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不同浓度HBV DNA和HIV-1 RNA对多重PCR检测HCV RNA的干扰验证分析 被引量:6
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作者 陈少彬 何子毅 +2 位作者 陈庆恺 刘泽民 王庆 《中国输血杂志》 CAS 2019年第10期992-996,共5页
目的探讨多重聚合酶链式反应(PCR)技术在献血者血液标本中不同浓度HBV DNA和(或)HIV-1 RNA对低浓度HCV RNA检测结果的影响。方法采用阴性血浆对HCV RNA标准物质、已定量的HBV DNA和HIV-1 RNA血浆进行稀释,配制成2种病毒或3种病毒的混合... 目的探讨多重聚合酶链式反应(PCR)技术在献血者血液标本中不同浓度HBV DNA和(或)HIV-1 RNA对低浓度HCV RNA检测结果的影响。方法采用阴性血浆对HCV RNA标准物质、已定量的HBV DNA和HIV-1 RNA血浆进行稀释,配制成2种病毒或3种病毒的混合液,HCV RNA浓度稳定在20.4 IU/mL[该PCR检测系统95%平均检测下限(LoD)的3倍],HBV DNA浓度为20 IU/mL、200 IU/mL、2000 IU/mL和(或)HIV-1 RNA浓度为50 copies/mL、500 copies/mL、5000 copies/mL的混合液,同时设置对照组(只有3×LoD的HCV RNA溶液),模拟献血者血液样本,分别在Roche Cobas s201核酸检测系统进行单检模式和混样模式(与5个阴性标本混合)至少检测20次,统计分析不同浓度病毒核酸检测Ct值差异以及单检模式与混检模式的漏检率。结果不同浓度HIV-1 RNA和(或)HBV DNA在单检模式下对HCV RNA检测的Ct值差异无统计学意义(P>0.05);HCV RNA在单检模式下的Ct值中位数36.60(36.20,37.10)明显低于混检模式的Ct值39.30(38.60,40.00)(P<0.05),10个分组中HCV RNA在单检模式的漏检率均为0%,而在混检模式的平均漏检率为12.62%,差异有统计学意义(P<0.05);此外,浓度20 IU/mL的HBV DNA进行单检的漏检率为7.55%,进行混检的漏检率为81.4%;50 copies/mL的HIV-1 RNA和20.4 IU/mL的HCV RNA在单检时漏检率为0%,而混检漏检率分别为28.57%和12.62%,差异有统计学意义(P<0.05)。结论不同浓度HBV DNA和HIV-1 RNA对多重PCR检测HCV RNA结果无影响,但弱阳性HCV RNA、HBV DNA和HIV-1 RNA标本在单检模式下的漏检率低于混检模式,为提高血液安全,血液核酸检测应尽可能采用单检模式。 展开更多
关键词 多重pcr 核酸检测 HCV RNA HBV dna hiv-1 RNA
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Evolution of Mother-to-Child HIV-1 Transmission Rate in Mali from 2009 to 2018
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作者 Alou Sanogo Mohamed Ag Baraïka +9 位作者 Maïga Aminata Demba Koita Mahamadou Abdou Mamadou Guindo Clémentine N’Diaye Fatoumata Namoudou Traoré Abdoulaye Bagayoko Youssouf Diallo Flabou Bougoudogo Ibrehima Guindo 《Advances in Microbiology》 CAS 2024年第5期256-267,共12页
Despite enormous efforts to achieve the goal of eliminating mother-to-child transmission of HIV-1, it remains a major challenge for many countries in sub-Saharan Africa, particularly Mali. Our objective is to assess c... Despite enormous efforts to achieve the goal of eliminating mother-to-child transmission of HIV-1, it remains a major challenge for many countries in sub-Saharan Africa, particularly Mali. Our objective is to assess changes in the rate of mother-to-child transmission of HIV-1. We conducted a cross-sectional study between January 1, 2009 to December 31, 2018 (10 years) of early diagnosis activity in newborns and children born to HIV-1-positive mothers at the National Institute for Public Health (INSP). The samples came from health and referral centers in mali. All samples were received at the Laboratory of Molecular Biology at the INSP. Proviral DNA extraction was performed from a blood spot sample with a Roche DNA kit, Cobas AmpliPrep/Cobas TaqMan HIV-1 qualitative Test, V2.0 (Roche Molecular System, Inc, USA) following the company procedures. Molecular diagnosis was performed using the same kits using an algorithm of three identical PCRs. The Epi Info version 7 software was used for data analysis with a significance threshold of 5%. A total of 10,714 samples of infants and children born to HIV-positive mothers were analyzed by PCR. Ninety-six percent of mothers were on ARV prophylaxis (AZT 3TC NVP and AZT NVP) and 60% of newborns received the same ARV prophylaxis. Of these children, 956 tested positive with an overall transmission rate of 