泛太平洋西岸地区部分H5N1亚型禽流感病毒毒株血凝素基因特性的研究

目的了解泛太平洋西岸各个国家H5N1亚型人禽流感病毒血凝素（HA）基因分子特征,寻求HA基因变异规律。方法从Genebank中下载泛太平洋西岸国家或地区（包括泰国、越南、香港、印度尼西亚、中国大陆、蒙古、俄罗斯）50株H5N1亚型高致病性流感病毒（HAPI）毒株血凝素基因序列,利用生物信息学软件DNASTAR5.0进行核酸同源性分析,用MEGA3.1进行核酸和氨基酸序列比对和进化树分析。结果50株高致病性H5N1亚型流感病毒毒株可以分成3个相对独立的进化簇。第1簇为泰国越南簇;第2簇为中国印尼北亚簇（包含中国、印度尼西亚、蒙古以及俄罗斯）;第3簇主要为1996~2001年期间分离的毒株,该簇毒株HA基因与Gs/Gdlike毒株核酸同源性更为接近,其基因亚型更多表现为Gs/Gdlike或其他基因亚型。HA基因分子特征分析表明在HA蛋白抗原性上,泰国越南分离株表现基本一致,而其他地域分离株存在表现各异,但也存在地域的一致性。结论泛太平洋西岸地区分离的H5N1亚型禽流感病毒血凝素蛋白在分子特征上表现出一定的地域特异性,在一定地域范围内保持一致性。

2011-2014年山东省H9亚型禽流感病毒HA基因遗传变异分析

对2011-2014年山东26个H9亚型AIV毒株的HA基因进行测序分析。结果显示,所有毒株均属于h9.4.2.5亚分支,与疫苗株GD/SS/94、SD/6/96、SH/F/98的核苷酸相似性为88.0%-91.5%。HA裂解位点均只有一个碱性氨基酸（R）,符合低致病性AIV的特征。所有毒株在234位发生了谷氨酸Q→亮氨酸L的突变,呈现出典型的人流感病毒受体结合特性。所有毒株在313-315位均新增1个潜在糖基化位点,且部分毒株在145-147位出现新潜在糖基化位点NGT。结果表明,山东省H9亚型AIV基因已发生较大变异,因此需要加强禽类生产贸易的监测和生物安全措施,及时更新疫苗毒株,控制H9亚型AIV的传播。

2016—2017年苏州市人感染H7N9禽流感病毒HA基因进化分析

目的监测分析2016—2017年苏州市第五波H7N9禽流感疫情中病毒分子流行特征,为本地区H7N9流感病毒感染防控提供科学依据。方法采集疑似急重症呼吸道感染病例咽拭子标本并提取病毒核酸,应用实时荧光定量-聚合酶链反应(Real-timePCR)方法检测甲/乙型流感病毒核酸,阳性标本继续进行各亚型分型检测(H1N1,H3N2,H5N1)。H7N9阳性标本进一步进行病毒分离和血凝素HA基因测序分析。结果2016年10月至2017年5月间苏州人感染H7N9病毒总体病死率为40%(22/55)。检出高峰在12月份至次年2月,以60岁以上老年人居多,患者中位年龄为58岁。超过80%的确诊患者发病前有活禽暴露史。序列分析表明血凝素HA基因同源性为98.7%~100%。受体结合位点中的关键氨基酸也没有发生突变。此外,HA基因血凝素连接肽位置也没有发生多个碱性氨基酸插入。结论目前H7N9病毒不会在人群中持续传播,直接接触活禽或被病毒污染的环境是人感染H7N9病毒的主要途径;在苏州流行的H7N9病毒对禽类仍然是低致病性的。

2021-2022年度海南省B型Victoria系流感病毒病原学特征分析

目的了解2021—2022监测年度海南省B型Victoria系流感病毒的流行状况,分析其抗原性、耐药性和基因变异情况。方法选取33株B型Victoria系流感病毒,利用标准雪貂抗血清进行抗原性分析和荧光法检测病毒对神经氨酸酶抑制剂(NAI)的敏感性,应用Illumina公司MiSeqDx深度测序平台进行基因组序列测定,使用MEGA 10.1.8和DNAStar 7.0.1生物信息学软件进行多序列比对和分析,并采用邻位归并法(N-J)绘制系统进化树。结果2021—2022监测年度海南省流感病毒基因型为B型Victoria系,依据WHO命名方式,33株分离株血凝素(HA)基因和神经氨酸酶(NA)基因均属于1A.3遗传分支,未发生HA与NA基因分支间的重配,与WHO推荐的疫苗株B/Washington/02/2019(2020—2022)抗原性类似,对磷酸奥司他韦敏感,检测到1株NA基因发生D197E氨基酸位点变异并对扎那米韦的敏感性高度降低的毒株。结论2021—2022监测年度海南省流行的B型Victoria系流感病毒与疫苗株相匹配,对神经氨酸酶抑制剂类药物敏感。