东乡族人群Duffy、Kidd、Diego血型系统等位基因频率多态性研究

目的了解甘肃省东乡族人群Duffy、Kidd、Diego血型系统等位基因频率多态性分布。方法2017年1—12月随机抽取甘肃省东乡族无血缘关系献血者100名,采用荧光PCR法检测献血者红细胞Duffy、Kidd、Diego血型系统等位基因。结果东乡族人群Duffy、Kidd、Diego血型系统等位基因频率为:Fy^(*)01为0.835、Fy^(*)02为0.165;Jk^(*)01为0.570、Jk^(*)02为0.430;DI^(*)01为0.020、DI^(*)02为0.980。未发现Fy(a-b-)、Jk(a-b-)、Di(a+b-)稀有表型。Duffy、Kidd、Diego血型系统等位基因对偶抗原Fya/Fy^(b)、Jk^(a)/Jk^(b)、Di^(a)/Di^(b)的不配合率分别为:23.76%、37.01%、3.84%。结论甘肃省东乡族人群Duffy、Kidd、Diego血型系统等位基因呈多态性分布,具有独特的民族分布特征。

缺氧诱导因子-1α基因多态性与急性缺血性脑卒中遗传易感性研究

目的探讨缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)基因C1772T位点及G1790A位点基因多肽性与急性缺血性脑卒中(AIS)的遗传易感性。方法选取2020年7月至2022年12月在玉林市中医医院就诊的AIS患者154例作为AIS组,选取同期体检健康者154名作为对照组,比较两组的两个位点基因型和等位基因的分布频率,分析两个位点单核苷酸多态性与AIS遗传易感性的关系。结果对照组男、女性别间及两组男性间HIF-1α-C1772T位点的基因型及等位基因分布频率,差异有统计学意义(P<0.05)。两组性别间G1790A位点的基因型及等位基因分布频率,差异无统计学意义(P>0.05)。二元logistic回归分析结果显示,C1772T位点的CT基因型与AIS患病风险无关(P>0.05),而T等位基因是AIS患病的保护因素(OR=0.527,P<0.05)。G1790A位点的GA基因型与AIS患病风险无关(P>0.05),而A等位基因是AIS患病的保护因素(OR=0.741,P<0.05)。结论HIF-1α的C1772T基因型及两个位点的T、A等位基因与AIS遗传易感性密切相关,而G1790A位点的基因型与AIS患病风险无关。

应用PCR-SSP方法分析部分中国南方汉族人群HLA-DQB1位点等位基因的多态性

目的 :检测和分析部分中国南方汉族人群HLA DQB1位点等位基因的多态性。方法 :应用聚合酶链反应 -序列特异性引物法 (PCR SSP)对 10 1名健康、无血缘关系的中国南方汉族人进行HLA DQB1分型。结果 :所检测的 8个HLA DQB1靶等位基因均有检出 ;频率最高的为DQ 2 ,3 (7,9) ,其等位基因频率 (GF)为 41 14 % ;最低的为DQ4,其GF为 7 19%。结论 :中国南方汉族人的HLA DQB1等位基因的分布具有民族和地域特征 ,与白人、黑人和日本人的HLA DQB1等位基因分布有差异。

中国山东省威海、莱芜地区健康人群HLA-A、B、DRB1等位基因频率多态性调查

目的:分析人类白细胞抗原基因频率在山东省威海、莱芜地区健康人群中的遗传特征及其人群间分布的差异。方法:采用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对300名健康献血者进行HLA-A、B、DRB1分型。结果:共检出14个HLA-A等位基因,34个B等位基因,13个DRB1等位基因。比较威海和莱芜地区HLA人群基因频率差异为威海地区A*32基因频率显著高于莱芜地区(P<0.05),莱芜地区HLA-B*27基因频率显著高于威海地区(P<0.05)。结论:威海、莱芜地区人群很好的体现了中国北方人群的HLA基因型分布特点,同时也具有其自身的特殊性。这些比较数据为寻找HLA相合的无亲缘关系造血干细胞供者提供了重要的遗传学信息。