8.92%, varying between 7.27% in 2009 and 08.01% in 2018. This rate was relatively low among children receiving prophylaxis at 2.04% and remained high for children who received breastfeeding at 5.62%. However, the transmission rate remains low for those who have benefited from mixed and artificial breastfeeding at 1.58% and 1.27% respectively. A significant proportion of children remained infected by their mothers during pregnancy, childbirth or breastfeeding. This study shows the importance of early diagnosis of HIV in children using molecular technology. 展开更多
关键词 Early Diagnosis Mothers-to-Child NEWBORNS pcr dna hiv-1
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对定量检测整合HIV-1 DNA的PCR方法的评价
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作者 万延民 《国外医学(预防.诊断.治疗用生物制品分册)》 2003年第6期278-278,共1页
关键词 定量检测 hiv-1 dna pcr方法 1型人类免疫缺陷病毒 基因整合
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利用PCR法检测HIV—1 DNA 被引量:1
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作者 宋海峰 郭莉莉 +1 位作者 孙中和 朱关福 《中国病毒学》 CSCD 1991年第4期324-328,共5页
通过比较多个HIV(人免疫缺陷病毒)分离株的核苷酸序列,我们选择膜基因上7373—7514位的一段保守区为目的片段合成了引物1(5′—AGCAGCAGGAAGCACTATGGGC—3′)和引物2(5′—CCAGACTGTGAGTTGCAACA—3′),并分别以质粒PⅢexE7和MT4-HIV-1 D... 通过比较多个HIV(人免疫缺陷病毒)分离株的核苷酸序列,我们选择膜基因上7373—7514位的一段保守区为目的片段合成了引物1(5′—AGCAGCAGGAAGCACTATGGGC—3′)和引物2(5′—CCAGACTGTGAGTTGCAACA—3′),并分别以质粒PⅢexE7和MT4-HIV-1 DNA,为模板进行了PCR反应及敏感性试验。结果表明,用PCR法可检测出1~10个质粒分子及1×10~6个细胞中一个感染细胞。因此我们推论,本法可应用于AIDS临床标本的检测。 展开更多
关键词 pcr hiv-1 检测 艾滋病毒dna
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扩增潜伏HIV-1 DNA序列实验方法的优化
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作者 王鹏飞 焦艳梅 +1 位作者 朱焕章 吴昊 《北京医学》 CAS 2010年第12期972-974,共3页
目的对PCR扩增潜伏HIV-1DNA序列的实验方法进行优化。方法收集30例经高效抗逆转录病毒治疗(HAART)6~12个月的HIV-1感染者抗凝血标本,分别从外周血单个核细胞(PBMC)和高度纯化的CD4+T细胞提取基因组DNA,巢式PCR扩增HIV-1env的C2-V5... 目的对PCR扩增潜伏HIV-1DNA序列的实验方法进行优化。方法收集30例经高效抗逆转录病毒治疗(HAART)6~12个月的HIV-1感染者抗凝血标本,分别从外周血单个核细胞(PBMC)和高度纯化的CD4+T细胞提取基因组DNA,巢式PCR扩增HIV-1env的C2-V5区,电泳检测扩增产物并进行DNA序列测定。结果同一患者PBMC纯化CD4+T细胞标本扩增HIV-1env基因C2-V5区的效率(93.3%)明显高于直接从PBMC标本扩增该目的片段的效率(10.0%)。结论 PBMC纯化CD4+T细胞后,再提取基因组DNA进行巢式PCR扩增,可提高扩增潜伏HIV-1DNA序列的效率。 展开更多
关键词 潜伏hiv-1 dna 巢式pcr CD4+T细胞 外周血单个核细胞
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应用定量PCR技术检测HIV-1逆转录环节的方法的建立
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作者 杨颖 陈勍 郭颖 《中国药理通讯》 2011年第2期91-92,共2页
HIV—1的逆转录作用是其正链RNA在逆转录酶催化下生成双链DNA的过程,是HIV-1复制的重要环节,现已成为抗HIV-1药物研究的重要靶点。本研究应用SYBRGreenI荧光定量PCR技术建立了检测HIV-1逆转录环节的评价方法,
关键词 荧光定量pcr技术 hiv-1复制 技术检测 逆转录 应用 hiv-1 双链dna 酶催化
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河南HIV感染者的HIV-1 B型株tat基因的克隆及序列分析
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作者 孙薏 徐勤枝 +4 位作者 李敬云 隋建丽 李韩平 吴松峰 周平坤 《生物技术通讯》 CAS 2005年第3期245-248,共4页
克隆河南人免疫缺陷病毒(HIV)感染者HIV-1B型株tat基因完整编码框序列,并分析比较其编码产物的序列结构特点。使用重叠PCR技术,从河南省1名HIV-1感染者外周血标本中扩增出tat基因第一和第二外显子并重组为完整的tat基因序列。获得的HIV... 克隆河南人免疫缺陷病毒(HIV)感染者HIV-1B型株tat基因完整编码框序列,并分析比较其编码产物的序列结构特点。使用重叠PCR技术,从河南省1名HIV-1感染者外周血标本中扩增出tat基因第一和第二外显子并重组为完整的tat基因序列。获得的HIV-1B病毒株tat基因,第一外显子为263bp,第二外显子为214bp。将该基因编码产物与其他HIV-1株Tat蛋白经DNA软件编辑并翻译成蛋白质,使用ClustalX1.81进行多序列对比分析发现,第一外显子编码产物的3个保守区域的氨基酸组成大致相同,只有少数氨基酸存在差异。由于Tat蛋白不同病毒株间有高度保守的Cys富集区、核心区和碱性氨基酸富集区,tat基因的克隆为研究其功能并以其为靶点设计和筛选抗艾滋病的药物奠定了基础。 展开更多
关键词 hiv-1 tat 序列分析 克隆 感染 B型 人免疫缺陷病毒 第二外显子 TAT蛋白 pcr技术 氨基酸组成 碱性氨基酸 结构特点 分析比较 基因序列 软件编辑 基因编码 对比分析 病毒株 富集区 产物 外周血 河南省 蛋白质 dna 保守区
