新等位基因HLA-B^＊9537的确认和序列分析

目的识别并确认1个新的HLA等位基因。方法应用PCR-SSO,PCR-SSP基因分型技术对1份临床样本做HLA分型,对可能的HLA新等位基因进行分子克隆和DNA测序,分析与最同源的B*1504的差异。结果得到1份样本的序列与已知的所有HLA-B等位基因序列不一致,与B*1504的差异表现在第3外显子区域中的379G>C,409C>T,412G>A,419C>T,导致氨基酸分别由谷氨酸→天冬氨酸(E103D),苏氨酸→赖氨酸(T113K),谷氨酰胺→谷氨酸(Q114E)和丝氨酸→苯氨酸(S116F)。结论该基因为HLA-B位点的1个新等位基因。

新等位基因HLA-B^＊5413的确认

目的确认1个新的等位基因HLA-B*5413。方法应用PCR-SSP技术作HLA分型检测;PCR-SS0技术作HLA分型复核;DNA测序技术进行新等位基因的核苷酸序列测定,在NCBI和EBI基因数据库上进行基因序列比对分析验证,最后提交。结果新等位基因与所有已知的HLA-B位点的等位基因的序列均不相同,与同源性最高的HLA-B*5401相比,在第2外显子上有6个核苷酸差异:第229位置上G>A,导致第77位Ser>Asn,第238位置上A>T,导致第80位Asn>Ile,第240、241位置上C>G、T>C导致第81位Leu>Ala,第244位置上G>T,导致第82位Arg>Leu,第246位置上G>C导致第83位Gly>Arg。结论2007年4月世界卫生组织HLA新基因命名委员会正式将这例新基因命名为HLA-B*5413。

中国汉族人群HLA-B^＊40组的多态性研究

为了研究中国汉族人群HLA-B*40等位基因的分布特点,探讨其可能对临床供者选择的影响,从中华骨 髓库深圳分库中随机抽取381名志愿供者,用PCR-SSO方法进行HLA-B基因分型;另从已分型的1 270例供者中 选出低分辨率结果为B*40纯合子的样本。所有B*40阳性标本采用PCR-SBT及PCR-SSP方法进行高分辨率分 型。结果表明:随机抽取的381例样本通过Hardy-Weinberg平衡检验,HLA-B*40的基因频率为0.1692。在实验 中仅检测到B*4001,B*4002,B*4003,B*4006,其血清学特异性分属B60,B61。各等位基因相对频率B*4001为 0.1192.B*4002为0.0154,B*4003为0.0038,B*4006为0.0308。B*40纯合子在高分辨水平上检测,其等位基因 表现出一定的规律性,低分辨结果为B*40XX(B*4001组),-,高分辨都是B*4001;低分辨为B*40XX(B*4002 组),一,高分辨则为B*4002或B*4006或二者杂合子。结论:中国汉族人群B*40基因家族中B*4001占绝对优 势。为了选择最适供者,建议临床配型中使用高分辨率基因分型。