HLA-DQB1等位基因多态性与新疆人群重症肌无力的相关性研究

目的探讨HLA-DQB1基因多态性与新疆人群重症肌无力(MG)的相关性。方法采用基因测序的方法对120例新疆地区MG患者及120例健康对照者进行HLA-DQB1等位基因的检测,并比较MG组与对照组之间等位基因型频率的差异。结果共检测出14种HLA-DQB1等位基因片段,其中DQB1*05:03等位基因频率MG组显著高于健康对照组(OR=2.818,P=0.002),而DQB1*02:01:01、DQB1*06:02等位基因频率显著低于对照组(OR=0.179,P=0.006;OR=0.511,P<0.001)。DQB1*04:01:01、DQB1*05:03等位基因频率在MG汉族组显著高于对照汉族组(OR=4.000,P=0.009;OR=3.077,P=0.006),DQB1*02:01:01、DQB1*06:02等位基因频率MG汉族组显著低于对照汉族组(OR=0.358,P=0.002;OR=0.207,P<0.001)。MG维吾尔族组与对照维吾尔族组相比DQB1等位基因频率差异无统计学意义。结论新疆MG患者可能和HLA-DQB1*05等位基因有关,DQB1*04:01:01可能与汉族人群MG相关。MG患者中缺乏DQB1*06:02、DQB1*02:01:01,可能在新疆人群中起保护作用。

汉族人群NOS2 C-1173T、G-954C单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征研究

目的分析中国汉族人群诱导型一氧化氮合酶(NOS2)基因启动子区C-1173T、G-954C单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征。方法获取选择自然人群个体565人(男314例,女251例)血白细胞基因组DNA,利用嵌套式等位基因特异性引物PCR技术检测NOS2C-1173T、NOS2G-954CSNP。结果NOS2C-1173TSNP基因型分布CC、CT、TT分别为66.73%、26.37%、6.90%,C、T等位基因频率分别为79.88%、20.12%。NOS2G-954CSNP基因型分布GG、GC、CC分别为61.77%、37.88%、0.35%,G、C等位基因频率分别为80.71%、19.29%。研究发现了NOS2基因在2位点的SNP前5种组合基因型分布NOS2C-1173C+G-954G233例(41.24%),NOS2C-1173C+G-954C143例(25.31%),NOS2C-1173T+G-954G89例(15.75%),NOS2C-1173T+G-954C59例(10.44%),NOS2T-1173T+G-954G27例(4.78%)。结论本研究揭示了中国汉族人群NOS2基因的2位点的SNP基因型及其组合分布特征,为研究该基因SNP与其生理功能和疾病的关系提供实验基础。

4082名上海骨髓库汉族无关供者HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因及单体型多态性研究

目的了解上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1在高分辨分型水平上的等位基因及单体型频率分布特征。方法采用PCR-测序分型技术(Sequence-based typing,SBT)对4 082名随机、无血缘关系、健康的中华骨髓库上海分库汉族造血干细胞捐献者进行HLA-A、B、DRB1高分辨基因分型,利用计数法和最大似然性原理方法分别计算HLA-A、B、DRB1等位基因及单体型频率。结果 4 082例样本中,共观察到204个HLA等位基因,其中频率>0.1的HLA-A、B、DRB1等位基因分别有A*11∶01、A*24∶02、A*02∶01、B*46∶01、DRB1*09∶01、DRB1*15∶01。841条A-B单体型中,70条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),8条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),17条单体型的频率高于0.01;1 027条B-DRB1单体型中,99条单体型呈现显著的连锁不平衡(ALD>0,HF≥3.67×10-4,χ2>3.84),12条表现为强连锁不平衡(RLD>0.40),12条单体型的频率高于0.01;3 344条A-B-DRB1单体型中,681条单体型是"可靠的"(频率≥3.67×10-4),单体型频率高于0.001有135条。结论获得上海地区汉族人群HLA-A、B、DRB1高分辨等位基因频率和单体型分布数据及相关遗传参数,为临床移植供者的选择、中国人群CWD表的制订、骨髓库最适库容的评估及人类遗传学研究提供参考数据。

