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应用PCR-SSP方法分析部分中国南方汉族人群HLA-DQB1位点等位基因的多态性 被引量:1
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作者 罗一鲁 许婉华 +3 位作者 周琳 冯蝶仪 刘志辉 谭耀驹 《实用医学杂志》 CAS 2004年第11期1242-1243,共2页
目的 :检测和分析部分中国南方汉族人群HLA DQB1位点等位基因的多态性。方法 :应用聚合酶链反应 -序列特异性引物法 (PCR SSP)对 10 1名健康、无血缘关系的中国南方汉族人进行HLA DQB1分型。结果 :所检测的 8个HLA DQB1靶等位基因均有检... 目的 :检测和分析部分中国南方汉族人群HLA DQB1位点等位基因的多态性。方法 :应用聚合酶链反应 -序列特异性引物法 (PCR SSP)对 10 1名健康、无血缘关系的中国南方汉族人进行HLA DQB1分型。结果 :所检测的 8个HLA DQB1靶等位基因均有检出 ;频率最高的为DQ 2 ,3 (7,9) ,其等位基因频率 (GF)为 41 14 % ;最低的为DQ4,其GF为 7 19%。结论 :中国南方汉族人的HLA DQB1等位基因的分布具有民族和地域特征 ,与白人、黑人和日本人的HLA DQB1等位基因分布有差异。 展开更多
关键词 PCR-SSP方法 中国 南方 汉族 hla-dqb1位点 等位基因 基因多态性 基因分型
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小麦Glu-D1位点高分子量麦谷蛋白亚基对面条品质影响研究
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作者 张玉燕 周红伟 +4 位作者 叶皓炫 张晓科 郭波莉 赵海燕 张影全 《核农学报》 CAS 北大核心 2025年第1期88-95,共8页
小麦高分子量麦谷蛋白亚基(HMW-GSs)是影响面条产品质量的关键蛋白组分,其中Glu-D1位点编码的HMW-GSs对面团及面制品的品质贡献效应最大。为明确Glu-D1位点不同HMW-GS对3类主要面条产品品质的影响规律,本研究以小偃22遗传背景下Glu-D1位... 小麦高分子量麦谷蛋白亚基(HMW-GSs)是影响面条产品质量的关键蛋白组分,其中Glu-D1位点编码的HMW-GSs对面团及面制品的品质贡献效应最大。为明确Glu-D1位点不同HMW-GS对3类主要面条产品品质的影响规律,本研究以小偃22遗传背景下Glu-D1位点HMW-GSs分别为2+12、3+12、4+12和5+10的4个BC6F4代近等基因系为试验材料,系统研究比较了4种亚基对鲜湿面、挂面以及冷冻熟面品质的影响规律。结果表明,与其他亚基相比,含有3+12亚基的鲜湿面具有较好的烹调吸水率和较低的烹调损失率,同时硬度、弹性、回复性、咀嚼性等较好;含有3+12亚基的挂面最佳煮制时间短、烹调吸水率较高、烹调损失率较低,而含有2+12亚基的挂面硬度和咀嚼性适中、黏附性低、回复性较高;含有3+12和2+12亚基的冷冻熟面冻藏稳定性较好,含有3+12亚基的冷冻熟面硬度适中,咀嚼性较高,整体质构特性表现较好。本研究结果可为面条专用小麦品种选育、专用加工原粮选择、专用粉开发等提供参考。 展开更多
关键词 HMW-GS Glu-D1位点 鲜湿面 挂面 冷冻熟面
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环状RNA hsa_circ_0085576调控微小RNA-498/B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1轴对口腔鳞状细胞癌细胞迁移和侵袭的影响 被引量:1
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作者 李立恒 王蕊 +5 位作者 王晓明 张智轶 张璇 安峰 王芹 张凡 《国际口腔医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期60-67,共8页
目的探究环状RNA hsa_circ_0085576对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞迁移和侵袭的影响及其分子机制。方法使用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白印迹法检测OSCC细胞中hsa_circ_0085576、微小RNA-498(miR-498)以及B细胞特异性莫洛尼鼠... 目的探究环状RNA hsa_circ_0085576对口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞迁移和侵袭的影响及其分子机制。方法使用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)和蛋白印迹法检测OSCC细胞中hsa_circ_0085576、微小RNA-498(miR-498)以及B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1(BMI-1)的表达水平。使用CCK-8、划痕实验、Transwell实验以及qRT-PCR、蛋白印迹法分别检测SCC-15细胞增殖活力、迁移及侵袭能力以及相关基因和蛋白的相对表达量。结果OSCC细胞中hsa_circ_0085576与BMI-1表达上调,miR-498表达下调(P<0.05)。下调hsa_circ_0085576表达或过表达miR-498后SCC-15细胞的增殖活性、划痕愈合率、侵袭细胞数目以及细胞周期蛋白D1、波形蛋白表达水平下调,miR-498和E-钙黏蛋白表达水平上调(P<0.05);抑制miR-498表达可减弱下调hsa_circ_0085576表达对OSCC细胞增殖、迁移及侵袭的抑制作用;上调BMI-1表达可减弱过表达miR-498对OSCC细胞增殖、迁移及侵袭的抑制作用。结论下调hsa_circ_0085576表达可通过激活miR-498/BMI-1轴抑制OSCC细胞增殖、迁移及侵袭。 展开更多