四川骨髓库汉族人群HLA-B^＊15等位基因分布

目的采用聚合酶链反应-序列分析基础上的HLA分型(polymerase chain reaction-sequence based typ-ing,PCR-SBT)方法,研究中国造血干细胞捐献者资料库(以下简称为中华骨髓库,CMDP)四川分库中四川籍汉族人群HLA-B*15组等位基因的分布特点。方法从四川骨髓分库中汉族人群中/低分辨分型HLA-B*15阳性样本中按不同血清学特异性分层抽取107例样本,应用PCR-SBT技术进行测序分型,获得四川籍汉族人群B*15组高分辨分型结果。应用方根法计算HLA-B*15各等位基因频率,同时与其他人群资料进行比较。结果共检测到16种已知HLA-B*15等位基因和1例未知等位基因。本研究中检出的16种等位基因有:B*15010101(B62),B*1502(B75),B*1503(B72),B*1505(B62),B*1507(B62),B*151101(B75),B*1512(B76),B*1513(B77),B*1517(B63),B*1518(B71),B*1525(B62),B*1527(B62),B*1529(B15),B*1532(B62),B*1546(B72),B*1558(B62)。其中以B*1502(36.2%)最常见,其次为B*15010101(21.6%),B*151101(9.5%),B*1518(6.9%),B*1525(6.0%),这5种等位基因占B*15等位基因家族的80%。在B*15等位基因家族中,表达B75抗原的等位基因B*1502和B*151101共占45.7%,但表达B62抗原的B*15等位基因多态性最强,共检出7种等位基因。此外,本研究发现1例未知等位基因,该等基因序列与目前所有已知的B*15或B*46等位基因序列均不相同,在外显子3的116位处存在1个点突变C->T。结论研究表明在四川籍汉族人群中HLA-B*15等位基因水平表现出丰富的多态性和特有的分布特征。

江苏地区骨髓库志愿者HLA-B^＊15组基因多态性研究及临床意义

目的:调查江苏骨髓库志愿者HLA-B*15等位基因的分布特征,研究其可能对临床供体选择的影响以及相关疾病。方法:利用聚合酶链反应-碱基序列直接测序(PCR-SBT)方法对3 238例江苏人群HLA-B位点的2、3、4外显子序列进行分型,计算HLA-B*15等位基因频率,并与不同人群进行比较。结果:本研究中检出的21种HLA-B*15等位基因有:B*1501(B62),B*1502(B75),B*1503(B72),B*1505(B62),B*1507(B62),B*1508(B75),B*1510(B71),B*1511(B75),B*1512(B76),B*1513(B77),B*1517(B63),B*1518(B71),B*1521(B75),B*1525(B62),B*1527(B62),B*1529(B15),B*1532(B62),B*1535(B62),B*1546(B72),B*1558(B62),B*1568(B35)。其中以B*1501(4.69%)最常见,其次为B*1511(2.55%),B*1502(2.10%),B*1518(1.34%),B*1527(1.27%)。结论:在江苏汉族人群中HLA-B*15等位基因水平表现出丰富的多态性,利用其分布特点,为临床移植供者选择和HLA相关疾病分析提供了依据。

序列分析鉴定新等位基因HLA-B^＊1316

目的分析鉴定HLA-B位点的1个新等位基因。方法应用DNA序列分析常规PCR-SSO基因分型时发现的疑似HLA新等位基因,确认与同源性最高的HLA等位基因序列的差异。结果发现1个HLA-B位点分型结果异常的样本,其核苷酸序列与已知所有HLA-B位点等位基因序列不一致,与同源性最高的等位基因B*1302的差异,是在第3外显子区域中的第184位碱基发生了T→A的替换,导致第62位密码子由GTG→GAG,其编码的氨基酸由缬氨酸→谷氨酸。结论确认了HLA-B位点的1个新等位基因,已被WHO HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*1316。

DNA序列分析鉴定HLA-B新等位基因HLA-B^＊4816

目的鉴定1个HLA-B位点新等位基因。方法应用PCR-SSO基因分型技术发现可能的HLA-B位点新等位基因,对PCR产物进行序列分析,确认与最同源的HLA等位基因序列的差异。结果发现一个样本的HLA-B位点结果异常,其核苷酸序列与已知所有HLA-B位点等位基因序列均不一致,与同源性最高的等位基因B*4801在第2外显子区域有1个碱基的差异:第187位碱基由A>T,这一突变使密码子63由GAG>GTG,导致编码的氨基酸由Glu>Val。结论该等位基因为HLA-B位点的一个新等位基因,2006年7月被WHO HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*4816。

