低镁血症、癫痫和智力障碍综合征患儿1例的CNNM2基因变异分析

目的探讨1例儿童低镁血症、癫痫和智力障碍(HSMR)综合征患者的分子遗传学病因。方法选取2021年7月9日因"反复抽搐2个月"收治于山东大学附属儿童医院的HSMR综合征患儿作为研究对象,并收集其临床资料。采集患儿及父母的外周血样,提取基因组DNA,应用全外显子组测序技术进行基因检测,确定候选变异位点,Sanger测序家系验证。应用生物信息学分析软件SWISS-MODEL对蛋白质结构模型进行预测。结果患儿为男性,就诊时为1岁7月龄,临床表现为癫痫发作、全面性发育迟缓,血清学检测提示低血清镁。基因检测结果提示患儿CNNM2基因存在c.1448delT(p.Val483GlyfsTer29)杂合变异,考虑为新发变异。该变异使CNNM2基因第1448位核苷酸T发生缺失,导致第483位氨基酸由缬氨酸变成甘氨酸,且下游第29位氨基酸变为终止密码子。SWISS-MODEL软件分析提示该变异位点导致蛋白结构发生改变,产生截短蛋白。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异与分类指南,c.1448del T(p.Val483GlyfsTer29)评级为致病性变异(PVS1+PS2+PM2Supporting+PP4)。结论CNNM2基因c.1448delT杂合变异考虑为HSMR综合征患儿的致病原因,该变异的发现丰富了CNNM2基因表型-基因型。