深圳汉族人群HLA-Cw,-DQB1基因座等位基因的多态性

背景:HLA复合体是极其复杂的遗传系统,对其多态性的研究在法医学个体识别和亲权鉴定、群体遗传学、移植免疫、疾病相关等医学领域有重要的应用价值。目的:了解HLA-Cw,-DQB1基因座的等位基因在深圳汉族人群中的分布规律。设计、时间及地点:样本基因型的统计学分析,于2007-01/2008-06深圳市血液中心免疫遗传研究室完成。材料:样本来自中国造血干细胞捐献者资料库深圳地区志愿捐献者,使用EDTA-K2抗凝管采集外周血。方法:采用聚合酶链式反应-序列测定方法对深圳地区226名无关供者HLA-Cw,-DQB1基因座的2,3外显子进行序列测定与分析。等位基因频率采用直接计数法计算,Hardy-Weinberg平衡检验采用x2检验。主要观察指标:样本HLA-Cw,-DQB1基因座的基因型。结果:226个样本中共检测到25个Cw等位基因。其中Cw*0102,Cw*0702的频率最高(0.1881),其他频率较高的等位基因依次为Cw*0304,Cw*0302,Cw*0401及Cw*0801,Cw*0303,Cw*0602。该位点基因型观察值与期望值经χ2检验符合Hardy-Weinberg平衡定律(x2=116.00,u=1.78,ν=91,P>0.05)。226个样本中共检测到17个DQB1等位基因。其中DQB1*0301占绝对优势,其基因频率为0.2124。其他频率较高的等位基因依次为DQB1*0303,DQB1*0601,DQB1*0502,DQB1*0602,DQB1*0302,DQB1*0401。该位点基因型观察值与期望值经χ2检验符合Hardy-Weinberg平衡定律(x2=101.34,u=0.78,ν=91,P>0.05)。经计算HLA-Cw位点的杂合度为0.8878,个体识别力为0.9769,非父排除率为0.7731,多态性信息含量为0.8757;HLA-DQB1位点的杂合度为0.8894,个体识别力为0.9762,非父排除率为0.7533,多态性信息含量为0.9659。结论:深圳汉族人群HLA-Cw及DQB1基因座是高度杂合、具有较高鉴别力和丰富信息含量的遗传标记,能较好地反映群体遗传特征。

中国人eNOS基因VNTR多态性的基因型与等位基因频率(英文)

一氧化氮合酶 (nitricoxidesynthase ,NOS)催化L 精氨酸的氧化反应生成L 瓜氨酸和一氧化氮 (nitricoxide,NO)。NO可通过cGMP依赖的信号传导途径介导平滑肌细胞舒张 ,是调节血管张力的重要信使分子。NO尚可抑制血小板凝集 ,对血栓形成起重要调节作用。目前在哺乳动物中已发现细胞来源、表达方式和活性调节不同的 3种NOS同工酶 ,分别为神经元型NOS(neuronalNOS ,nNOS)、诱导型NOS(inducibleNOS ,iNOS)和内皮细胞型NOS(endothelialNOS ,eNOS)。人的eNOS基因位于第 7号染色体长臂 (7q36) ,全长约 2 1kb ,含有 2 6个外显子和 2 5个内含子。eNOS基因存在多个与心脑血管疾病相关的基因多态性位点。其中位于第 4内含子的一个以 2 7bp为核心的数目可变性串联重复序列(variablenumberoftandemrepeat,VNTR)多态性位点 ,已被证实与原发性高血压、心肌梗死和静脉血栓形成有关。目前在我国尚缺乏NOS基因多态性在正常人群中基因型及等位基因频率分布的统计资料。为此 ,我们从 31 6名健康中国人的基因组DNA检测了eNOS基因第 4内含子VNTR多态性的基因型和等位基因 ,鉴定出重复 6次、5次和 4次的 3种等位基因 ,以及 6/ 5杂合、5/ 5纯合、5/ 4杂合和 4 / 4纯合的 4种基因型。同时我们将正常中国人eNOS基因VNTR多态性的基因?

重庆地区汉族人群HLA-A、B、DRB1、DQB1等位基因多态性的研究

目的研究重庆地区人群HLA-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因的多态性特点。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)技术对1 664名重庆籍健康人进行HLA-A、B、DRB1、DQB1等位基因的低分辨分型,并与国内其他地区汉族人群进行比较。结果本次研究共检出HLA-A、B、DRB1、DQB1位点等位基因62种,其中A位点14种,B位点27种,DRB1位点13种,DQB1位点8种。A位点中A*11(34.62%)、A*02(28.81%)、A*24(14.93%)、A*30(5.53%)为重庆人群的优势基因。B位点中B*46(14.92%)>B*40(12.96%)>B*13(12.39%)>B*51(7.26%)。DRB1位点中,频率最高的为DRB1*09(15.65%),其次为DRB1*12(14.78%)、DRB1*14(14.49%)、DRB1*04(14.49%)。DQB1位点中,频率最高的为DQB1*07(26.04%),其次为DQB1*05(19.94%)、DQB1*09(15.51%)。与其他地区不同人群相比,HLA-A、B、DRB1、DQB1各位点等位基因的分布均有显著的差异。结论重庆地区人群的HLA-A、B、DRB1、DQB1位点等位基因符合南方汉族人群分布特点,具有复杂的多态性,中国各地常见的基因均有分布,白血病及其他器官移植患者在重庆不难找到合适的供者。

