基于中国HIV-1 CRF01_AE重组亚型gp41 NHR结构域亚单位疫苗的研究

目的:构建基于中国HIV-1 CRF01_AE重组亚型包膜糖蛋白gp41 NHR结构域N51的亚单位疫苗,并进行免疫原性研究。方法:设计4条引物,运用重叠延伸PCR方法扩增出N51Fd基因,将其插入真核表达载体pFUSE-hIgG1-Fc2,构建重组质粒pFUSE/N51Fd并进行序列测定。Western blot法检测N51FdFc-AE重组蛋白的表达。用纯化蛋白免疫BALB/c小鼠后,ELISA法检测小鼠的抗体反应。结果:成功构建了pFUSE/N51Fd重组质粒,N51FdFc-AE重组蛋白在真核体系获得了高效表达,Western blot结果显示在相对分子质量(Mr)35 000处有目的蛋白条带。小鼠抗血清能特异性识别源于gp41 NHR的抗原,效价高达1∶102 400,平均效价为1∶51 200。结论:改造后的亚单位疫苗能有效激活机体的免疫响应,可用于HIV候选疫苗的研发。

HIV-1 CRF01_AE毒株gp41蛋白生物信息学预测

目的:对HIV-1 gp41蛋白的膜外区和跨膜区进行预测,并分析该蛋白的结构和功能。方法:从NCBI GenBank数据库获取gp41基因及其蛋白编码序列,利用ExPASy ProtParam tool、ProtScale、SignalP 4.0 Server、TMHMM Server v.2.0、SWISSMODEL、PredictProtein等工具对gp41蛋白的生物学特性进行预测。结果:HIV-1 gp41基因ORF长度为666 bp,编码222个氨基酸,蛋白分子式为C1164H1815N317O325S6,等电点(isoelectric point,pI)=8.60,属于稳定、疏水性蛋白。该蛋白具有跨膜区,信号肽切割位点位于第20和21位氨基酸处。其二级结构由无规则卷曲、β折叠和α螺旋组成,属于全螺旋型蛋白。而且该蛋白具有N-端信号肽,能引导蛋白分泌到胞外。此外gp41蛋白具有4个蛋白质-蛋白质和1个蛋白质-核酸结合位点,这些位点能调控gp41蛋白的多种生物学功能。结论:对gp41蛋白的结构和功能进行了预测,为深入研究其参与疾病发生发展的分子机制奠定了基础。

表达HIV-1 CRF01_AE亚型结构基因小鼠模型的建立和鉴定

目的:构建并鉴定表达HIV-1 CRF01_AE亚型结构基因的小鼠模型。方法:使用哺乳动物密码子优化的HIV-1 CRF01_AE gp160基因,通过慢病毒包装系统构建重组慢病毒LV-GFP-AE gp160,将上述重组慢病毒感染小鼠肺上皮细胞TC-1,经嘌呤霉素抗性筛选获得稳定表达gp160基因的TC-1细胞。采用RT-PCR、流式细胞术检测gp160基因在细胞内的表达稳定性,将稳定表达Gp160蛋白的TC-1-HIV AE gp160细胞接种小鼠,用免疫组化方法检测小鼠体内细胞团块中HIV Gp160蛋白的表达。结果:菌落PCR、酶切鉴定和测序表明重组质粒pLVX-AE gp160构建正确,RT-PCR、GFP荧光及流式细胞术结果均显示gp160基因能在细胞TC-1中稳定表达,免疫组化结果也表明小鼠体内接种的细胞可以稳定表达HIV Gp160蛋白。结论:建立了稳定表达HIV-1 CRF01_AE亚型Gp160蛋白的TC-1细胞及小鼠模型,为HIV-1 CRF01_AE亚型HIV疫苗的临床前研究提供了可靠的体外、体内免疫原性评价工具,为该疫苗的进一步开发奠定了坚实的实验基础。