湖北骨髓库汉族人群HLA-B^＊ 15多态性分析

目的检测湖北骨髓库汉族捐献者HLA-B*15高分辨基因型,了解其基因频率和基因多态性分布特点。方法采用PCR-SBT的分型技术,对3 325名汉族捐献者进行HLA-B高分辨基因分型;基于等位基因频率,采用Hierarchical Clustering算法对各人群进行聚类分析。结果 3 325例分型结果中,HLA-B分布符合Hardy-Weinberg平衡定律。共检出16种HLA-B*15等位基因和8种血清学特异性,基因频率排在前5位的是:B*15∶01(0.047 67),B*15∶02(0.045 56),B*15∶11(0.016 09),B*15∶18(0.009 92),B*15∶27(0.009 32)。在B*15等位基因家族中,表达B62抗原的B*15等位基因多态性最强,共检出7种等位基因,共占47.15%;表达B75抗原的等位基因B*1502、B*1511和B*1521共占41.85%。我国南方和北方汉族人群在基因频率上存在显著的差异。如等位基因B*15∶02的频率在北方和南方人群中分别为0.017 8和0.096 69。尽管湖北汉族与我国南方汉族聚为一族,但在基因频率上表现出从北到南的过渡形态。结论在湖北骨髓库汉族捐献者中HLA-B*15等位基因水平表现出丰富的多态性和特有的分布特征;湖北汉族具有典型的我国南北人群交流的特征。

美国发现携带HLA-B^＊ 5701基因的患者使用阿巴卡韦更易发生超敏反应

近期，美国FDA发布有关阿巴卡韦（商品名：Ziagen）和含阿巴卡韦药物的安全信息，称携带HLA-B^＊ 5701基因的患者使用阿巴卡韦时更易发生严重甚至致命的超敏反应。

HLA-B^(*)5801基因多态性检测用于预测别嘌醇相关重症药疹的快速卫生技术评估

目的对HLA-B^(*)5801基因多态性检测用于预测别嘌醇相关重症药疹的准确性、敏感度、特异度和经济性进行快速卫生技术评估,为临床决策提供循证依据。方法计算机检索PubMed、CochraneLibrary、WebofScience、Embase、WanFangData、CNKI数据库和卫生技术评估机构官方网站,搜集关于HLA-B^(*)5801基因多态性检测的卫生技术评估报告、系统评价/Meta分析和药物经济学研究,检索时限均从建库至2023年12月31日。由2名研究者独立筛选文献、提取资料和评价质量,对研究结果进行定性分析。结果共纳入文献16篇,包括系统评价/Meta分析5篇及药物经济学研究11篇。结果显示,出现重症药疹患者的HLA-B^(*)5801基因突变率显著高于别嘌醇耐受组(P<0.05)。2项研究报道了HLA-B^(*)5801基因多态性检测结果预测重症药疹的敏感度和特异度,敏感度分别为0.78、0.93,特异度分别为0.96、0.89。经济学研究显示,对于中国汉族、韩国、泰国等人群,在接受别嘌醇治疗前进行HLA-B^(*)5801基因多态性检测具有成本-效果优势,对于英国、美国(白种人或西班牙裔)、新加坡和马来西亚等人群则不具有成本-效果优势。结论我国汉族人群在接受别嘌醇治疗前进行HLA-B^(*)5801基因多态性检测并根据结果指导用药可以减少重症药疹风险,且能降低治疗成本。

闽南地区人群中HLA-B^＊1502基因频率的分析

目的了解闽南地区人群中心HLA-B^＊1502的基因频率，探讨筛查心HLA-B^＊1502的必要性。方法本研究选取268名需服用卡马西平的患者（癫痫患者211例，躁郁症患者33例及三叉神经痛患者24例）和100名健康人，从全血中提取DNA，采用实时荧光PCR技术（Real—time PCR）和碱基序列测序技术（SBT）对所有DNA样本进行测定。结果通过检测发现有7．07％的样本含有HLA-B^＊1502，其中，8．58％的患者及3．00％的健康人含有HLA-B^＊1502，在患者中HLA-B^＊1502的基因频率为0．043，在健康人中为0．015。PCR法与SBT法检测结果高度一致。结论闽南地区人群中HLA-B^＊1502的基因频率较高。因此，需服用卡马西平的患者在服药前有必要进行HLA-B^＊1502的筛查。

