);exon 3第37位点在两组中均存在T/C多态性,但基因多态性分布频率也无显著性差异(P=1.000)。结论:中国汉族散发非综合征型CS患者HES7基因exon无突变,在中国汉族人群中HES7基因exon突变与散发非综合征型CS的发病可能无关。

高通量测序在一罕见脊柱肋骨发育不全病例诊断中的应用

目的分析一超声结构异常胎儿可能的致病基因及突变位点,为临床遗传咨询提供指导。方法对一超声检测提示脊柱发育异常的胎儿行医学外显子组测序,采用生物信息学方法针对致病基因突变位点进行氨基酸保守型分析及蛋白二、三级结构预测,鉴定其致病性。结果发现与胎儿临床表现相关的致病基因HES7存在c.674T>C(p.F225S)纯合变异,该位点分别遗传自父母,通过分析预测,变异位点能使得蛋白质二级、三级结构相比原始结构发生较显著变化。结论HES7基因c.674T>C(p.F225S)位点的纯合突变可能是导致胎儿脊柱发育异常的致病因素,与Ⅳ型脊椎肋骨发育不全(SCDO4)疾病的发生相关。