关键词 环状RNA hsa_circ_0085576 微小RNA-498 B细胞特异性莫洛尼鼠白血病病毒整合位点1 口腔鳞状细胞癌
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BRCA1/2基因胚系变异意义未明位点的重新分析
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作者 方健飞 马政霄 +1 位作者 朱蕊 苏丹 《临床与实验病理学杂志》 CAS 北大核心 2024年第10期1041-1045,共5页
目的BRCA1/2基因胚系变异按照风险等级分为5类,其中3类意义未明位点(variants of the uncertain significance,VUS)需要定期复核。探索变异证据的更新对变异分类的影响并指导携带有害VUS位点的患者进行临床诊疗。方法收集971例进行了BRC... 目的BRCA1/2基因胚系变异按照风险等级分为5类,其中3类意义未明位点(variants of the uncertain significance,VUS)需要定期复核。探索变异证据的更新对变异分类的影响并指导携带有害VUS位点的患者进行临床诊疗。方法收集971例进行了BRCA1/2基因胚系检测的患者(乳腺或卵巢癌),筛选出VUS位点128个。整合人群频率数据库、疾病数据库、计算机软件预测、共分离证据、等位基因证据及人群队列研究等证据,重新分析这些VUS位点,明确变异分类是否发生改变。结果142例肿瘤患者携带BRCA1/2基因VUS位点,占14.6%(142/971),变异位点数为128个,其中错义突变、同义突变、框内非移码突变和非编码区突变的比例分别为70.3%、4.7%、3.1%、21.9%。重新复核分析发现11.7%(15/128)的VUS位点可降级为2类,疑似良性。结论随着胚系变异相关证据的不断更新,VUS位点经再次复核后变异分类可能会有所改变。 展开更多
关键词 BRCA1/2基因 胚系变异 意义未明位点
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HLA-DQA1*0501、HLA-DQB1*02基因多态性与抗Ro/SSA抗体阳性pSS易感性的关系分析
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作者 郑安昊 胡乃文 +5 位作者 许婧 袁烨 张淑敏 陈文斌 白艳艳 孙红胜 《山东医药》 CAS 2024年第6期44-48,共5页
目的基于数据库相关数据分析人类白细胞抗原(HLA)-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因多态性与抗Ro/SSA抗体阳性的原发性干燥综合征(pSS)易感性的关系。方法使用计算机检索相关数据库,筛选并收集pSS患者、抗Ro/SSA抗体阳性的pSS患者、抗Ro/SSA... 目的基于数据库相关数据分析人类白细胞抗原(HLA)-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因多态性与抗Ro/SSA抗体阳性的原发性干燥综合征(pSS)易感性的关系。方法使用计算机检索相关数据库,筛选并收集pSS患者、抗Ro/SSA抗体阳性的pSS患者、抗Ro/SSA抗体阴性的pSS患者以及健康对照人群的HLA-DQA1*0501、HLA-DQB1*02基因多态性资料。使用STATA 16.0(USA)统计软件分析抗Ro/SSA抗体阳性的pSS患者中HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因多态性与pSS发生的关系。结果纳入文献5篇,涉及420例pSS患者、250例抗Ro/SSA抗体阳性pSS患者、120例抗Ro/SSA抗体阴性的pSS患者和733例健康对照者。在pSS患者中,HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因阳性分别为159、246例;在健康对照者中,HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因阳性分别为196、282例;在抗SSA抗体阳性pSS患者中,HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因阳性分别为129、158例;在抗SSA抗体阴性pSS患者中,HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因阳性分别为30、46例。HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因多态性与pSS的易感性有关(I2分别为62.99%、40.75%,合计OR值分别为2.60、2.43,95%CI分别为1.49~4.55、1.88~3.14,P均<0.05)。HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因多态性也与抗Ro/SSA抗体阳性pSS的易感性有关(I2分别为0.00%、9.41%,合计OR值分别为3.85、2.61,95%CI分别为1.81~8.21、1.52~4.48,P均<0.05)。结论HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因多态性与抗Ro/SSA抗体阳性的pSS患者的易感性相关。具有HLA-DQA1*0501和HLA-DQB1*02基因阳性的抗Ro/SSA抗体阳性患者更容易患pSS。 展开更多
