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基于生物信息学分析肺腺癌潜在预后生物标记物HROB
1
作者
徐凤岐
江一民
+3 位作者
陈艺
莫欣悦
王梅芳
唐以军
《湖北医药学院学报》
CAS
2024年第5期494-501,共8页
目的:通过生物信息学方法探讨HROB在肺腺癌(LUAD)中的表达及预后相关性。方法:从TCGA数据库下载LUAD患者的基因表达谱和临床数据,从HPA数据库下载LUAD患者及健康人群免疫组织化学数据,运用R软件分析HROB基因在LUAD和癌旁组织中的表达差...
目的:通过生物信息学方法探讨HROB在肺腺癌(LUAD)中的表达及预后相关性。方法:从TCGA数据库下载LUAD患者的基因表达谱和临床数据,从HPA数据库下载LUAD患者及健康人群免疫组织化学数据,运用R软件分析HROB基因在LUAD和癌旁组织中的表达差异。临床相关性分析揭示HROB与LUAD患者临床病理特征的相关性。Kaplan-Meier生存分析结合ROC曲线评估HROB的诊断价值及预后分析。Cox回归分析寻找LU⁃AD独立预后因素。GO/KEGG及GSEA信号通路富集分析HROB在LUAD中的潜在功能。CIBERSORT评估HROB表达水平与肿瘤浸润性免疫细胞的相关性。结果:HROB在LUAD中的表达高于癌旁正常组织(P<0.05),并与年龄、吸烟情况、初始治疗效果、TNM分期、病理分级、总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔期(PFI)等临床病理特征呈正相关(P<0.05)。生存分析表明HROB低表达的LUAD患者OS、PFI、DSS明显高于高表达患者(P<0.05)。Cox回归分析发现病理分级Ⅲ、Ⅳ级是影响LUAD预后的独立危险因素(P<0.05),HROB高表达尚不能视为独立预后因子(P>0.05)。功能富集分析提示HROB主要参与细胞周期、染色体分离和同源重组等相关通路。在LUAD免疫细胞浸润中,HROB高表达与NK CD56dim细胞、Tgd细胞、Th2细胞呈正相关(P<005)。结论:HROB的高表达与LUAD患者的进展、预后和免疫调节密切相关,它可能成为LUAD预测预后的生物标志物和治疗靶点。
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关键词
hrob
肺腺癌
生物信息学分析
预后
下载PDF
职称材料
原发性卵巢发育不全一家系HROB致病等位基因遗传学分析
2
作者
吴兴汉
彭湘云
+3 位作者
郑宇
张树菊
彭聿
王华
《浙江大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期727-731,共5页
一例13岁6个月女童因月经未初潮就诊,实验室检查提示卵泡刺激素及黄体生成素增高,抗米勒管激素降低,盆腔超声未发现双侧卵巢,条索状子宫。进一步完善患儿妹妹检查,与先证者表型类似,可诊断为原发性卵巢发育不全。全外显子组测序及家系...
