宫颈癌细胞中HMAT1基因的功能预测及其干扰小RNA的筛选

目的 预测宫颈癌细胞中人类与鼠同源乳腺转化基因(HMATI)的功能及筛选出能有效沉默该基因的干扰小RNA。方法 采用细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片对原发性宫颈癌标本进行筛选,通过生物信息学分析HMAT1 基因,针对HMAT1基因设计了三条特异性干扰小RNA,分别与pRNAU6.1 Hygro重组后,与含有该基因的重组体瞬时共转染B16F0细胞,用逆转录聚合酶链反应(RT PCR)技术检测对HMAT1基因的干扰效果。结果 细胞原癌基因、抑癌基因分类芯片筛选出表达量明显上调的基因共四条。对其中上调明显的HMAT1基因,通过生物信息学预测其为一个调节细胞生长的看家基因,其编码的蛋白质为一个Ⅰ型跨膜蛋白,且其酪氨酸蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点可能与HMAT1 蛋白功能活化有关。半定量检测结果表明其中第一条特异性干扰小RNA有显著性抑制效果(P<0.05)。结论 初步预测HMAT1 基因很可能是与宫颈癌相关的癌基因,其编码的蛋白质可能参与细胞的信号转导,设计出针对该基因的干扰小RNA可以有效沉默HMAT1基因。