湖南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因多态性的研究

目的研究湖南地区人群HLA-A、B、DRB1位点等位基因的多态性。方法采用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)技术对3 664名湖南籍健康人进行HLA-A、B、DRB1等位基因的低分辨分型。结果本次研究共检出HLA-A、B、DRB1位点等位基因74种,其中A位点17种,B位点44种,DRB1位点13种。A位点中A*11(34.42%)、A*02(31.88%)、A*24(18.01%)、A*33(6.18%)为湖南人群的优势基因。B位点中B*40(23.70%)>B*46(17.76%)>B*15(13.99%)>B*13(8.60%)。DRB1位点中,频率最高的为DRB1*09(19.69%),其次为DRB1*15(14.01%)、DRB1*12(12.97%)、DRB1*04(11.96%)、DRB1*08(9.02%),频率最低的为DRB1*01(0.88%)。与其他地区不同人群相比,HLA-A、B、DRB1各位点等位基因的分布均有显著的差异。结论湖南人群的HLA-A、B、DRB1位点等位基因具有复杂的多态性,中国各地常见的基因均有分布,白血病患者在湖南不难找到合适的造血干细胞供者。本研究结果可作为湖南地区人群正常参考值,为人类学及HLA与疾病相关的研究提供了有力的背景资料。

云南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因遗传多态性的分析

目的了解中国造血干细胞捐献者资料库云南省分库HLA-A、B、DRB1基因多态性,分析云南地区人群HLA-A、B、DRB1等位基因频率特征。方法采用流式序列特异性寡核苷酸探针(PCR-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)结合直接测序法(PCR-sequence based typing,PCR-SBT)方法,对来自中国造血干细胞捐献者资料库云南分库的1 000名无血缘关系的捐献者进行基因分型,运用方根法计算HLA-A、B、DRB1基因频率,并与其他人群进行比较。结果在云南地区人群中共检出68种HLA基因特异型。其中HLA-A位点18个,HLA-B位点37个,HLA-DR位点13个。A*11(34.66%)、A*02(34.2%)和A*24(19.63%)3个等位基因为云南分库捐献者HLA-A座位的主要等位基因;B*46(12.83%)、B*40(60)(10.9%)和B*15(62)(9.78%)为HLA-B座位的主要等位基因;HLA-DRB1座位以DRB1*12(16.7%)、DRB1*15(16.46%)、DRB1*09(13.46%)和DRB1*04(12.77%)4个等位基因频率为高。最常见的A-B-DRB1单倍型是A*02-B*46-DRB1*09,频率是3.76%。结论云南地区人群的HLA基因多态性与南方汉族接近,但有其自身的一些特点。有必要在本地区开展造血干细胞捐献者的招募工作。

DQB1等位基因多态性与乙肝后肝硬化的遗传易感性研究

目的研究HLA_DQB1等位基因多态性与肝硬化的遗传易感性,为寻找肝硬化的易感基因或抗病基因提供线索。方法应用PCR_SSP技术检测106例湖北汉人乙肝后肝硬化患者和108例正常人HLA_DQB1等位基因,并结合临床资料进行比较分析。结果肝硬化组DQB10501等位基因频率明显升高(24.52%vs11.11%,RR=2.6,P<0.01),DQB10602等位基因频率明显下降(4.7%vs12.03%,RR=0.3618,P<0.05),其他等位基因频率在两组之间无显著性差异。提示DQB10501等位基因与湖北地区汉人乙肝后肝硬化关联,DQB10602等位基因则呈负关联。结论DQB10501等位基因可能是湖北地区汉族人乙肝后肝硬化的易感基因,DQB10602则为抵抗基因。

云南昆明白族、汉族、彝族儿童HLA-DQA1等位基因多态性分析

为了解昆明白族、汉族、彝族儿童HLA-DQA1等位基因多态性。采用PCR-SSP技术对昆明地区无血缘关系的3个民族儿童的HLA-DQA1等位基因进行分析。结果显示3个民族儿童HLA-DQA1基因位点上共检出14种等位基因。其中昆明白族儿童HLA-DQA1最常见的等位基因为*0601(16.67%),高频等位基因为*0103、*0102、*0303;昆明汉族儿童HLA-DQA1最常见的等位基因为*0302(26.67%),高频等位基因为*0103、*0601;昆明彝族儿童HLA-DQA1最常见的等位基因为*0601(38.57%),除*0601外没有高频等位基因,余基因频率均小余10%,同时在基因排序上3个民族也存在着差异。结果提示,昆明地区3个民族儿童HLA-DQA1基因分布既有共同特点,又有其独特性。