卡马西平引起重症药疹2例及相关基因HLA-B^＊1502的检测

目的探讨卡马西平引起重症药疹与HLA-B*1502等位基因是否存在相关性。方法收集因服用卡马西平引起严重皮疹的患者外周静脉血,利用引物序列特异性PCR(Polymerase chain reaction-sequence specific primer,PCR-SSP)检测HLA-B*1502等位基因。结果 2例患者的HLA-B*1502等位基因均为阳性。结论卡马西平引起重症药疹可能与HLA-B*1502等位基因存在相关性,建议必要时在用药前给予患者进行血液基因检测,以最大程度保障患者用药安全。

新疆不同民族癫痫患儿HLA-B^(*)1502基因多态性与芳香族ASMs诱导的皮肤不良反应相关性研究

目的比较新疆维吾尔族、汉族、哈萨克族癫痫患儿HLA-B^(*)1502等位基因携带率和等位基因频率差异,评估HLA-B^(*)1502阳性患儿使用芳香环类抗癫痫药物(ASMs)诱发皮肤不良反应的风险。方法回顾性收集2019年1月—2022年8月在我院就诊并在初次使用ASMs前采用荧光染色原位杂交测序技术检测HLA-B^(*)1502TA和HLAB^(*)1502TB基因型及用药指导的患儿460例,分析其基因型与皮肤型药物不良反应发生情况。结果维、汉、哈族癫痫患儿的HLA-B^(*)1502基因突变率分别为47.41%,41.57%和54.84%。哈萨克族癫痫患儿的HLA-B^(*)1502杂合突变型基因显著高于汉族患儿(P<0.05)。维、汉、哈族癫痫患儿的HLA-B^(*)1502野生型基因组的体重指数均显著高于突变组患儿(P<0.05)。247例HLA-B^(*)1502野生型患儿继续服用芳香族ASMs后未发生皮肤不良反应,12例HLA-B^(*)1502纯合突变型患儿调整为其他作用机制的ASMs,201例HLA-B^(*)1502杂合突变型患儿中仍有56例继续使用芳香族ASMs,有5例患儿在用药3周内发生了斑丘疹、Stevens-Johnson综合征、中毒性表皮坏死松解症。结论临床初次使用芳香族ASMs控制和治疗患儿癫痫发作过程中,有必要进行HLA-B^(*)1502基因检测。

HLA-B^(*)5801基因检测在别嘌醇严重过敏反应评价中的应用分析

目的汉族人群中HLA-B^(*)5801基因与别嘌醇严重过敏反应存在强相关性,分析我院HLA-B^(*)5801基因检测结果及其在别嘌醇临床应用情况,为减少别嘌醇不良反应提供参考。方法回顾性调查我院2017年1月1日~2017年12月31日进行HLA-B^(*)5801基因检测的住院患者临床资料,分析和评价基因检测结果应用情况。结果共纳入检测HLA-B^(*)5801基因患者55例,肾脏内科39例,皮肤性病科13例,内分泌科3例。检测结果阳性者17例(30.91%),阴性者38例(69.09%)。用药后出现皮肤不良反应的患者共13例,基因检测结果阳性11例,阴性2例。所有患者中有30例(54.55%)按照指南推荐在用药前检测了HLA-B^(*)5801基因。结论我院患者服药前按照指南检测HLA-B^(*)5801基因的比例偏低,药学部门应重视对临床别嘌醇用药监管。应提倡根据基因检测结果用药,减少药品不良反应发生风险。

