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中国汉族个体HLA-Ⅰ类基因全长序列鉴定及多态性比较 被引量:2
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作者 徐筠娉 何柳媚 +4 位作者 李桢 高素青 王大明 邹红岩 邓志辉 《中国输血杂志》 CAS 北大核心 2015年第3期243-251,共9页
目的鉴定中国汉族个体HLA-Ⅰ类3个基因座-A、-B、-C的全长序列并比较其各亚区多态性。方法利用前期已建立的HLA-Ⅰ类基因3.7-4.5 kb全长序列高保真扩增、克隆及步移测序方法,从业已经过HLA高分辨测序分型、结果已知的1 000(人)份中国汉... 目的鉴定中国汉族个体HLA-Ⅰ类3个基因座-A、-B、-C的全长序列并比较其各亚区多态性。方法利用前期已建立的HLA-Ⅰ类基因3.7-4.5 kb全长序列高保真扩增、克隆及步移测序方法,从业已经过HLA高分辨测序分型、结果已知的1 000(人)份中国汉族造血干细胞捐献者的血样中,分别选择含HLA-A、-B、-C所有血清学家系等位基因的标本45、38、52份做序列鉴定与比较。结果共获得汉族个体HLA-Ⅰ类基因110条全长序列,包括38个HLA-A等位基因4.2 kb序列,30个HLA-B等位基因3.7 kb序列,以及42个HLA-C等位基因4.3-4.5 kb序列;所获110个等位基因的全长序列均提交Gen Bank及IMGT/HLA数据库,获得WHO命名委员会的命名,其中首次报道全长序列的等位基因有70个,包括新等位基因21个、修正序列的等位基因2个、5'-启动子序列及3'-UTR序列或内含子序列的等位基因47个,其他40个等位基因均在5'-启动子及3'-UTR区,延伸了IMGT/HLA数据库中释放发布的全长序列。结论 1)所鉴定的全长序列可为HLA-Ⅰ类基因测序分型引物和探针的正确设计、HLA基因表达调控、分子进化及疾病关联等研究,提供详实的基础资料和信息;2)中国汉族个体HLA-C基因的第2、3外显子及3'-UTR区,与HLA-A、-B相应区域比较,其全长序列多态性水平及分布较独特,暗示HLA-C基因免疫学功能的独特性。 展开更多
关键词 hla-基因 基因组全长序列 多态性 中国汉族 克隆测序 调控区
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人群HBV易感性与HLA-Ⅰ、Ⅱ类基因相关性研究 被引量:2
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作者 李建忠 李长缨 《预防医学论坛》 2007年第4期314-316,共3页
[目的]探讨人类白细胞抗原Ⅰ、Ⅱ类基因与乙型肝炎病毒(HBV)感染的相关性。[方法]2003~2004年,采用PCR-SSP方法对青岛市178例HBV感染者(实验组)和1383名无血缘关系的自愿骨髓捐献者(对照组)分别进行HLA-Ⅰ、Ⅱ类基因分型检测。... [目的]探讨人类白细胞抗原Ⅰ、Ⅱ类基因与乙型肝炎病毒(HBV)感染的相关性。[方法]2003~2004年,采用PCR-SSP方法对青岛市178例HBV感染者(实验组)和1383名无血缘关系的自愿骨髓捐献者(对照组)分别进行HLA-Ⅰ、Ⅱ类基因分型检测。[结果]HLA-DR9、DR12的分布频率在实验组为30.9%(55/178)和28.0%(50/178),在对照组为20.7%(286/1383)和19.5%(270/1383)(P〈0.01)。[结论]HLA—DR9、DR12有助于HBV对宿主的感染,可能是HBV的易感基因。 展开更多
关键词 HBV 感染 hla-基因 hla-Ⅱ类基因 hla-DR9 HLA—DR12
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HLA-A、B、C基因第二外显子的单链构象多态性分析及骨髓移植受供者基因配型 被引量:1
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作者 李丹 刘海燕 +2 位作者 于妍 王申五 陆道培 《中国实验血液学杂志》 CAS CSCD 1996年第1期96-100,共5页
用与HLA-A、B、C座位第二外显子两末端稳定部位互补的,对引物扩增基因组DNA得到HLA-A、B、C三座位的第二外显子包含高变区在内的196bp片断,进行单链构象多态性分析。以此检测HLA-Ⅰ类基因多态性的一致性,为20例骨髓移植供受者对配型,其... 用与HLA-A、B、C座位第二外显子两末端稳定部位互补的,对引物扩增基因组DNA得到HLA-A、B、C三座位的第二外显子包含高变区在内的196bp片断,进行单链构象多态性分析。以此检测HLA-Ⅰ类基因多态性的一致性,为20例骨髓移植供受者对配型,其中11对相合,9对不合。与其它配型结果比较表明,HLA-Ⅰ类基因的聚合酶链反应一单链构象多态性(PCR-SSCP)配型在区分同胞供受者Ⅰ类抗原多态性上有较高的灵敏度。 展开更多
关键词 聚合酶链反应 单链构象多态性 hla-基因
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HLA class Ⅰ expression in primary hepatocellular carcinoma 被引量:33
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作者 Jian Huang Mei-Ying Cai Da-Peng Wei Immunology Department,West China University of Medical Sciences,Chengdu 610044,Sichuan Province,China 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 2002年第4期654-657,共4页