哈尔滨市108例新发HIV-1感染者体内CRF01-AE亚型毒株成簇性分析

目的 了解哈尔滨市男男性行为(men who have sex with men, MSM)人群中新确诊HIV-1感染者体内CRF01-AE亚型毒株成簇性特征,为制定科学有效的防控措施提供依据。方法 收集哈尔滨市2017年新确诊MSM人群中HIV-1感染者流行病学及人口学信息,通过DNA测序和基因分型,对CRF01-AE亚型的序列进行成簇性分析。结果 本研究共获得108条CRF01-AE亚型序列,以簇内基因距离≤0.045和Bootstrap≥90%为界定簇标准,产生传播簇15个,其中由10条序列构成的传播簇1个;患者年龄、常住地、性伴数、性取向、婚姻状况、性病史在未成簇与成簇2组中差异均具有统计学意义(P均<0.05)。结论 CRF01-AE亚型毒株是哈尔滨市MSM HIV-1感染者中的优势传播株,具有较强的成簇性,在艾滋病防控中对于未婚、性行为活跃的青壮年人群及与该人群关系密切的人群须高度关注。

利用分子传播网络分析昆明市HIV-1 CRF01_AE毒株流行特点

目的 通过构建昆明市HIV-1 CRF01_AE毒株的分子传播网络,分析其流行特征并观察动态流行趋势,从而为当地制定疫情防控干预措施提供科学依据。方法 选择2015―2021年云南省传染病医院接受治疗的253例昆明市HIV-1 CRF01_AE新发感染患者作为研究对象。运用反转录巢式聚合酶链式反应成功扩增其基因序列,序列比对后导入HyPhy 2.2.4软件进行成对基因距离的计算。运用GraphPad-Prism 8.0软件确定最佳基因距离阈值,使用Cytoscope 3.7.2软件实现网络可视化。运用Network-Analyzer和MCODE(Molecular Complex Detection)工具进行网络特征分析。结果 在0.018最佳基因距离阈值下,253个研究对象中有118个(46.64%)进入网络分析,共形成了38个分子簇,其组成大小从2到17个节点不等。网络集群主要以异性传播(51.78%)和同性传播(37.94%)为主,年龄段主要分布于20~40岁(77.47%)。网络所有节点的总链接数为226,单个节点最高链接数为10。MCODE确定了3种重要的分子簇,3个分子簇分别定义为B、C、D型,B型由17个节点和19链接数组成,为同性传播集群呈低增长状态。C和D型均由5个节点和10链接数组成,为异性传播集群且呈静止状态。结论 昆明市HIV-1 CRF01_AE毒株分子传播网络中的分子簇具有一定特殊性和聚集性。同性传播和异性传播人群已经成为昆明市HIV-1 CRF01_AE毒株感染的两大风险群体,同时两个群体还有发生交叉传播的现象。传播网络中有一个同性传播组成的集群规模较大,其传播风险和活跃度较高,需加强对其监测,并制定针对性的干预措施对集群中的“核心人群”进行防控。

保定市1株新型HIV-1重组毒株的近似全长基因组鉴定分析

目的对保定市新发现的1株pol区不能明确分型的HIV-1毒株(BD226AJ)进行近似全长基因组扩增,并分析其亚型、重组模式和基因特点。方法提取患者血浆中HIV-1RNA并逆转录为cDNA,使用近末端稀释法分2段对其进行近似全长基因组扩增并测序。使用jpHMM和SimPlot 3.5软件对近似全长基因组序列进行重组模式和重组断点分析,采用MEGA 6.0软件分片段构建Neighbor-joining系统进化树进一步确认重组断点的准确性。构建该近似全长基因组序列及各亚型片段Neighbor-joining系统进化树,分析该毒株的亲本来源。结果经过近似全长基因组扩增、测序、序列拼接后,获得1条长度为8830 bp的HIV-1近似全长基因组序列。重组分析结果显示,该序列是由CRF01_AE和B亚型重组形成的,其近似全长基因组序列被3个断点分成了4个亚型片段,分别为ICRF01_AE(HXB2,823—4224 nt)、Ⅱ_(B)(HXB2,4225—5991 nt)、ⅢCRF01_AE(HX B2,5992—9295 nt)、ⅣB(HXB2,9296—9406 nt)。各亚型基因片段的系统进化树分析进一步表明该序列的可能亲本来源为CRF01_AE和B亚型。HIV BLAST的结果显示,该序列与CRF112_01B的相似性为96%,系统进化树分析进一步验证该序列与北京市男男性行为者(men who have sex with men,MSM)中的CRF112_01B序列聚集。结论本研究在保定市MSM人群中发现了1例由CRF01_AE和B亚型重组的新型重组毒株CRF112_01B,提示HIV-1CRF112_01B已通过MSM人群传入河北,并开始在保定市传播,因此加强该亚型或者类似新型毒株的监测,对有关部门采取针对性防控措施和遏制新型重组毒株在本地区的传播和流行具有重要意义。