关键词 人类白细胞抗原 HLA-DQA1*0501基因 hla-dqb1*02基因 抗Ro/SSA自身抗体 原发性干燥综合征
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朝那鸡MC1R基因G274A和A427G多态位点与羽色性状的关联分析
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作者 杨雪瑶 蔡翠翠 +1 位作者 李玉莲 张恬 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第2期60-64,共5页
为了研究宁夏地方品种鸡朝那鸡的黑色素皮质激素1受体(melanocortin 1 receptor, MC1R)基因G274A和A427G多态位点与羽色性状的关联性,试验选择120日龄健康的朝那鸡150只(红羽、黑羽和白羽各50只)为试验对象,采用高分辨熔解曲线(high res... 为了研究宁夏地方品种鸡朝那鸡的黑色素皮质激素1受体(melanocortin 1 receptor, MC1R)基因G274A和A427G多态位点与羽色性状的关联性,试验选择120日龄健康的朝那鸡150只(红羽、黑羽和白羽各50只)为试验对象,采用高分辨熔解曲线(high resolution melting, HRM)分析技术对朝那鸡MC1R基因G274A和A427G位点进行基因型分型检测,并且对基因型和羽色性状进行了关联分析。结果表明:试验朝那鸡群体MC1R基因G274A位点有GG、GA、AA三种基因型,其中AA基因型个体数量最多,等位基因A为优势等位基因,多态信息含量(PIC)为0.286 7,表现为中度多态(0.25≤PIC≤0.50),说明MC1R基因位点为G274A的朝那鸡群体选育潜力较高;A427G位点有AA、AG两种基因型,其中AA基因型个体数量最多,等位基因A为优势等位基因,PIC为0.062 3,表现为低度多态(PIC<0.25),说明MC1R基因位点为A427G的朝那鸡群体选育潜力较低;这两个位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。G274A位点不同基因型间的羽色性状差异显著(P<0.05),黑羽群体中未发现GG基因型个体,红羽和白羽群体中GG基因型个体数量较GA、AA基因型个体少,AA基因型是红羽和黑羽群体中的优势基因型;A427G位点不同基因型间的羽色性状差异极显著(P<0.01),三个羽色群体中均未发现GG基因型个体,红羽群体均为AA基因型,黑羽和白羽群体中AA基因型个体数量较AG基因型多。说明MC1R基因这两个位点可作为朝那鸡羽色纯化的遗传标记应用于品种纯度鉴定和分子育种中。 展开更多
关键词 地方鸡种 朝那鸡 MC1R基因 G274A位点 A427G位点 羽色性状 关联分析
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急性心肌梗死中环状RNA CDR1as位点筛选的研究
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作者 唐赛赛 孙秀梅 +3 位作者 王海凤 许梦婷 林浩 李文勇 《大医生》 2024年第2期46-49,共4页
目的 探讨PubMed筛选文献、千人基金组计划(1 000 genomes project)、Haploview软件联合应用于筛选与心肌梗死相关的单核苷酸多态性的文献的可行性。方法 使用PubMed网站检索并确定心血管疾病相关基因,1 000 genomes project网站检索中... 目的 探讨PubMed筛选文献、千人基金组计划(1 000 genomes project)、Haploview软件联合应用于筛选与心肌梗死相关的单核苷酸多态性的文献的可行性。方法 使用PubMed网站检索并确定心血管疾病相关基因,1 000 genomes project网站检索中国汉族人群CDR1as基因的单核苷酸多态性(SNP)数据。应用Haploview软件以最小等位基因频率(MAF)>0.05、r2> 0.8作为筛选标签SNPs指标。结果 CDR1as基因41个SNPs位点筛选出3个检测位点,分别为rs12688274、rs5907638、rs76284232。结论 通过PubMed、千人基因组计划和Haploview联合使用可实现标签SNPs筛选,值得进一步探究。 展开更多
关键词 环状RNA CDR1as 心肌梗死 位点筛选
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5-HT1A基因C-1019G多态位点的研究进展
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作者 钟从杰 何泽明 +1 位作者 何震宇 潘伟 《生物过程》 2024年第3期166-173,共8页