遵义地区汉族HLA-DRB1、DQB1等位基因多态性的研究

目的:从基因水平调查遵义地区汉族人群HLA-DRB1、DQB1等位基因频率,并了解其多态性分布状况。方法:应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对遵义汉族200名健康个体进行HLA-DRB1、DQB1等位基因分型。结果:遵义地区汉族HLA-DRB1、DQB1等位基因频率分布,在中低分辨水平,共检出13个DRB1基因,7个DQB1基因,DRB1*09、DRB1*08及DQB1*05基因频率相对较高;DRB1*10及DQB1*04基因频率相对较低。与我国北方、南方汉族比较,更接近南方汉族人群。结论:遵义汉族人群HLA-DRB1、DQB1基因具有较为丰富的多态性,其分布符合南方汉族的特点,可能与重庆汉族人群有较为密切的民族融合。

新疆塔吉克族人群HLA-A、B、DRB1等位基因遗传多态性分析

目的研究新疆塔县自治区的塔吉克族人群的HLA等位基因的分布和多态性。方法采用PCR-SSP的方法对500份地处海拔3 000 m以上的塔吉克族聚居地无血缘关系的塔吉克族人群血液标本进行HLA-A、B、DRB1位点等位基因分型分析,并对分型结果做统计学分析。结果 500份标本中HLA-A、HLA-B、HLA-DRB1座位分别检出17、25、13个等位基因,HLA-A频率较高的等位基因为A*02、A*03、A*24,频率分别为24.73%,15.31%和14.82%;HLAB频率高的有B*51、B*35、B*52,频率分别为20.88%,13.73%和12.65%;HLA-DRB1频率高的有DRB1*13、DRB1*04、DRB1*15,频率分别为15.98%,14.02%和13.63%,并将结果与中国南北方汉族人和回族及维吾尔族等位基因频率的对比。结论获得了中国新疆塔吉克族人群HLA-A、B、DRB1等位基因的分布特征,新疆塔吉克人群等位基因频率分别最高的前5位是A*02、A*03、A*24、A*01、A*11、B*51、B*35、B*52、B*27、B*13、DRB1*13、DRB1*04、DRB1*15、DRB1*09、DRB1*07。塔吉克族人群A*03、A*01、B*52、B*27和DRB1*13的等位基因频率明显较高。

HLA-DRB1等位基因多态性与食管癌遗传易感性研究

目的 :从基因水平探讨湖北地区汉族人食管癌HLA -DRB1等位基因的遗传易感性。方法 :运用序列特异性引物聚合酶链反应结合基因序列分析等技术 ,检测无亲缘关系湖北汉族健康人 136例、食管癌组 4 2例患者的HLA -DRB1等位基因。SAS统计软件数据处理。结果 :湖北地区汉族人食管癌患者与正常人比较 ,HLA -DRB1 0 90 1基因频率显著增高 (0 2 5 0 0vs 0 1397,P =0 0 2 8,OR =2 0 5 3,病因分数 =0 12 82 ) ;两者间其余HLA -DRB1等位基因分布频率差别均无显著。结论 :HLA -DRB1 0 90 1等位基因与湖北地区汉族人食管癌正相关 ,为其易感基因 ,该等位基因测序结果与其基因库第 2外显子序列吻合。

等位基因特异性扩增酶联免疫法检测CYP1A1基因多态性

目的 建立一种高效的基因多态性检测方法。方法 用等位基因特异性扩增 (ASA)和等位基因特异性扩增酶联免疫法(ASA ELISA)对CYP1A1基因m2多态性进行检测。结果 两种方法的检测结果基本一致 ,仅有 1例不相同。ASA ELISA将地高辛标记在扩增产物上 ,然后通过酶联免疫法检测扩增产物 ,检测灵敏度与等位基因特异性扩增 (ASA)后琼脂糖凝胶电泳相比高 10 0倍。结论 该方法具有操作简单、快速、灵敏度高等特点 ,可用于大标本量的基因多态性检测。