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中国汉族个体HLA全长序列新等位基因A*74:02:01:02的鉴定
1
作者
聂冬梅
徐筠娉
《国际输血及血液学杂志》
CAS
2012年第6期490-494,共5页
目的对中国汉族个体人类白细胞抗原(HLA)-A基因全长序列进行测定,发现和鉴定突变位于常规检测区域以外的全长序列新等位基因。方法应用已对常规检测区域第2~4外显子进行测序分型、结果已知的中国汉族个体的样本进行HLA—A基因全长4...
目的对中国汉族个体人类白细胞抗原(HLA)-A基因全长序列进行测定,发现和鉴定突变位于常规检测区域以外的全长序列新等位基因。方法应用已对常规检测区域第2~4外显子进行测序分型、结果已知的中国汉族个体的样本进行HLA—A基因全长4.3kb序列的高保真扩增、克隆及测序;利用序列比对、进化树等方法分析突变所在位置及其产生的原因。结果发现1个HLA—A全长序列新等位基因,序列与国际IMGT/HLA数据库中最接近的等位基因A*74:02:01:01的全长序列相比共有5个位于内含子的变异,其中第3内含子1个:NT1427C〉T,第7内含子5个,分别为NT2842G〉A,NT2850C〉T,NT2862T〉C,NT2863G〉A以及NT2868T〉C。该HLA—A新等位基因于2010—07—31被世界卫生组织人类白细胞抗原因子命名委员会正式命名为HLA—A*74:02:01:02。结论新等位基因A*74:02:01:02的变异产生的机制可能是随机突变和等位基因之间的交换重组。
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关键词
人类白细胞抗原
hla—a全长序列
克隆测序
内含子
新等位基因
原文传递
题名
中国汉族个体HLA全长序列新等位基因A*74:02:01:02的鉴定
1
作者
聂冬梅
徐筠娉
机构
深圳市血液中心深圳市组织配型与免疫遗传重点实验室
出处
《国际输血及血液学杂志》
CAS
2012年第6期490-494,共5页
基金
广东省自然科学基金资助项目(编号:9451803501004124)
文摘
目的对中国汉族个体人类白细胞抗原(HLA)-A基因全长序列进行测定,发现和鉴定突变位于常规检测区域以外的全长序列新等位基因。方法应用已对常规检测区域第2~4外显子进行测序分型、结果已知的中国汉族个体的样本进行HLA—A基因全长4.3kb序列的高保真扩增、克隆及测序;利用序列比对、进化树等方法分析突变所在位置及其产生的原因。结果发现1个HLA—A全长序列新等位基因,序列与国际IMGT/HLA数据库中最接近的等位基因A*74:02:01:01的全长序列相比共有5个位于内含子的变异,其中第3内含子1个:NT1427C〉T,第7内含子5个,分别为NT2842G〉A,NT2850C〉T,NT2862T〉C,NT2863G〉A以及NT2868T〉C。该HLA—A新等位基因于2010—07—31被世界卫生组织人类白细胞抗原因子命名委员会正式命名为HLA—A*74:02:01:02。结论新等位基因A*74:02:01:02的变异产生的机制可能是随机突变和等位基因之间的交换重组。
关键词
人类白细胞抗原
hla—a全长序列
克隆测序
内含子
新等位基因
Keywords
human leukoeyte antigen
genomie full-length of H LA-A
cloning
sequencing
introns
novel allele
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
中国汉族个体HLA全长序列新等位基因A*74:02:01:02的鉴定
聂冬梅
徐筠娉
《国际输血及血液学杂志》
CAS
2012
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