HIV-1感染者不同人群的亚型分析

目的研究河北省2008年新确认的HIV-1感染者不同人群的亚型分布情况。方法选取2008年新确认的HIV-1感染者,利用分子生物学方法进行分型后,对不同人群的亚型分布情况进行分析,探讨不同HIV-1感染者人群的亚型分布比例有无差异。结果在58例已确定亚型的HIV-1感染者中,来源于性传播、吸毒、血液和不详4种不同的人群,包含了B、CRF01-AE、CRF07-BC、CRF08-BC和C5种亚型。在这4种人群中,性传播途径的人群以B亚型(42.1%)和CRF01-AE(34.2%)为主,但是5种亚型的毒株均存在;血液传播途径中,均为B亚型;在吸毒人群中,均为CRF07-BC亚型;不详人群中亚型相对较复杂,包含了C亚型除外4种亚型。结论河北省HIV感染者亚型的分布具有明显的人群特点。

上海市男男性行为者中感染HIV-1的CRF01_AE毒株传播簇分析

目的了解上海地区男男性行为者(MSM)中,感染艾滋病病毒1型(HIV-1)的CRF01_AE重组型的流行情况、成簇特性,为HIV防控工作提供科学数据。方法从2009-2013年每年新诊断的MSM HIV-1感染者血浆样本中提取RNA,并对HIV-1 pol基因片段进行反转录和巢式PCR扩增、DNA测序和亚型分析。对CRF01_AE重组型序列进行系统进化学和社会人口学信息分析。结果 1262名MSM感染者中,CRF01_AE重组型感染782人(62.0%),其序列在系统进化树上形成6个流行簇。使用不同参数界定传播簇并进行比较,选择以Bootstrap≥90%及基因距离≤0.03作为传播簇的界定标准,形成112个传播簇,其中由10条及以上序列形成的传播簇有5个;年龄、文化程度、婚姻状况、性病史和CD4+T淋巴细胞计数与样本的成簇性有统计学关联。结论 CRF01_AE重组型毒株是上海市MSM HIV-1感染者中的优势传播株,具有较强的成簇性,并且与相关的社会人口学和流行病学背景相关。

大连地区HIV-1 CRF01_AE亚型株基因特征分析

目的了解大连地区HIV-1 CRF 01_AE亚型株的基因特征及其可能传播链。方法对2008—2012年新确认144份全血标本进行血浆分离和HIV RNA提取,巢式PCR扩增Env基因并进行序列测定,并对CRF 01_AE亚型毒株序列进行生物信息学分析。结果得到的HIV感染者有效基因序列中,CRF 01_AE亚型占62.14%(64/103),所有病例均为性接触途径传播。系统进化树分析大连CRF 01_AE存在2个簇,分别以男男同性传播和异性传播毒株为主,其中男男同性性接触人群(MSM)簇组内平均基因离散率小于异性性接触者(Hetero)簇;与其他地区的CRF 01_AE亚型株构建的系统进化树显示2簇内均无其他国家序列,MSM簇与辽宁(除大连地区,下同)、北京和吉林MSM人群的CRF 01_AE亚型株位于同一分支,Hetero簇毒株则与辽宁、北京的MSM流行株及东南沿海地区异性传播CRF 01_AE亚型株遗传距离相近。结论大连市HIV-1 CRF 01_AE株主要通过性接触传播,男男同性传播毒株占主导优势,毒株传入大连时间晚于异性性接触者簇流行株;MSM存在2个以上传播链,与北方部分地区MSM人群中CRF 01_AE亚型株存在多次传播。

