黑龙江地区汉族HLA-A、B、DRB1基因及单倍型的研究与应用

目的研究中国造血干细胞捐献者资料库黑龙江分库汉族捐献者HLA-A、B、DRB1等位基因和单体型频率分布特征,探讨中国广大地区乃至世界其他人种利用黑龙江汉族捐献者进行造血干细胞移植的可能性。方法采用序列特异性引物(PCR-SSP)和序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)基因分型技术,对黑龙江地区汉族捐献干细胞的9 019名供者进行HLA-A、B、DRB1基因低分辨检测。结果共观察到77个HLA等位基因,其中频率>0.1的A、B、DRB1座位特异性分别为A2、A11、A24、B13、DR15、DR9、DR7、DR12、DR4。432条A-B单体型中,25条单体型的频率高于0.01,101条单体型呈现显著的正连锁不平衡,21条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40);437条B-DRB1单体型中,22条单体型的频率高于0.01,115条单体型呈现显著的正连锁不平衡,16条表现为强连锁不平衡;2 002条A-B-DRB1单体型中,971条单体型有意义(频率≥1.66×10-4),18条单体型频率高于0.005。截止2007年3月通过中国造血干细胞捐献者资料库管理中心检索,成功移植20例。结论黑龙江汉族人群HLA-A,B,DRB1等位基因和单体型的分布特征接近北方汉族人群,与中国汉族人总体分布特征相似。未发现群体特有的基因和单体型,但具有其自身分布特征。不同地区、不同人群有可能在中国造血干细胞库黑龙江地区汉族捐献者中寻找到HLA相合的供者。其中中国人群最容易找到HLA相合供者,其次是日本人和韩国人。

HLA-DRB1新等位基因DRB1＊1610的发现

目的对HLA新的等位基因HLA-DRB1＊11610的分析。方法采用商用DNA试剂盒抽提样本基因组DNA，利用HLA-DRB1组特异性引物PCR扩增先证者HLA-DRB1基因的第2外显子，PCR产物经割胶回收后进行测序分析。结果先证者有两个HLA-DRB1等位基因，其中一个为HLA-DRB1＊1202，另一个HLA-DRB1等位基因经BLAST验证为新的等位基因，新的等位基因序列已递交GenBank（DQ192647）。与最接近的DRB1＊1160201等位基因序列相比，新的等位基因仅在第2外显子上有1个核苷酸不同，即第227位A-T，导致第47位氨基酸Tyr→Phe。结论该等位基因为新的HLA-DRB1等位基因，被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1＊1610。