5-HT1A基因编码5-羟色胺(血清素)的G蛋白偶联受体(属于5-羟色胺受体亚家族)。C-1019G多态位点是5-HT1A基因启动子区一个重要的功能性多态位点,人群中存在3种基因型即CC、CG、GG,它与个体的恋爱关系及抑郁症、焦虑症等精神疾病密切相关... 5-HT1A基因编码5-羟色胺(血清素)的G蛋白偶联受体(属于5-羟色胺受体亚家族)。C-1019G多态位点是5-HT1A基因启动子区一个重要的功能性多态位点,人群中存在3种基因型即CC、CG、GG,它与个体的恋爱关系及抑郁症、焦虑症等精神疾病密切相关。本文对5-HT1A基因C-1019G多态位点的相关机制、检测方法、研究进展等进行综述。The 5-HT1A gene encodes a G protein-coupled receptor for serotonin, which belongs to the 5-hydroxytryptamine receptor subfamily. C-1019G polymorphism is an important functional poly-morphism in the promoter region of 5-HT1A gene. There are three genotypes (CC, CG and GG) in the population, which are closely related to individual’s romantic relationship and mental disorders such as depression and anxiety. In this paper, the mechanism, detection methods and research progress of C-1019G polymorphism of 5-HT1A gene were reviewed. 展开更多
关键词 5-HT1A基因 C-1019G多态位点 基因分型
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德国牧羊犬RBFOX1基因SNP位点筛选及生物信息学分析
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作者 朱程程 程占军 +2 位作者 万宁 佘奕 李来有 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第13期98-104,110,114,115,共10页
为了深入认识德国牧羊犬RNA结合蛋白FOX1同源体1(RNA binding protein fox-1 homolog 1,RBFOX1)基因的基本信息,揭示德国牧羊犬RBFOX1基因遗传特征,试验采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,检测德国牧羊犬RBFOX1基因外显子区SNP位点,将... 为了深入认识德国牧羊犬RNA结合蛋白FOX1同源体1(RNA binding protein fox-1 homolog 1,RBFOX1)基因的基本信息,揭示德国牧羊犬RBFOX1基因遗传特征,试验采用DNA混合池扩增后直接测序的方法,检测德国牧羊犬RBFOX1基因外显子区SNP位点,将测序获得的序列翻译成氨基酸,利用生物信息学分析软件对该基因编码氨基酸序列进行生物信息学分析。结果表明:德国牧羊犬RBFOX1基因外显子1上存在1个SNP位点,为G988031C,该位点位于5′非翻译区(UTR)。G988031C位点使RBFOX1基因mRNA二级结构自由能升高。RBFOX1基因编码序列(CDS)区长度为1383 bp,共编码460个氨基酸,其分子量为49853.88 u,理论等电点为5.82;该基因编码的蛋白质是不稳定的亲水性蛋白,没有信号肽和跨膜结构域,有磷酸化位点和N-糖基化位点,主要定位于细胞核;蛋白质二级结构上含有23.26%的α-螺旋,17.83%的延伸链,7.61%的β-转角和51.30%的无规则卷曲;蛋白三级结构与二级结构基本一致。德国牧羊犬RBFOX1基因编码氨基酸序列与猫的遗传距离最近,与鸡的遗传距离最远。说明RBFOX1基因外显子区的突变可能与德国牧羊犬攻击行为相关,其突变位点有可能成为德国牧羊犬攻击行为选育的分子标记。 展开更多
关键词 德国牧羊犬 RBFOX1基因 SNP位点 生物信息学 遗传距离
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莲房原花青素B1分子结构及反应活性位点的量子化学研究
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作者 唐海飞 《广东化工》 CAS 2024年第22期57-59,共3页
目的:预测原花青素B1分子结构及反应活性位点,为明确原花青素B1分子水平药物作用机理、开发原花青素B1人工合成类似物及拓宽莲房资源的利用范围提供重要参考;方法:基于量子化学密度泛函理论,采用Gaussian16软件计算得到原花青素B1分子... 目的:预测原花青素B1分子结构及反应活性位点,为明确原花青素B1分子水平药物作用机理、开发原花青素B1人工合成类似物及拓宽莲房资源的利用范围提供重要参考;方法:基于量子化学密度泛函理论,采用Gaussian16软件计算得到原花青素B1分子稳定结构,再利用Multiwfn 3.8软件对分子表面静电势、原子电荷、前线分子轨道进行计算分析;结果:原花青素B1分子酚羟基O(21)原子附近存在静电势最小值点,H(66)或H(52)原子附近存在最大值点。酚羟基O(39)、O(40)和O(18)原子拥有较多的负电荷。酚羟基H(52)、H(66)和H(65)原子拥有较多的正电荷,且为LUMO轨道。结论:原花青素B1分子在以静电相互吸引形成多聚体时偏向于从酚羟基O(21)原子向酚羟基H(66)或H(52)方向吸引。原花青素B1分子侧链苯环的邻苯二酚结构是原花青素B1分子中非常活泼的基团,是分子参与反应的主要活性位点。 展开更多