1992--2008年深圳HIV-1CRF01_AE重组株的流行趋势与进化规律

目的了解HIV-1CRF01_AE重组株在深圳地区的流行情况，并分析其流行趋势及进化规律。方法收集深圳地区1992--2008年HIV确认阳性血液样本489份，应用巢式聚合酶链反应（Nested-PCR）技术，对样本膜蛋白（Env）基因进行扩增，并对其基因区核苷酸序列进行测定，判定亚型结果。对获得的CRF01_AE重组株核酸序列进行系统进化分析，并计算基因离散率。结果共有465份样本获得分型结果，其中CRF01_AE重组株样本300份（占64．5％）。1992-1999、2000—2005和2006--2008年3个时间段CRF01_AE重组株所占比例分别为56．8％（21／37）、68．4％（78／114）和64．0％（201／314）；在这3个时间段内，经异性性传播的比例分别为52．4％（11／21）、43．6％（34／78）和45．8％（92／201），经同性性传播的比率上升明显，分别为4．8％（1／21）、0．0％（0／78）和22．4％（45／201），经吸毒传播的比例分别为19．0％（4／21）、51．3％（40／78）和30．8％（62／210）。系统进化分析发现，不同时间段的样本出现明显的时间聚集现象，并伴有传播途径的聚集及交叉感染现象。各时间段CRF01_AE重组株组内基因离散率分别为（8．783±4．717）％、（11．054±7．141）％、（13．218±4．080）％，有明显的增大趋势。结论HIV-1CRF01_AE重组株是深圳地区的主要流行株，主要经异性性行为、同性恋和吸毒人群传播，随着时间的推移毒株变异程度逐渐增大。

云南省HIV-1 CRF01AE毒株分子网络分析

目的了解云南省HIV-1 CRF01AE毒株的分子网络特征及相关影响因素。方法收集2018—2021年云南省耐药监测数据库中HIV/AIDS患者的人口学资料, 采集患者血浆, 逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定, 选择最适基因距离, 基于基因型为CRF01AE的序列构建分子网络。结果通过序列测定共获得967余CRF01AE亚型毒株序列, 在1.75%最适基因距离阈值下, 共有320条序列进入网络, 入网率为33.1%, 共鉴别出84个簇。在地区分布网络中形成1个多地区连接的簇, 1个以昭通为主的簇, 1个以红河为主的簇以及5个以文山为主的簇。网络中75.8%异性传播的男性与其他异性传播的男性连接, 其次与异性传播的女性连接(54.1%)。66.7%的男男同性性行为人群(MSM)之间存在潜在传播关联。入网影响因素分析结果显示, 与昆明市比较, 楚雄州、大理州、德宏州、红河州、临沧市、普洱市、文山州、玉溪市以及昭通市的HIV/AIDS患者更容易进入网络。年龄≥50岁人群较<25岁人群更容易进入网络。未发现云南省基因型为CRF01AE的HIV/AIDS患者成为高危传播者的影响因素, 需进一步探索高危传播者相关影响因素。结论云南省HIV-1 CRF01AE毒株在不同地区活跃传播, 传播关系复杂, 应加强对CRF01AE毒株的动态监测, 针对高危传播者采取精准干预, 从而减少新发感染。

哈尔滨市新确诊HIV-1 CRF01__AE亚型nef序列分析

目的分析哈尔滨市新确诊人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)CRF01_AE亚型nef基因及nef蛋白重要功能区氨基酸的变异性。方法从56例2014-2015年新确诊感染者外周血单核细胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)中提取基因组DNA,扩增全长nef基因,并测序。构建nef基因系统发育树,分析基因特点;将nef氨基酸序列与中国和国际CRF01_AE共享序列进行比对,分析nef蛋白重要功能区氨基酸的变异性。结果 56株nef基因序列与不同CRF01_AE亚簇聚集,其中26株与CRF01-4亚簇聚集,24株与CRF01-5亚簇聚集,6株与CRF01-1亚簇聚集。亚簇内基因距离分析发现,CRF01-5亚簇最小,CRF01-4亚簇次之,CRF01-1亚簇最大。nef蛋白多个功能区氨基酸序列高度保守,但长度可变区、凋亡结构域、酸性区和C端PAK结合区变异率较高,其中凋亡区M50I突变和PAK结合区K192R突变多见于CD4数较低的样本(P<0.05)。结论哈尔滨市新确诊CRF01_AE亚型nef基因的组成较为复杂,可能来源于多个地区和多种感染途径;凋亡结构域和PAK结合区氨基酸变异与疾病进展相关。

