HMX1基因多态性与绵羊先天小耳畸形的相关性分析

为研究HMX1基因的SNPs多态性及其增强子突变与绵羊先天小耳畸形之间的关系,采用琼脂糖凝胶电泳结合PCR测序技术对170只阿勒泰羊HMX1基因的增强子、外显子的多态性进行检测,并与先天小耳畸形进行关联分析。结果表明:在HMX1基因的外显子1和2中共鉴定出24个SNPs,其中A557T与绵羊先天小耳畸形显著相关(P<0.05);在HMX1的基因增强子中发现存在76 bp的复制,与绵羊先天小耳畸形极显著相关(P<0.01)。研究结果显示,HMX1基因增强子区76 bp复制可能是导致阿勒泰绵羊先天小耳畸形的致因突变,这一发现为阿勒泰羊先天小耳畸形的分子诊断和遗传改良提供了潜在的标记。

一个双侧耳甲腔型小耳畸形家系遗传学及临床表型分析

目的:对1个中国汉族非综合征型双侧耳甲腔型小耳畸形家系进行致病变异检测及临床表型分析。方法:2022年6至12月于山西医科大学第一医院整形外科收集1个中国汉族非综合征型双侧小耳畸形家系成员的临床资料以及外周血样本,提取先证者DNA利用全基因组测序(WGS)筛选可能的候选变异。采用荧光定量PCR验证候选拷贝数变异(CNV)在先证者及其表型正常的配偶和患病儿子的存在情况,并分析其与表型的相关性。结果:该家系共4代9人,含4例小耳畸形患者,收集到其中3人外周血样本,分别为先证者、先证者配偶(表型正常)、先证者的儿子(患病)。家系内患者表现为非综合征型双侧耳甲腔型小耳畸形。WGS在先证者检测到HMX1和CPZ基因间区的拷贝数增加,重复区域累及HMX1基因远程增强子进化保守区域(ECR),该变异存在于先证者及其患病的儿子,其配偶临床表型正常,不存在ECR的CNV改变。结论:累及HMX1远程增强子ECR的CNV重复可能与该家系的双侧耳甲腔型小耳畸形有关。

小耳畸形家系的基因定位及候选基因筛查初步研究

目的小耳畸形致病基因的定位克隆及其候选基因筛查的初步研究。方法针对收集的先天性小耳畸形家系(ZX07家系)通过STR标记进行全基因组扫描和连锁分析;在可疑的连锁区域选择与小耳畸形相关的候选基因进行筛查研究。结果全基因组扫描连锁分析发现15、11、4、12、16、2号条染色体有存在致病基因的可能,在NCBI网站上查询并选择杂合度较高的位点设计STR引物,通过精细定位排除了15、16、12、2号染色体连锁的可能。在11号和4号染色体D11S4191、D4S419、D4S412三个位点附近选择与小耳畸形相关的FGF3、FGFR3和HMX1基因进行筛查,未发现上述基因的突变。结论 ZX07小耳畸形家系为常染色体显性遗传,初步的基因筛查排除了FGF3、FGFR3和HMX1基因突变,为进一步研究小耳畸形的致病基因奠定了基础。