一例13岁6个月女童因月经未初潮就诊,实验室检查提示卵泡刺激素及黄体生成素增高,抗米勒管激素降低,盆腔超声未发现双侧卵巢,条索状子宫。进一步完善患儿妹妹检查,与先证者表型类似,可诊断为原发性卵巢发育不全。全外显子组测序及家系桑格测序结果提示,患儿及妹妹均携带HROB基因c.718C>T(p.Arg240*)及c.1351C>T(p.Arg451*)杂合变异,分别遗传自父母亲,符合常染色体隐性遗传规律。先证者予以起始剂量0.125 mg/d戊酸雌二醇口服,半年后第二性征开始发育。
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关键词
原发性卵巢发育不全
hrob
基因
同源重组
DNA损伤修复
全外显子测序
病例报告
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职称材料
题名
基于生物信息学分析肺腺癌潜在预后生物标记物HROB
1
作者
徐凤岐
江一民
陈艺
莫欣悦
王梅芳
唐以军
机构
十堰市太和医院·湖北医药学院附属医院呼吸与危重症医学科
出处
《湖北医药学院学报》
CAS
2024年第5期494-501,共8页
基金
白求恩公益基金项目(BCF-XC-SQ-20221206-05)
湖北省第二届医学领军人才工程基金资助课题。
文摘
目的:通过生物信息学方法探讨HROB在肺腺癌(LUAD)中的表达及预后相关性。方法:从TCGA数据库下载LUAD患者的基因表达谱和临床数据,从HPA数据库下载LUAD患者及健康人群免疫组织化学数据,运用R软件分析HROB基因在LUAD和癌旁组织中的表达差异。临床相关性分析揭示HROB与LUAD患者临床病理特征的相关性。Kaplan-Meier生存分析结合ROC曲线评估HROB的诊断价值及预后分析。Cox回归分析寻找LU⁃AD独立预后因素。GO/KEGG及GSEA信号通路富集分析HROB在LUAD中的潜在功能。CIBERSORT评估HROB表达水平与肿瘤浸润性免疫细胞的相关性。结果:HROB在LUAD中的表达高于癌旁正常组织(P<0.05),并与年龄、吸烟情况、初始治疗效果、TNM分期、病理分级、总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)和无进展间隔期(PFI)等临床病理特征呈正相关(P<0.05)。生存分析表明HROB低表达的LUAD患者OS、PFI、DSS明显高于高表达患者(P<0.05)。Cox回归分析发现病理分级Ⅲ、Ⅳ级是影响LUAD预后的独立危险因素(P<0.05),HROB高表达尚不能视为独立预后因子(P>0.05)。功能富集分析提示HROB主要参与细胞周期、染色体分离和同源重组等相关通路。在LUAD免疫细胞浸润中,HROB高表达与NK CD56dim细胞、Tgd细胞、Th2细胞呈正相关(P<005)。结论:HROB的高表达与LUAD患者的进展、预后和免疫调节密切相关,它可能成为LUAD预测预后的生物标志物和治疗靶点。
关键词
hrob
肺腺癌
生物信息学分析
预后
Keywords
hrob
Lung adenocarcinoma
Bioinformatics
Prognosis
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
原发性卵巢发育不全一家系HROB致病等位基因遗传学分析
2
作者
吴兴汉
彭湘云
郑宇
张树菊
彭聿
王华
机构
湖南省儿童医院医学遗传科
湖南省儿童医院内分泌科
出处
《浙江大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第6期727-731,共5页
基金
湖南省遗传性出生缺陷与罕见病临床研究中心建设项目(2023S-K4053)。
文摘
一例13岁6个月女童因月经未初潮就诊,实验室检查提示卵泡刺激素及黄体生成素增高,抗米勒管激素降低,盆腔超声未发现双侧卵巢,条索状子宫。进一步完善患儿妹妹检查,与先证者表型类似,可诊断为原发性卵巢发育不全。全外显子组测序及家系桑格测序结果提示,患儿及妹妹均携带HROB基因c.718C>T(p.Arg240*)及c.1351C>T(p.Arg451*)杂合变异,分别遗传自父母亲,符合常染色体隐性遗传规律。先证者予以起始剂量0.125 mg/d戊酸雌二醇口服,半年后第二性征开始发育。
关键词
原发性卵巢发育不全
hrob
基因
同源重组
DNA损伤修复
全外显子测序
病例报告
Keywords
Primary ovarian insufficiency
hrob
gene
Homologous recombination
DNA damage repair
Whole exome sequencing
Case report
分类号
R394 [医药卫生—医学遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于生物信息学分析肺腺癌潜在预后生物标记物HROB
徐凤岐
江一民
陈艺
莫欣悦
王梅芳
唐以军
《湖北医药学院学报》
CAS
2024
0
下载PDF
职称材料
2
原发性卵巢发育不全一家系HROB致病等位基因遗传学分析
吴兴汉
彭湘云
郑宇
张树菊
彭聿
王华
《浙江大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
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