宁波地区癫痫患者抗癫痫药物治疗中出现的皮疹与HLA-B^*1502、HLA-A^*3101基因的关系

目的探讨宁波地区HLA-B^*1502、HLA-A^*3101基因对抗癫痫药物奥卡西平(OXC)及卡马西平(CBZ)与皮疹发生的相关性。方法纳入103例局灶性癫痫患者,根据药物治疗所致皮肤不良反应(c ADRs)分为StevensJohnson综合征(SJS)组、多形性红斑(MPE)组和药物耐受组,检测3组HLA-B^*1502、HLA-A^*3101基因。结果7例患者出现SJS,其中HLA-B^*1502阳性5例,HLA-A^*3101阳性1例,HLA-B^*1511阳性1例。9例患者出现MPE,其中HLA-B^*1502阳性1例,HLA-A^*3101阳性3例。87例耐受者中HLA-B^*1502阳性5例,HLA-A^*3101阳性3例。SJS组HLA-B^*1502阳性率高于其余两组(均P<0.05),MPE组HLA-A^*3101阳性率高于药物耐受组(P<0.05)。结论宁波地区OXC或CBZ所致SJS与HLA-B^*1502密切相关,与HLA-A^*3101无明显相关;OXC或CBZ所致MPE与HLA-B^*1502无明显相关性,而与HLA-A^*3101相关。临床用药前完善基因检测是必要的,可减少严重皮疹的发生。

痛风性关节炎患者HLA-B^(*)5801基因型携带率及相关实验室指标分析

目的探讨痛风性关节炎(GA)患者HLA-B^(*)5801基因型的携带情况及其与相关实验室指标的关系。方法选取120例GA患者,检测HLA-B^(*)5801基因型及尿酸(UA)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)、碱性磷酸酶(ALP)、C反应蛋白(CRP)、中性粒细胞百分比、淋巴细胞百分比、嗜酸性粒细胞百分比(EO%)、平均血小板体积(MPV)、红细胞沉降率(ESR),计算中性粒细胞/淋巴细胞比值(NLR)及ALT/ALP比值。以50名体检健康者作为正常对照组。根据UA水平将120例GA患者分为低水平UA(UA<420μmol/L)组、中水平UA(UA为420~600μmol/L)组、高水平UA(UA>600μmol/L)组。采用Correl函数分析UA与其他项目之间的相关性。结果GA患者HLA-B^(*)5801基因型携带率为29.2%。GA组UA、NLR、EO%、CRP、ESR、ALT/ALP比值均高于正常对照组(P<0.05),MPV低于正常对照组(P<0.05)。HLA-B^(*)5801基因型携带组EO%、MPV高于非携带组(P<0.05),UA低于非携带组(P<0.05);2个组之间NLR、CRP、ESR、ALT/ALP比值差异均无统计学意义(P>0.05)。低水平UA组、中水平UA组、高水平UA组ALT/ALP比值依次升高(P<0.05);高水平UA组EO%高于中水平UA组(P<0.05),NLR和ESR高于中水平UA组和低水平UA组(P<0.05);3组之间MPV、CRP差异均无统计学意义(P>0.05)。NLR、ESR、ALT/ALP比值与UA均呈正相关(r值分别为0.959、0.953、0.994,P<0.05),MPV与UA呈负相关(r=-0.998,P<0.05),EO%、CRP与UA均无相关性(r值分别为0.647、0.091,P>0.05)。结论GA患者HLA-B^(*)5801基因型携带率较高。检测HLA-B^(*)5801基因型及相关实验室指标有助于综合评估GA患者的疾病状态。

