肿瘤分化相关蛋白HIV-ep2/MIBP1/MBP2的结构及功能分析

目的预测和分析肿瘤分化相关蛋白HIV-ep2/MIBP1/MBP2的结构及功能。方法检索蛋白质全序列,应用所克隆的基因片段序列Genebank数据库中进行BLUST比对,得出HIV- ep2/MIBP1的全长序列。应用ExPASy提供的ProtParam程序对该蛋白质进行基本特征进行运算,进一步进行二级结构分析。SMART预测功能域,PDB网站模拟三维结构,ELM预测基元。蛋白质亚细胞定位的信息学预测；Source资源网站作组织表达分布。结果HIV-ep2/MIBP1/MBP2基因编码一个含有2500氨基酸的巨大蛋白质,属于不稳定蛋白。二级结构主要包括62．52%随机卷曲；22．36%α螺旋；10．32%伸展链；4．80%β转角。三级结构主要含有4个锌指结构,计算机预测了蛋白的三维立体结构,可能的基元46种。功能方面该蛋白定位于细胞核,在滤泡淋巴瘤、肾近曲小管、大脑尾状核、精神分裂症脑S-11额叶、全脑、丘脑中含量丰富。结论HIV-ep2/MIBP1/MBP2蛋白为一个2500氨基酸的巨大蛋白,主要结构为4个锌指,定位于细胞核,可能与cyclin系统、Src家族等有关。