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GmHIR1基因的功能预测及表达分析
被引量:
2
1
作者
刘洋
辛大伟
+8 位作者
付营
李长育
张艳娇
于仁敬
刘丽敏
陈琳
刘春燕
蒋洪蔚
陈庆山
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期265-271,共7页
[目的]获取Gm HIR1相关生物信息学信息,分析与其他植物HIR的进化亲缘关系,进行启动子原件和结构的预测,分析其潜在调控功能,并研究该基因在疫霉菌侵染大豆过程中的表达情况。[方法]利用生物信息学软件对GmHIR1进行分析和功能预测,将大...
[目的]获取Gm HIR1相关生物信息学信息,分析与其他植物HIR的进化亲缘关系,进行启动子原件和结构的预测,分析其潜在调控功能,并研究该基因在疫霉菌侵染大豆过程中的表达情况。[方法]利用生物信息学软件对GmHIR1进行分析和功能预测,将大豆疫霉菌侵染抗病品种绥农10号和感病品种合丰25,分7个时间点进行取样,对GmHIR1的表达情况进行qRT-PCR分析。[结果]Gm HIR1启动子含有11个作用元件,该基因编码蛋白含有stomatins和prohibitin两个结构域,表达分析表明Gm HIR1在接种疫霉菌36 h之前,在抗病品种绥农10号中表达明显增加,而在感病品种合丰25中变化不明显,36 h之后,在两个品种的表达量变化趋势相似。[结论]Gm HIR1与多种生理反应相关,并且确认Gm HIR1与抗病大豆防御疫霉菌相关。
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关键词
大豆
hir1
生物信息学
表达分析
疫霉菌
原文传递
题名
GmHIR1基因的功能预测及表达分析
被引量:
2
1
作者
刘洋
辛大伟
付营
李长育
张艳娇
于仁敬
刘丽敏
陈琳
刘春燕
蒋洪蔚
陈庆山
机构
东北农业大学农学院
黑龙江省农垦科研育种中心
出处
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期265-271,共7页
基金
国家自然科学基金项目(No.31271747
No.31471516)
黑龙江省高校长江后备支持计划项目(No.2014CJHB004)
文摘
[目的]获取Gm HIR1相关生物信息学信息,分析与其他植物HIR的进化亲缘关系,进行启动子原件和结构的预测,分析其潜在调控功能,并研究该基因在疫霉菌侵染大豆过程中的表达情况。[方法]利用生物信息学软件对GmHIR1进行分析和功能预测,将大豆疫霉菌侵染抗病品种绥农10号和感病品种合丰25,分7个时间点进行取样,对GmHIR1的表达情况进行qRT-PCR分析。[结果]Gm HIR1启动子含有11个作用元件,该基因编码蛋白含有stomatins和prohibitin两个结构域,表达分析表明Gm HIR1在接种疫霉菌36 h之前,在抗病品种绥农10号中表达明显增加,而在感病品种合丰25中变化不明显,36 h之后,在两个品种的表达量变化趋势相似。[结论]Gm HIR1与多种生理反应相关,并且确认Gm HIR1与抗病大豆防御疫霉菌相关。
关键词
大豆
hir1
生物信息学
表达分析
疫霉菌
Keywords
soybean,
hir1
, bioinformation, qRT - PCR, Phytophthora sojae
分类号
S435.651 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
GmHIR1基因的功能预测及表达分析
刘洋
辛大伟
付营
李长育
张艳娇
于仁敬
刘丽敏
陈琳
刘春燕
蒋洪蔚
陈庆山
《生物技术》
CAS
CSCD
北大核心
2016
2
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