FOXD2-AS1、MIR4435-1HG和HOXC-AS2联合诊断胃癌的临床价值及机制研究

目的:筛选胃癌中差异性表达的长链非编码RNA(lncRNA),探讨代表性lncRNA在胃癌诊断中的潜在价值及相关机制。方法:从TCGA数据库中筛选在胃癌中差异性表达的lncRNA,通过GSE179252和GSE184336数据集以及qRT-PCR检测胃癌患者血清中lncRNA的表达水平对结果进行验证。绘制ROC曲线评价代表性lncRNA单独及联合检测的诊断效能。分析HOXC-AS2与胃癌患者临床病理参数的相关性。利用在线数据库对HOXC-AS2进行下游靶基因预测以及PPI蛋白互作分析,构建HOXC-AS2-miRNA-mRNA调控网络。结果:从TCGA数据库中筛选出3个在胃癌中差异性表达的lncRNA。TCGA-STAD、GSE179252和GSE184336数据集中FOXD2-AS1、MIR4435-1HG和HOXC-AS2联合检测胃癌的ROC曲线下面积(AUC)分别为0.994、0.958和0.921。血清中检测结果发现与胃良性疾病患者相比,FOXD2-AS1、MIR4435-1HG和HOXC-AS2在胃癌患者血清中表达升高(P<0.001),三者联合检测诊断胃癌的AUC为0.843,灵敏度和特异度分别为80%和86%。HOXC-AS2与胃癌肿瘤分级有相关性(P<0.05)。HOXC-AS2可与下游mRNA竞争miR-9-5p等miRNA结合位点,调控DLX6与HOXC蛋白家族之间的相互作用。结论:FOXD2-AS1、MIR4435-1HG和HOXC-AS2的联合检测可用作胃癌的诊断标志物,HOXC-AS2可作为ceRNA促进胃癌进展。