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High level HIV-1 DNA concentrations in brain tissues differentiate patients with post-HAART AIDS dementia complex or cardiovascular disease from those with AIDS 被引量:3
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作者 GALLIGAN Derek C. LAMERS Susanna L. +3 位作者 YU Stephanie SHAGRUN Lamia SALEMI Marco MCGRATH Michael S. 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2009年第7期651-656,共6页
Highly active antiretroviral treatment(HAART) has had a significant impact on survival of individuals with acquired immunodeficiency syndrome(AIDS);however,with the longer life-span of patients with AIDS,there is incr... Highly active antiretroviral treatment(HAART) has had a significant impact on survival of individuals with acquired immunodeficiency syndrome(AIDS);however,with the longer life-span of patients with AIDS,there is increasing prevalence of AIDS dementia complex(ADC) and other non-AIDS-defining illness,and cardiovascular diseases(CVD) are also common.The influence of these varied disease processes on HIV-1 DNA concentration in brain tissues has not been thoroughly assessed in the post-HAART era.The purpose of the current study is to clarify the impacts of ADC and other complications of HIV disease on the viral load in the brains in AIDS patients with post-HARRT.We examined autopsy specimens from the brains of thirteen patients who died from complications of AIDS with quantitative polymerase chain reaction(QPCR).All but one patient had received HAART prior to death since 1995.Two patients died with severe CVD,multiple cerebrovascular atherosclerosis(CVA) throughout the brain and five patients died with ADC.Six patients had no ADC/CVA.A QPCR was used to measure the presence of HIV-1 DNA in six brain tissues(meninges,frontal grey matter,frontal white matter,temporal subcortex,cerebellum and basal ganglia).In the post-HARRT era,for non-ADC/CVA patients,HIV-1 DNA concentration in brain tissues was statistically higher than that in patients with ADC.In a new finding,two patients who suffered from severe CVD,especially CVA,also had high concentrations of HIV-1 in brain compartments not showing ADC related changes.To our knowledge,this is the first report of a relationship between the CVA and HIV-1 viral burden in brain.The current observations suggest that HAART-resistant HIV reservoirs may survive within ADC lesions of the brain as well as the macrophage rich atherosclerosis,which needs to be confirmed by more AIDS cases with CVA. 展开更多
关键词 hiv-1 AIDS dementia complex quantitative pcr dna cardiovascular disease CEREBROVASCULAR atherosclerosis
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广西壮族人群HIV协同受体CCR5基因突变的检测 被引量:4
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作者 杨海波 樊晓晖 +2 位作者 陆海融 赖振屏 梁纲 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期251-253,共3页
目的了解广西壮族人群中HIV协同受体CCR5△32等位基因突变频率和多态性的特点,为评估广西壮族人群对HIV的遗传易感性和艾滋病的防治提供理论依据。方法以152例壮族大学生为研究对象,应用PCR和DNA直接测序等方法检测CCR5及CCR5△32突变... 目的了解广西壮族人群中HIV协同受体CCR5△32等位基因突变频率和多态性的特点,为评估广西壮族人群对HIV的遗传易感性和艾滋病的防治提供理论依据。方法以152例壮族大学生为研究对象,应用PCR和DNA直接测序等方法检测CCR5及CCR5△32突变体。结果未发现CCR5△32等位基因。结论由于未发现CCR5△32,推测广西壮族人群对HIV-1病毒感染可能具有较大的遗传易感性。 展开更多
关键词 广西壮族人群 HIV协同受体 CCR5基因突变 CCR5△32 检测 dna直接测序 遗传易感性 基因突变频率 壮族大学生 hiv-1 研究对象 等位基因 病毒感染 未发现 多态性 艾滋病 突变体 pcr
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