小鼠同源异型盒基因hex的克隆与序列分析

同源异型盒基因hex在动物个体发育过程中具有重要的作用。为了解小鼠hex基因在乳腺发育中的作用,研究中提取细胞总RNA,采用RT-PCR方法扩增hex基因,并克隆到pMD18-T载体后测序。结较保守,表明在进化中具有重要的作用。结果表明:小鼠的hex基因开放阅读框由816个核苷酸组成,编码271个氨基酸,相对分子质量为30kD。与已发表的小鼠该基因序列完全一致。与禽类、人和其他动物相比氨基酸序列的同源性在69.8%～97.0%之间。进化树显示,小鼠与大鼠的hex基因在同一分支内,只有7个氨基酸的差异,该蛋白在物种的进化中较保守,标明在进化中具有重要的作用。

大鼠同源异型盒基因hex的克隆与序列分析

Hex基因作为同源异型盒基因超家族的成员,在造血细胞的分化和发育中发挥着重要的作用。为研究该基因在乳腺发育和分化中的作用,本研究采用RT-PCR方法扩增大鼠hex基因,并克隆到pMD18-T载体后测序。结果表明,大鼠的Hex基因读码框由816 bp组成,编码271 aa,分子质量为30 ku。与已发表的大鼠该基因序列完全一致,与小鼠、禽类、人、非洲爪蟾和斑马鱼相比氨基酸序列的同源性在70.7%-97.0%之间。进化树显示,大鼠与小鼠的Hex基因在同一分支内,表明该蛋白保守,在物种进化中具有重要的作用。

巨桉HEX基因家族的生物信息学分析

己糖激酶(hexokinase,HEX)是催化己糖磷酸化生成6-磷酸己糖的酶,是植物呼吸代谢的过程中的关键酶,在植物糖信号的感受与转导过程中发挥重要作用,亦对植物纤维素生物合成至关重要。为研究桉树HEX基因在纤维素生物合成过程中的生物学功能,本研究从巨桉(Eucalyptus grandis)中筛选出10个HEX基因家族成员(EgrHEX1~EgrHEX10),利用生物信息学方法对其基因特征与表达模式进行综合分析。结果显示,EgrHEX基因分布在5条染色体之上,亚细胞定位均在细胞质膜上。EgrHEX基因家族的各个基因的结构存在明显的差异,外显子数量为7~15个。EgrHEX编码的蛋白质由α-螺旋、延伸链、无规卷曲、β-转角组成。进化分析结果表明,EgrHEX蛋白同与毛果杨HEX蛋白的进化关系接近。10个EgrHEX基因在巨桉未成熟木质部、成熟叶片、韧皮部、茎尖、木质部以及幼叶组织中均检测到了表达,但表达模式存在差异。本研究为进一步深入探索巨桉HEX基因家族的生物学功能提供理论依据。