痛风及高尿酸血症患者HLA-B^*5801基因携带情况及其与别嘌醇过敏反应间的相关性研究

目的调查南昌地区痛风及高尿酸血症患者HLA-B^*5801等位基因的携带情况,探讨其与别嘌醇过敏反应的相关性。方法对2018年6月至2019年1月在江西省人民医院就诊并服用别嘌醇的痛风及高尿酸血症患者进行分组,其中服用别嘌醇后发生过敏反应者(别嘌醇过敏组,11例)、服用别嘌醇6个月后未发生任何不良反应者(别嘌醇耐受组,21例)和未服用别嘌醇的痛风及高尿酸血症患者(对照组,80例)。取受试者外周静脉血,采用荧光定量PCR法检测其HLA-B^*5801等位基因,分析别嘌醇过敏与HLA-B^*5801等位基因之间的关联性。结果过敏组HLA-B^*5801等位基因阳性率为90.9%(10/11),耐受组为9.5%(2/21),对照组为13.8%(11/80),HLA-B^*5801等位基因阳性者发生过敏的风险显著高于阴性者(OR=95,95%CI:7.6~1180.3,P=0.000)。HLA-B^*5801等位基因检测预测别嘌醇致敏的敏感度及特异度分别为90.9%和90.5%。结论HLA-B^*5801等位基因与别嘌醇过敏具有相关性,患者服用别嘌醇前应检测HLA-B^*5801等位基因,可指导患者安全合理用药。

长治地区人群中HLA-B^(*)1502基因频率分析

目的:了解长治地区人群HLA-B*1502的基因频率,为以后研究山西地区该基因频率提供数据,并进一步探讨筛查HLA-B*1502基因的必要性。方法:选取347例需服用卡马西平的患者(糖尿病周围神经痛197例,癫痫78例,三叉神经痛53例,其他神经痛19例)为观察组,100名健康人为对照组。从全血中提取DNA,采用荧光聚合酶链式反应溶解曲线法(以下简称PCR法)和核酸序列测定技术(以下简称测序)对所有样本进行测定。结果:观察组(347个样本)中HLA-B*1502基因的基因频率为0.013,9例(2.59%)为HLA-B*1502基因阳性;对照组(100个样本)中HLA-B*1502基因的基因频率为0.015,3例(3.00%)为HLA-B*1502基因阳性。PCR法与测序法高度一致。结论:长治地区人群中的HLA-B*1502基因频率较中国大部分地区低,但在世界范围内属较高频率人群,对于需服用卡马西平的患者筛查HLA-B*1502基因是有必要的。

新疆维吾尔族癫痫儿童卡马西平致过敏反应与HLA-B^(*)1502基因型的相关性

目的探讨新疆阿克苏地区维吾尔族癫痫儿童中卡马西平所致的不良反应与HLA-B^(*)1502等位基因型的相关性。方法收集我院2017年1月至2019年12月住院或门诊选用卡马西平单药治疗的维吾尔族癫痫儿童患者100例,将服用卡马西平后2周内出现过敏反应的3例作为观察组,未出现过敏反应的97例作为对照组,采用聚合酶链反应-直接测序分型法进行HLA-B^(*)1502等位基因型测定。结果观察组HLA-B^(*)1502等位基因型阳性率为0。对照组HLA-B^(*)1502等位基因型阳性率为1.03%,基因频率0.005。两组差异无统计学意义(χ^(2)=0.031,P=1.000)。结论阿克苏地区维吾尔族癫痫儿童患者中,卡马西平引起过敏反应发生率较低,皮肤不良反应属于轻型过敏性皮疹,且未发现与HLA-B^(*)1502基因型有关。

别嘌醇致HLA-B^(*)58:01阴性的慢性肾病患者大疱性表皮松解坏死型药疹

报告别嘌醇致HLA-B^(*)58:01阴性的慢性肾病患者大疱性表皮松解坏死型药疹1例。患者女性,慢性肾脏病合并高尿酸血症。行HLA-B^(*)58:01基因检测,结果阴性。使用别嘌醇治疗,出现大疱性表皮松解坏死型药疹,予以停用别嘌醇以及血浆置换联合连续血液透析滤过、糖皮质激素抗炎治疗,患者病情好转。