鹅流感病毒2/96-H_5N_1亚型毒株RNA_(1-3)及RNA_5节段核苷酸全序测定

目的 明确广东鹅流感病毒２９６Ｈ５ Ｎ１ 亚型毒株ＲＮＡ１３ 和ＲＮＡ５ 节段核苷酸全序列及其所编码蛋白的氨基酸序列，以及这些基因节段与香港禽流感病毒１５６９７Ｈ５ Ｎ１ 亚型毒株相应节段间的关系。方法 病毒粒ＲＮＡ经逆转录合成ｃＤＮＡ，经聚合酶链反应（ＰＣＲ） 扩增，产物纯化，采用双脱氧链末端终止法进行核苷酸序列测定。结果 广东鹅流感病毒２９６Ｈ５ Ｎ１ 亚型毒株ＲＮＡ１３ 和ＲＮＡ５ 节段长度分别为２３４１，２ ３４１ ，２ ２３３ 和１５６５ 个核苷酸。它们分别编码ＰＢ２（ 含７５９ 个氨基酸），ＰＢ１（ 含７５７个氨基酸） ，ＰＡ（ 含７１６ 个氨基酸） 和ＮＰ蛋白（ 含４９８ 个核苷酸） 。这些蛋白与香港禽流感病毒１５６９７Ｈ５ Ｎ１ 亚型毒株相应蛋白氨基酸序列的同源性分别为９６－４％ ，９７－２％ ，９７－３ ％ 和９７－０％ 。结论 本毒株ＲＮＡ１３ 和ＲＮＡ５ 节段长度分别为２ ３４１，２ ３４１，２ ２３３ 和１ ５６５ 个核苷酸，它们与香港１５６９７Ｈ５ Ｎ１