AIM:To investigate whetherCTL vaccine therapy is suitable for primary hepatocellular carcinoma(HCC)from the viewpoint of HLA classIantigens expression.METHODS:The immunocytochemistry,image analysis,flow cytometry,and... AIM:To investigate whetherCTL vaccine therapy is suitable for primary hepatocellular carcinoma(HCC)from the viewpoint of HLA classIantigens expression.METHODS:The immunocytochemistry,image analysis,flow cytometry,and labeled streptavidin bioti(LSAB)method of immunohistochemistry were applied respectively to study 4HCCcell lines(e.g.Alexander,HepG2,SMMC-7721,andQGY-7703)cultured in vitro and 6frozen tissue specimens of HCC.RESULTS:The positive control cell line Raji had very strong positive staining,Most mitotic and nonmitotic cells of the 4HCCcell lines had various intensity of HLAclassⅠantigens expression.The negative control cell K562 and the control slides of all the cell lines had no positive staining,In the 6HCCspecimens immunohistochemically studied,histological normal hepatocytes had no or very weak positive staining and the liver sinus had very strong positive staining.Most HCCcells in the sections from the 6HCCspecimens had strong positive HLAclassⅠantigens staining.The positive staining was located in the cytoplasm,the perinuclear area,and at the cell membrane of the liver cancer cells.Flow cytometry also revealed that Raji and those 4HCCcell lines had strong HLAclassⅠantigens expression.which was confirmed quantitatively by the image analysis.It showed that the objective grayscale values of Raji and those 4HCCcell lines were significantly different from that of K562(Raji114.04±10.94,Alexander165.97±5.35,HepG2167.02±12.60,QGY-7703161.46±7.13,SMMC-7721 165.93±5.21,K562244.89±4.60,P<0.01).Significant differences were also found ebtween Raji and the 4HCCcell lines.CONCLUSION:HCC cells express HLA classI antigens strongly,Fromthis point of view.the active specific immunotherapy of CTL vaccine is suitable and practicable for HCC. 展开更多
关键词 原发性肝癌 hla-ⅰ基因 基因表达 免疫组织化学 临床意义
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应用下一代测序技术进行HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可结果情况分析 被引量:4
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作者 董丽娜 赵烁贤 +3 位作者 王芳 章伟 何吉 朱发明 《中国卫生检验杂志》 CAS 2019年第16期1924-1927,1931,共5页
目的统计分析NGS法进行HLA-A、HLA-B基因分型检测的模棱两可结果的种类、比例。方法对369例浙江省脐带血库标本采用NGS法检测HLA-A、HLA-B位点,并同步对其中94例标本采用PCR-SBT测序法测定HLA-A、HLA-B位点,余下275例标本采用PCR-SSO流... 目的统计分析NGS法进行HLA-A、HLA-B基因分型检测的模棱两可结果的种类、比例。方法对369例浙江省脐带血库标本采用NGS法检测HLA-A、HLA-B位点,并同步对其中94例标本采用PCR-SBT测序法测定HLA-A、HLA-B位点,余下275例标本采用PCR-SSO流式磁珠法检测。使用专业软件指定NGS法的HLA-A、HLA-B分型结果,直接计算法分析模棱两可组合比例。结果所有标本NGS法检测结果与PCR-SBT法或PCR-SSO法相符合,未发现NGS法遗漏等位基因情况。NGS法以HLA-A、HLA-B命名*后第四区域的数字作为高分辨水平统计,369例有34例标本出现模棱两可结果,占9.21%(34/369),其中只有2例标本HLA-A、HLA-B位点同时存在模棱两可结果。HLA-A位点有9例标本存在模棱两可结果,表现出8种类型;HLA-B位点有27例,25种类型,分别占标本总数的2.44%(9/369)、7.32%(27/369)。结论应用NGS技术仍有少量HLA-A、HLA-B基因分型的模棱两可组合结果。 展开更多
关键词 下一代测序法 hla-基因 模棱两可 测序分析
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