中国多表位疫苗设计的HLA-Ⅰ积累表型频率空间预测系统(英文)

目的 建立HLA Ⅰ积累表型频率(CPF)的空间预测系统,旨在指导中国疫苗学家设计受HLA限制的多表位疫苗(包括DNA疫苗) ,并评价或预测根据不同HLA Ⅰ组合形式设计的多表位疫苗(或DNA疫苗)在中国不同地区的免疫效果。方法 通过构建中国境内人群HLA Ⅰ基因空间数据库,利用“克立格”技术建立CPF空间预测系统。结果 根据疫苗设计目的,设计者可利用该系统预测和估计特定地理位置上人群的CPF ,包括根据单个HLA座位(HLA A或HLA B)上的等位基因而设计的多表位疫苗和根据两个HLA基因座位(HLA A和HLA B)上的等位基因而设计的多表位疫苗在特定地理位置上人群的CPF值,从而估计或预测拟研制的或已研制的多表位疫苗在中国不同地理位置上人群中的免疫效果。结论 该预测系统可用于:①鉴别任何中国群体的期望CPF百分比,为设计疫苗组分提供依据;②在特定地理位置的人群中,预测限制性表位已知的多表位疫苗的理论免疫应答率;③在特定地理位置的人群中,识别因缺乏HLA Ⅰ限制性等位基因而不能对表位疫苗产生免疫应答的个体。

现有乙型肝炎多表位疫苗在中国人群中的理论免疫效果评价

目的预测现有乙型肝炎(HBV)多表位疫苗在中国的理论免疫应答率,并做出评价。方法利用"中国多表位疫苗设计的HLA-Ⅰ积累表型频率空间预测系统"计算现有的HBV表位DNA疫苗所涉及的HLA-A、B限制性表位组合在中国人群中的累积表型频率(CPF),得出理论免疫应答率,并绘制CPF预测等值线图,给出评价。结果现有各HBV多表位疫苗对中国人群的理论免疫应答率偏低,仅较多表位组合的疫苗理论免疫应答率高。现有HBV多表位疫苗存在不同方面的问题:大部分此类疫苗对中国人群的理论免疫应答率低;少数此类疫苗理论免疫应答率高,但为较多表位的组合,不符合多表位疫苗设计的原则,并没有用最少的表位组合达到最高的免疫应答率。结论现有的几种主要的HBV多表位疫苗并不能较好地符合中国人群的特点,效果不佳。

基于GIS的中国人群乙肝多表位疫苗的预测

目的预测可能的HLA-Ⅰ类限制性HBV特异性CTL表位组合在中国人群的理论免疫应答率,旨在指导乙型肝炎(HBV)多表位疫苗的研制和应用。方法利用"中国多表位疫苗设计的HLA-Ⅰ积累表型频率空间预测系统"计算HLA-A、B限制性HBV特异性CTL表位组合在中国人群中的累积表型频率(CPF),得出理论免疫应答率,并绘制CPF预测等值线图,比较结果。结果HLA-A或B单一超型组合针对中国人群的理论免疫应答率普遍偏低。HLA-A和B超型组合针对中国人群的理论免疫应答率相对较好。结论根据不同HLA组分组合设计的多表位疫苗(或DNA疫苗)在中国各地人群中的免疫效果不同,根据中国人HLA分布特点,进行疫苗理论免疫应答率预测研究,可以指导制备适合中国人群的HBV特异性CTL多表位疫苗,应用前景广阔,有重要的指导意义。