关键词 原花青素B1 密度泛函理论 分子结构 反应活性位点
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急性髓系白血病患者WT1基因rs16754位点多态性及其与发病风险的相关性
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作者 冯翠 《医师在线》 2024年第7期60-62,共3页
目的探究急性髓系白血病患者WT1基因rs16754位点多态性及其与发病风险的相关性。方法收集我院2020年1月~2022年12月102例初诊为急性髓系白血病的患者(观察组)骨髓样本,以及同期162名健康体检者(对照组)的外周血样本,对WT1基因rs16754位... 目的探究急性髓系白血病患者WT1基因rs16754位点多态性及其与发病风险的相关性。方法收集我院2020年1月~2022年12月102例初诊为急性髓系白血病的患者(观察组)骨髓样本,以及同期162名健康体检者(对照组)的外周血样本,对WT1基因rs16754位点进行分型,并分析该位点和急性髓系白血病发病风险的关系。结果观察组和对照组WT1基因rs16754位点的多态性、年龄、性别比较,差异无统计学意义(P>0.05)。观察组GG型和GA/AA型患者骨髓原始细胞比较,差异有统计学意义(P<0.05),而在性别、年龄、RBC、PLT、HGB、WBC、中性粒细胞计数等方面比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。观察组GG型和GA/AA型患者异基因造血干细胞移植率比较,差异无统计学意义(χ^(2)=0.003,P=0.956)。经Kaplan-Meier法分析发现,观察组GG组患者总生存率高于GA/AA组;经Log-rank检验,两组间总生存率有差异(P=0.021);GG型患者死亡风险明显低于GA/AA型(HR=1.679,95%CI=1.056~2.696,P=0.027)。结论WT1基因rs16754位点的等位基因类型为A、G,等位基因A和急性髓系白血病患者的总生存率相关。 展开更多
关键词 急性髓系白血病 基因型分布 等位基因 WT1 rs16754位点 发病风险
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HLA-DQB1基因多态性与广西壮族女性HPV16感染和宫颈癌易感性的关联研究 被引量:13
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作者 卢庭婷 梁惠萍 +1 位作者 熊灏 朱华 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期593-597,共5页
目的:探讨HLA-DQB1等位基因多态性对广西壮族女性HPV16感染和宫颈癌发生的影响,为寻找广西壮族女性宫颈癌的遗传易感基因或保护基因提供线索。方法:选取广西地区25~45岁宫颈癌确诊的壮族患者、无癌健康壮族女性各171例作为研究对象(按年... 目的:探讨HLA-DQB1等位基因多态性对广西壮族女性HPV16感染和宫颈癌发生的影响,为寻找广西壮族女性宫颈癌的遗传易感基因或保护基因提供线索。方法:选取广西地区25~45岁宫颈癌确诊的壮族患者、无癌健康壮族女性各171例作为研究对象(按年龄±3岁配对),采集研究对象样本并提取HPV核酸和人基因组DNA,分别应用PCR-SSP和分子导流杂交技术进行HLA-DQB1基因型检测和HPV基因分型检测,最后进行统计学分析。结果:(1)171例宫颈癌患者中HPV总感染率为91.22%,其中高危型病毒占90.76%,HPV16型为主要致病亚型(43.58%);(2)广西壮族女性宫颈癌患者组的HLA-DQB1*04等位基因携带率高于无癌对照组,差异具有统计学意义(P<0.05);等位基因HLA-DQB1*06/09在宫颈癌患者组中的携带率明显低于无癌组,差异具有统计学意义(P<0.05);而两组间的HLA-DQB1*02/05/07/08等位基因携带率无显著性差异(P>0.05);(3)HLA-DQB1*04基因在HPV16阳性宫颈癌患者中出现的频率明显高于HPV16阴性患者,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:HLA-DQB1*04可能是广西壮族女性宫颈癌发生的易感基因,HLA-DQB1*06/09可能是广西壮族女性宫颈癌的保护基因。而HLA-DQB1*02/05/07/08等位基因可能与广西壮族女性宫颈癌遗传易感性无关。携带HLA-DQB1*04等位基因的广西壮族妇女可能更容易感染HPV16型病毒,从而增加了其患宫颈癌的危险性。 展开更多
关键词 hla-dqb1 宫颈癌 遗传易感基因
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中国南方汉族人群HLA-DQB1基因对系统红斑狼疮的易感性研究 被引量:11
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作者 张咸宁 潘星华 +1 位作者 朱定良 庚镇城 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期37-39,44,共4页
应用PCR-RFLP核苷酸分型方法,探讨了我国南方江浙沪汉族人群HLA-DQB1基因多态性与系统红斑狼疮(SLE)的遗传关联性。对48例SLE患者的血样分析表明,SLE患者具有显著高的DQB1*0601等位基因频率(... 应用PCR-RFLP核苷酸分型方法,探讨了我国南方江浙沪汉族人群HLA-DQB1基因多态性与系统红斑狼疮(SLE)的遗传关联性。对48例SLE患者的血样分析表明,SLE患者具有显著高的DQB1*0601等位基因频率(30.21%,RR=2.8919,Pcorr=0.0112,EF=0.20),DQB1*0601可能是一易感基因;而DQB1*0301(2.08%,RR=0.1108,Pcorr=0,PF=0.14)呈相反结果,可能为保护基因。 展开更多
