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HLA-I类基因新等位基因HLA-B*52:11的序列分析及确认
被引量:
2
1
作者
李晓丰
章旭
+3 位作者
张坤莲
陈阳
刘显智
李剑平
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期712-715,共4页
目的序列分析及确定1个HLA新等位基因。方法应用基于Luminex平台的聚合酶链式反应序列特异性寡核苷酸探针(polymerasechainreaction—sequencespecificoligonucleotideprobes,PCR—SSOP)基因分型方法、PCR产物测序和基因克隆测序方...
目的序列分析及确定1个HLA新等位基因。方法应用基于Luminex平台的聚合酶链式反应序列特异性寡核苷酸探针(polymerasechainreaction—sequencespecificoligonucleotideprobes,PCR—SSOP)基因分型方法、PCR产物测序和基因克隆测序方法,通过软件分析该基因序列及与最相近等位基因的序列差异。结果PCRSSOP结果显示,该样品HI.A—I类基因B位点反应格局出现异常提示;测序结果最终表明其B位点第3外显子序列与所有已知HI。AB等位基因序列均不一致,在所检测的外显子第2、3、4区域中,与序列最相近的等位基因HLA—B*52:01:01的差异只是在第3外显子产生了nt583C→T一个核苷酸替代,并导致相应的195位密码子由CAC(H)→TAC(Y),氨基酸组成由组氨酸变为酪氨酸。结论经序列分析1个HLA—I类基因的新等位基因被确认.已被世界卫生组织HI。A因子命名委员会正式命名为HLAB*52:11。
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关键词
HLA—
i
类基因
H
i
A-B*52:11
序列分析
原文传递
题名
HLA-I类基因新等位基因HLA-B*52:11的序列分析及确认
被引量:
2
1
作者
李晓丰
章旭
张坤莲
陈阳
刘显智
李剑平
机构
辽宁省血液中心
出处
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期712-715,共4页
基金
基金项目:辽宁省自然科学基金(20062127)
沈阳市科学计划项目(10813249-00)
文摘
目的序列分析及确定1个HLA新等位基因。方法应用基于Luminex平台的聚合酶链式反应序列特异性寡核苷酸探针(polymerasechainreaction—sequencespecificoligonucleotideprobes,PCR—SSOP)基因分型方法、PCR产物测序和基因克隆测序方法,通过软件分析该基因序列及与最相近等位基因的序列差异。结果PCRSSOP结果显示,该样品HI.A—I类基因B位点反应格局出现异常提示;测序结果最终表明其B位点第3外显子序列与所有已知HI。AB等位基因序列均不一致,在所检测的外显子第2、3、4区域中,与序列最相近的等位基因HLA—B*52:01:01的差异只是在第3外显子产生了nt583C→T一个核苷酸替代,并导致相应的195位密码子由CAC(H)→TAC(Y),氨基酸组成由组氨酸变为酪氨酸。结论经序列分析1个HLA—I类基因的新等位基因被确认.已被世界卫生组织HI。A因子命名委员会正式命名为HLAB*52:11。
关键词
HLA—
i
类基因
H
i
A-B*52:11
序列分析
Keywords
hlaclass i
HLA- B*52:11
sequenc
i
ng
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
HLA-I类基因新等位基因HLA-B*52:11的序列分析及确认
李晓丰
章旭
张坤莲
陈阳
刘显智
李剑平
《中华医学遗传学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2011
2
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