我国HIV-1 CRF01_AE毒株辅助受体利用的基因预测可行性研究

目的探讨HIV-1辅助受体基因预测工具对我国流行的CRF01_AE毒株辅助受体利用的可行性。方法从北京市、广西壮族自治区、四川省的HIV-1感染者中分离出CRF01_AE毒株22株,利用基因型方法(11/25规则、WebPSSM和geno2pheno)对病毒辅助受体利用情况进行预测,将预测结果与经GHOST细胞系检测的表型实验结果进行比较。结果经GHOST细胞系检测,22株CRF01_AE毒株中,4株利用CCR5/CXCR4辅助受体,18株利用CCR5辅助受体。11/25规则预测与表型实验的一致率为86.4%;geno2pheno中,G2p-clinical、NGS-sanger和G2p-colon模型预测与表型实验的一致率分别为95.5%、86.4%和68.2%;WebPSSM中,PSSM-sinsi_B、PSSM-x4r5和PSSM-sinsi_C模型预测与表型实验的一致率分别为86.4%、72.7%和45.5%。结论对于我国CRF01_AE毒株的HIV-1感染者,在使用辅助受体拮抗剂之前应进行辅助受体利用的预测,Geno2pheno是较准确的辅助受体基因预测工具。

中国部分地区HIV-1 CRF01_AE流行情况

近几年我国艾滋病病毒1型(HIV-1)的流行情况复杂,性接触传播逐渐成为感染HIV-1的最主要途径。CRF01_AE毒株在中国部分地区所占比例呈现逐年上升趋势,且与性传播密切相关,尤其在男男同性性行为者中广泛流行。本文对46篇针对CRF01_AE亚型研究的文献进行了综述,总结了我国HIV-1流行情况,并对我国黑龙江、河北、江苏、浙江、广西、广东、上海地区的HIV-1 CRF01_AE流行情况进行汇总,获得2004-2015年CRF01_AE亚型在HIV-1感染者基因亚型中所占比例变化规律,并分析了此毒株流行情况变化的原因。CRF01_AE毒株的快速传播和广泛分布为我国HIV-1感染的防控带来了挑战,在今后的防控工作中应密切关注该亚型毒株的变化情况。

南京地区HIV-1 CRF01_AE毒株分子流行特征及传播网络分析

目的 了解南京地区HIV-1 CRF01_AE毒株分子流行特征及传播网络情况,为该毒株的疫情防控提供参考依据。方法 收集2015年9月至2019年6月南京市新确诊的HIV-1感染者血样及人口学信息。扩增HIV-1 pol区基因片段,经判定CRF01_AE毒株共401条。以最大似然法构建系统进化树;通过Tamura-Nei 93成对基因距离法构建传播网络并分析其特征。结果 CRF01_AE毒株在南京地区共形成了3个全国相关流行枝(Clade 4a、Clade 4b、Clade 5)以及1个独特的南京流行枝(NJ-Clade),这4个流行枝分别包括23.69%(95/401)、18.20%(73/401)、13.72%(55/401)和30.92%(124/401)的南京序列。NJ-Clade中感染者年龄显著低于其他流行枝(χ^(2)=34.286,P<0.001),并且具有更高比例的同性性向(χ^(2)=19.129,P=0.024)和男男性行为(χ^(2)=14.293,P=0.027)。71.82%(288/401)的CRF01_AE毒株形成83个传播网络。多因素分析显示,相比Clade 4a(a OR=0.464)、Clade 4b(a OR=0.363)、Clade 5(a OR=0.483)流行枝,NJ-Clade具有更高的网络形成率。结论 南京地区HIV-1 CRF01_AE毒株流行情况复杂,除包含全国相关流行枝外,已形成了独特的南京流行枝,应持续监测各流行枝的进化传播情况。