关键词 系统性红斑狼疮 hla-dqb1 易感性 单元型
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湖北食管癌HLA-DQB1的基因多态性 被引量:13
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作者 林军 邓长生 +3 位作者 孙洁 周燕 熊平 汪亚平 《世界华人消化杂志》 CAS 2000年第9期965-968,共4页
目的从基因水平探讨湖北地区汉族人食管癌 HEN-DQB1等位基因的遗传易感性.方法运用序列特异性引物聚合酶链反应技术,检测无亲缘关系湖北汉族健康人136例、食管癌组42例患者的 HLA-DQB1等位基因.SAS system 统计软件数据处理.结果湖北汉... 目的从基因水平探讨湖北地区汉族人食管癌 HEN-DQB1等位基因的遗传易感性.方法运用序列特异性引物聚合酶链反应技术,检测无亲缘关系湖北汉族健康人136例、食管癌组42例患者的 HLA-DQB1等位基因.SAS system 统计软件数据处理.结果湖北汉族人食管癌患者与正常人比较,HEN-DQB1*0301基因频率显著增高(0.2976 vs 0.1875),P=0.046,OR=1.835,病因分数=0.1354);两组间 HLA-DQB1其余各等位基因分布频率的比较,HLA-DQB1*0201(0.0833 vs 0.1016),*0301(0.2976 vs 0.1875),*0302(0.0595 vs 0859),*0303(0.2381 vs 0.1875),*0304(0.0000 vs 0.0039),*0401(0.0714 vs 0.0469),*0402(0.0119 vs 0.0156),*0501(0.0357 vs 0.0703),*0502(0.0595 vs 0.0664),*0503(0.0119 vs 0.0195),*0504(0.0000 vs 0.0039),*0601(0.0595 vs 0.0781),*0602(0.0476 vs 0.0742),*0603(0.0000 vs 0.0078),*0604(0.0238 vs 0.0508),差异均无显著性.结论 HLA-DQB1*0301等位基因与湖北汉族人食管癌正关联,为其易感基因. 展开更多
关键词 食管癌 hla-dqb1 基因多态性 遗传易感性
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VIPR-1基因12个多态位点与鸡早期产蛋性状的相关性 被引量:26
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作者 周敏 梁菲菲 +3 位作者 饶友生 曾华 张德祥 张细权 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第9期1147-1152,共6页
以鸡VIPR-1基因作为早期产蛋性状的候选基因,选取了12个多态位点对644只宁都三黄鸡进行基因型检测并分析了其与早期产蛋性状的相关性。研究表明:位于5′调控区的位点A-284G与开产日龄(P<0.0001)、总畸形蛋数(P<0.05)呈显著相关,... 以鸡VIPR-1基因作为早期产蛋性状的候选基因,选取了12个多态位点对644只宁都三黄鸡进行基因型检测并分析了其与早期产蛋性状的相关性。研究表明:位于5′调控区的位点A-284G与开产日龄(P<0.0001)、总畸形蛋数(P<0.05)呈显著相关,等位基因G有利于产蛋量的提高;位于内含子6的位点C+42913T与300日龄产蛋数和300日龄的总正常蛋数显著相关(P<0.05),CT基因型为优势等位基因型;位于内含子8的位点C+53327T与开产日龄呈极显著相关(P<0.01),等位基因C有利于开产日龄的提前。 展开更多
关键词 VIPR-1基因 多态位点 早期产蛋性状
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清远麻鸡VIPR-1基因C1704887T、C1715301T位点与繁殖性状的关联性分析 被引量:10
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作者 周敏 沈栩 +5 位作者 李莹 许佳俊 李晓鹏 梁少东 何丹林 聂庆华 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第1期117-122,共6页
家禽繁殖内分泌调控机制和血管活性肠肽I型受体(vasoactive intestinal peptide receptor-1,VIPR-1)基因的体内体外表达实验证明,VIPR-1基因参与了繁殖行为的调控。研究以鸡VIPR-1基因的C1704887T与C1715301T位点作为繁殖性状的候选标记... 家禽繁殖内分泌调控机制和血管活性肠肽I型受体(vasoactive intestinal peptide receptor-1,VIPR-1)基因的体内体外表达实验证明,VIPR-1基因参与了繁殖行为的调控。研究以鸡VIPR-1基因的C1704887T与C1715301T位点作为繁殖性状的候选标记,对512只清远麻鸡进行基因型检测并分析其与繁殖性状的相关性。研究表明:位于内含子6的位点C1704887T与40周龄、43周龄以及54周龄的总产蛋数和总正常蛋数显著相关(P<0.05),等位基因C有利于产蛋;位于内含子8的位点C1715301T与30周总畸形蛋数显著相关(P<0.05);这2个位点组成的二倍型与开产日龄呈显著的相关性(P<0.05),但这2个位点与开产性状无显著相关。研究结果提示:位点C1704887T可作为产蛋量的标记辅助选择的潜在分子标记。 展开更多
