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牦牛HORMAD1基因的克隆及生物信息学分析
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作者 金帅 齐社宁 +9 位作者 阎萍 梁春年 郭宪 包鹏甲 裴杰 褚敏 丁学智 刘文博 吴晓云 刘建 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期95-100,共6页
利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛HORMAD1基因包含一个长度为1 182 bp的开放阅读框,编码39... 利用分子克隆技术获得了牦牛HORMAD1基因编码区序列,并采用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白的基本理化性质、疏水性、信号肽、二级结构等方面进行了预测和分析。结果表明,牦牛HORMAD1基因包含一个长度为1 182 bp的开放阅读框,编码393个氨基酸;其编码蛋白属于亲水性蛋白,无明显的信号肽,含有很多个磷酸化位点。二级结构主要以无规则卷曲和α螺旋为主。HORMAD1基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛HORMAD1与黄牛、马和猪等物种的HORMAD1氨基酸遗传距离较近,具有高度相似性。 展开更多
关键词 牦牛 hormad1基因 克隆 生物信息学分析
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Single-nucleotide polymorphisms in HORMAD1 may be a risk factor for azoospermia caused by meiotic arrest in Japanese patients 被引量:3
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作者 Toshinobu Miyamoto Aldra Tsujimura +5 位作者 Yasushi Miyagawa Eitetsu Koh Mikio Namiki Michiharu Horikawa Yasuaki Saijo Kazuo Sengoku 《Asian Journal of Andrology》 SCIE CAS CSCD 2012年第4期580-583,共4页
Genetic mechanisms are implicated as a cause of some male infertility, yet are poorly understood. Meiosis is unique to germ cells and essential for reproduction. The synaptonemal complex is a critical component for ch... Genetic mechanisms are implicated as a cause of some male infertility, yet are poorly understood. Meiosis is unique to germ cells and essential for reproduction. The synaptonemal complex is a critical component for chromosome pairing, segregation and recombination. Hormadl is essential for mammalian gametogenesis as knockout male mice are infertile. Hormadl-deficient testes exhibit meiotic arrest in the early pachytene stage and synaptonema! complexes cannot be visualized. To analyze the hypothesis that the human HORMAD1 gene defects are associated with human azoospermia caused by meiotic arrest, mutational analysis was performed in all coding regions by direct sequence analysis of 30 Japanese men diagnosed with azoospermia resulting from meiotic arrest. By the sequence analysis, three polymorphism sites, Single Nucleotide Polymorphism 1 (c. 163A〉G), SNP2 (c. 501T〉G) and SNP3 (c. 918C〉T), were found in exons 3, 8 and 10. The 30 patients with azoospermia and 80 normal pregnancy-proven, fertile men were analyzed for HORMAD1 polymorphisms. Both SNP1 and SNP2 were associated with human azoospermia caused by complete early meiotic arrest (P〈0.0S). We suggest that the HORMAD1 has an essential meiotic function in human spermatogenesis. 展开更多
关键词 AZOOSPERMIA hormad1 male infertility male meiosis SNP
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杂交三倍体泥鳅性腺发育观察及其基因表达分析 被引量:2
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作者 孙雨晴 陈琦 +5 位作者 郑欣宜 徐其征 庄子昕 王伟 曹小娟 周贺 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期82-88,共7页
以杂交三倍体泥鳅(4 n♀×2 n♂)为研究对象,对其早期性腺分化的组织学进行观察,并采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,对杂交三倍体泥鳅早期不同发育时期(孵化后4、14、21、23、50、60和65 d)和不同组织(性腺、肝脏、肌肉、肠、鳃、鳍... 以杂交三倍体泥鳅(4 n♀×2 n♂)为研究对象,对其早期性腺分化的组织学进行观察,并采用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,对杂交三倍体泥鳅早期不同发育时期(孵化后4、14、21、23、50、60和65 d)和不同组织(性腺、肝脏、肌肉、肠、鳃、鳍、皮肤和脑)中性腺发育相关基因(hormad1、dmrt1-a)的表达量进行定量检测。研究结果发现:在早期不同发育时期,hormad1和dmrt1-a基因均为在4日龄中表达量最高,14日龄次之,在50日龄中表达量最低。在不同组织中,hormad1基因在雌鱼的鳍中表达量最高,肝脏中表达量最低;在雄鱼的性脑腺中表达量最高,肝脏中表达量最低。dmrt1-a基因在雌雄鱼的性腺中表达量最高,脑中表达量最低。杂交三倍体泥鳅早期性腺的分化和发生与二倍体泥鳅无差别,可观察到原始生殖细胞、原始生殖细胞的迁移和原始性腺的生成及性腺的分化等过程。研究结果表明,hormad1、dmrt1-a这2个基因与杂交三倍体泥鳅早期性腺发育密切相关。 展开更多
关键词 泥鳅 杂交三倍体 hormad1 dmrt1-a 性腺发育 基因表达 QRT-PCR
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