云南省HIV-1 CRF01_AE毒株基因型耐药研究

目的 了解云南省HIV-1 CRF01_AE毒株的流行分布及基因型耐药情况。方法 收集2018—2021年云南省抗病毒治疗失败的HIV/AIDS患者的人口学资料,采集患者血浆,逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定,对基因型为CRF01_AE的序列进行耐药情况分析。结果 通过基因型耐药检测共获得967例亚型为CRF01_AE序列,其中男性682例(占70.5%),耐药509例,耐药率为52.6%,异性性传播813例(占84.1%),同性性传播95例(占9.8%)。同性性传播的耐药率最高,为65.3%;治疗时长<12个月的耐药率最低,为35.9%,36~<48个月耐药率最高,为58.1%。核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)耐药率为33.9%,非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)的耐药率为48.5%,蛋白酶抑制剂(PIs)的耐药率较低为1.3%。NRTIs类药物中阿巴卡韦(ABC)、恩曲他滨(FTC)和拉米夫定(3TC)耐药率较高,分别为为32.9%、32.4%和32.4%;NNRTIs类药物中奈韦拉平(NVP)和依非韦仑(EFV)耐药率较高,分别为47.6%和47.5%,均以高度耐药为主。一线治疗方案耐药率56.2%高于二线治疗方案耐药率29.5%,差异有统计学意义(P<0.001)。NRTIs耐药突变位点中,以M184V/I突变位点为主,突变率为30.0%;NNRTIs耐药突变位点中,以K103N/Q/S突变位点为主,突变率为28.1%;PIs耐药位点突变率相对较低,主要的耐药突变位点是L33F,突变率为3.7%。结论 云南省抗病毒治疗失败亚型CRF01_AE的患者耐药率有所降低,但部分地区及人群的耐药率仍较高,应加强对重点地区和人群的管理,加强耐药监测,对治疗失败的患者及时掌握耐药情况,合理调整治疗方案。

艾滋病病毒1型CRF01_AE毒株的过去、现在和将来

CRF01_AE是我国目前流行的主要HIV-1毒株，具有独特的流行病学特征。本文从该毒株的发现起源与命名、在国内外的流行过程、参与形成的重组毒株以及致病性等方面进行介绍，并讨论了与流行病学特征密切相关的社会和生物学因素。

HIV-1 CRF55_01B毒株流行特征的研究进展

CRF55_01B是我国报道的HIV-1主要流行毒株之一,具有较为独特的流行病学和基因进化特征。近几年HIV-1分子流行病学监测发现CRF55_01B已经成为我国第五个主要流行HIV-1毒株。本研究从他的发现起源、流行情况、致病性和耐药性及参与的重组等方面进行综述,并讨论了与其流行密切相关的社会和生物学因素。

江门市两条新型HIV-1 CRF55_01B/CRF07_BC重组体的基因组特征分析

不同亚型和循环重组亚型(Circulating recombinant forms,CRFs)在同一人群中的传播往往导致独特重组型(Unique recombinant forms,URFs)的出现。在本研究中,我们发现了两条新的HIV-1 CRF55_01B/CRF07_BC第二代重组体(Second-generation recombinant forms,SGRs),它们分别来自江门市的同性恋和异性恋群体。系统进化分析表明,JM.pj44和JM.pj64的近全长基因组(Near full-length genomes,NFLGs)均以CRF55_01B为骨架,插入了CRF07_BC的基因片段,但断点位置不同。将本研究发现的两种新的NFLGs与其他研究中发现的CRF55_01B/CRF07_BC SGRs进行比较,目前未发现有相同的CRF55_01B/CRF07_BC重组体。

黑龙江省HIV-1型流行株CRE01_AE env基因序列特征和传播簇分析

目的分析黑龙江省HIV-1感染者中流行株CRF01_AE env基因序列特征以及成簇特性。方法应用巢式聚合酶链反应（Nested polymerase chain reaction ，Nested-PCR）对env C2-C4区核苷酸序列进行扩增。用MEGA软件进行系统进化分析，然后对156份CRF01_AE重组型HIV-1毒株env基因V3环及邻近区域氨基酸特征分析以及生物信息学分析。 结果156份样本中绝大多数样本与中国黑龙江、吉林、辽宁的代表毒株聚成一簇，还有一小部分样本与来自中国云南以及泰国代表株90CM240、90CM235聚成一簇。共发现6种V3环顶端四肽类型，主要类型为GPGQ、GPGR，此外还有GLGR、GQGR、GPGK、GPGS。根据V3环的氨基酸分析可预测HIV-1辅助受体的使用情况，其中121份（77.6%）使用趋化因子受体5（chemokine reseptor，CCR5）作为辅助受体，没有可被预测为使用趋化因子受体4[chemokine（c-x-c matif）-receptor 4，CXCR4]为辅助受体的毒株，35份（22.4%）样本不能被预测。以bootstrap≥90%、基因距离≤0.045作为界定传播簇的参数，共形成16条传播簇，其中1条传播簇有9条序列。结论黑龙江省HIV-1流行株CRF01_AE V3环顶端四肽具有较大的变异性，大部分毒株呈现巨噬细胞嗜性。CRF01_AE毒株形成的传播簇规模较小，成簇序列数也仅达到四分之一。