关键词 清远麻鸡 VIPR-1基因 C1704887T位点 C1715301T位点 繁殖性状
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HLA-DQB1-HLA-DRB1单倍型与中国南方汉族肺结核的相关性分析 被引量:6
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作者 罗一鲁 刘志辉 +5 位作者 许婉华 谭耀驹 冯蝶仪 宋长兴 傅瑜 刘忠泉 《中国防痨杂志》 CAS 北大核心 2004年第4期199-203,共5页
目的 探讨HLA DQB1 HLA DRB1单倍型在中国南方汉族肺结核发病机制中的可能作用。方法 采用病例 对照的研究方法 ,应用PCR SSP技术对 110例中国南方汉族肺结核患者和 10 1例中国南方汉族健康对照者的 2 0个HLA DRB1和 8个HLA DQB1等... 目的 探讨HLA DQB1 HLA DRB1单倍型在中国南方汉族肺结核发病机制中的可能作用。方法 采用病例 对照的研究方法 ,应用PCR SSP技术对 110例中国南方汉族肺结核患者和 10 1例中国南方汉族健康对照者的 2 0个HLA DRB1和 8个HLA DQB1等位基因进行分型 ,比较两组间DQ2 ,3(8) DRB1、DQ3(7) DRB1、DQ3(8,9) DRB1、DQ2 ,3(7,9) DRB1、DQ2 DRB1、DQ4 DRB1、DQ5 DRB1和DQ6 DRB1单倍型频率 (HF)并计算其相对危险性 (RR)。结果 DQ2 ,3(8) DR14 .1、DQ3(7) DR16单倍型的频率肺结核病例组显著高于对照组 (6 .10vs .0 .5 0、4 .18vs .0 .99) ,其RR分别为 13.4 0和 4 .4 1;DQ2 DR1、DQ2 DR12、DQ2 DR13.3、DQ3(7) DR1、DQ3(7) DR13.3、DQ3(8,9) DR13.3、DQ2 ,3(7,9) DR1、DQ2 ,3(7,9) DR13.3、DQ2 ,3(7,9) DR13.4、DQ4 DR4单倍型的频率肺结核病例组显著低于对照组 (分别为 1.84vs .5 .6 0、1.37vs .5 .6 0、4 .18vs .11.0 0、2 .30vs .9.89、12 .6 2vs .2 2 .2 8、5 .6 1vs .11.5 6、3.70vs .14 .4 0、16 .88vs .2 8.94、5 .13vs .12 .12、2 .30vs .6 .13) ,其RR分别为 0 .31、0 .2 3、0 .34、0 .2 1、0 .4 7、0 .4 4、0 .4 6、0 .38和 0 .35。结论 DQ2 ,3(8) DR14 .1、DQ2 DR12、DQ2 ,3(7。 展开更多
关键词 hla-dqb1-HLA-DRB1单倍型 中国南方 汉族 肺结核 相关性 发病机制
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冬播麦区Glu-1和Glu-3位点变异及1B/1R易位与小麦加工品质性状的关系 被引量:84
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作者 刘丽 阎俊 +3 位作者 张艳 何中虎 Pea R.J. 张立平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第10期1944-1950,共7页
贮藏蛋白组成是决定小麦加工品质的重要因素。本文调查了我国冬播麦区251份主栽品种和高代品系的高分子量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)、低分子量麦谷蛋白亚基(LMW-GS)和1B/1R易位的分布状况,研究了它们与加工品质性状的关系。结果表明,品质较... 贮藏蛋白组成是决定小麦加工品质的重要因素。本文调查了我国冬播麦区251份主栽品种和高代品系的高分子量麦谷蛋白亚基(HMW-GS)、低分子量麦谷蛋白亚基(LMW-GS)和1B/1R易位的分布状况,研究了它们与加工品质性状的关系。结果表明,品质较差的HMW-GSN、7+9、2+12和LMW-GSGlu-A3a与Glu-B3j(1B/1R易位)在冬播麦区分布较广,频率分别为39.4%、45.0%、59.8%、37.1%和44.6%。HMW-GS和LMW-GS等位变异对籽粒蛋白质含量影响较小,对SDS沉降值、和面时间与耐揉性的加性和互作效应达1%的显著水平。按位点对加工品质性状的贡献大小,Glu-D1>Glu-B3>Glu-B1>Glu-A3>Glu-A1;就单个亚基而言,Glu-A1位点,1>2*>N;Glu-B1位点,7+8>14+15>7+9;Glu-D1位点,5+10>4+12>2+12;Glu-A3位点,Glu-A3d>Glu-A3a>Glu-A3c>Glu-A3e,Glu-B3位点;Glu-B3d>Glu-B3b>Glu-B3f>Glu-B3j。1B/1R易位对SDS沉降值、和面时间和耐揉性等加工品质性状有显著负面效应。通过选择优质高低分子量麦谷蛋白亚基和淘汰1B/1R易位系,将有助于提高我国小麦的面筋质量。 展开更多
关键词 普通小麦 高分子量麦谷蛋白亚基 低分子量麦谷蛋白亚基 1B/1R易位 加工品质 Glu-3位点 加工品质性状 1B/1R 等位变异 易位系
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HLA-DQB1等位基因多态性及Th1/Th2细胞相关因子与广西瑶族肝癌家族聚集性的相关性 被引量:6
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作者 卢庭婷 梁惠萍 +3 位作者 李致忠 黄兰 吴继周 陈婉玲 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第9期1262-1267,共6页
目的:探讨HLA-DQB1等位基因多态性及相应位点下Th1/Th2细胞相关因子IL-2、IL-4及IL-10对广西瑶族原发性肝癌家族聚集性的影响,为寻找广西瑶族原发性肝癌的遗传易感基因或拮抗基因提供线索。方法:在广西肝癌高发区选取民族为瑶族的肝癌... 目的:探讨HLA-DQB1等位基因多态性及相应位点下Th1/Th2细胞相关因子IL-2、IL-4及IL-10对广西瑶族原发性肝癌家族聚集性的影响,为寻找广西瑶族原发性肝癌的遗传易感基因或拮抗基因提供线索。方法:在广西肝癌高发区选取民族为瑶族的肝癌高发家族成员、无癌家族成员各40例作为研究对象(采用相同性别、年龄±5岁配对方法),采集研究对象外周血并提取全血DNA,应用PCR-SSP的方法对HLA-DQB1等位基因进行检测,应用ELISA法检测IL-2、IL-4、IL-10的水平。结果:(1)广西瑶族肝癌高发家族组的HLA-DQB1*02/09等位基因表达频率高于无癌家族组,两组比较差异明显,具有统计学意义(P<0.05);而两组间的HLA-DQB1*04/05/06/07/08等位基因表达频率无显著性差异(P>0.05)。(2)HLADQB1各等位基因在乙型肝炎病毒感染组(HBs Ag阳性组)及非乙型肝炎病毒感染组(HBs Ag阴性组)间的分布频率比较无显著性差异(P值均>0.05)。(3)广西瑶族肝癌高发家族成员组中Th2细胞相关因子IL-4、IL-10平均表达水平高于无癌家族成员组,差异具有统计学意义(P<0.05),而两组间的IL-2浓度无显著性差异(P>0.05)。(4)两组中HLA-DQB1*02阳性成员的IL-10平均表达水平高于HLA-DQB1*02阴性成员,差异具有统计学意义(P<0.05)。(5)两组中HLA-DQB1*09阳性成员的IL-4平均表达水平高于HLA-DQB1*09阴性成员,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论:(1)HLA-DQB1*02/09等位基因可能是广西瑶族居民原发性肝癌发生的易感基因。(2)HLA-DQB1各等位基因与广西瑶族居民的HBV感染可能无显著相关性。(3)IL-4、IL-10表达水平失衡可能是广西瑶族肝癌家族聚集性的危险因素。(4)IL-10表达水平失衡可能与HLADQB1*02等位基因的携带有关,而IL-4表达水平失衡可能与HLA-DQB1*09等位基因的携带有关,它们之间共同作用可能与广西瑶族肝癌家族聚集性的发生有相关性。 展开更多
关键词 hla-dqb1 Th1/Th2细胞相关因子 原发性肝癌 家族聚集性
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中国小麦品种资源Glu-1位点组成概况及遗传多样性分析 被引量:112
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作者 张学勇 庞斌双 +3 位作者 游光霞 王兰芬 贾继增 董玉琛 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2002年第11期1302-1310,共9页
分析了 5 12 9份中国小麦初选核心种质样品HMW GS的组成情况 ,其中地方品种 345 9份、育成品种(系 ) 16 70份。这些材料作为初级核心种质基本代表了保存在国家长期库中的普通小麦种质资源的遗传多样性 ,覆盖了中国小麦栽培的 10大生态... 分析了 5 12 9份中国小麦初选核心种质样品HMW GS的组成情况 ,其中地方品种 345 9份、育成品种(系 ) 16 70份。这些材料作为初级核心种质基本代表了保存在国家长期库中的普通小麦种质资源的遗传多样性 ,覆盖了中国小麦栽培的 10大生态区。总体来看 ,在Glu A1、Glu B1和Glu D13个位点上的主要等位变异分别为null、7+8和 2 +12。育成品种中 1、7+9、14 +15、5 +10和 5 +12亚基 (对 )的频率比地方品种有很大的提高。在Glu 1位点上 ,地方品种与育成品种的遗传丰富度差异甚微 ,但育成品种的遗传离散度指数却显著高于地方品种。在 3个位点中 ,Glu B1位点的多样性最丰富 ,其次为Glu D1位点 ,Glu A1位点的多样性最差。从生态区来讲 ,地方品种变异类型最丰富的 3个大区是黄淮冬麦区、西北春麦区和西南冬麦区 ;选育品种最丰富的 4个大区是西南冬麦区、黄淮冬麦区、长江中下游冬麦区和北部冬麦区。由于广泛的引种、杂交、选择以及亲本选配中的偏爱 ,造成许多生态区遗传离散度指数高低与遗传丰富度出现相矛盾的现象 ,这点在长江中下游冬麦区材料中表现尤为突出。育成品种与地方品种间遗传分化系数分析表明 ,现代引种和杂交育种使我国小麦品种“群体”遗传组成和结构发生了质的变化。 展开更多
关键词 中国 小麦 品种资源 GLU-1位点 遗传多样性 核心种质 高分子量谷蛋白亚基 遗传组成
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