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橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达
被引量:
4
1
作者
龙翔宇
何斌
+4 位作者
曹冰
梁启福
方永军
阳江华
唐朝荣
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期23-28,共6页
根据拟南芥、蓖麻及杨树果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因(F2KP)的核苷酸序列,使用橡胶树胶乳转录组数据库拼接到1条1 228 bp的核苷酸序列,通过两次RACE-PCR获得了橡胶树长2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名为HbF2KP。ORF Finde...
根据拟南芥、蓖麻及杨树果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因(F2KP)的核苷酸序列,使用橡胶树胶乳转录组数据库拼接到1条1 228 bp的核苷酸序列,通过两次RACE-PCR获得了橡胶树长2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名为HbF2KP。ORF Finder软件分析结果显示,该序列含有211 bp的5'端非编码区,173 bp的3'端非编码区,以及长度为2 244 bp的开放阅读框(ORF)。氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的激酶和酯酶结构域,属于具有双功能的果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶。生物信息学分析显示,HbF2KP蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域且属于亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用。实时荧光定量PCR分析表明,HbF2KP基因在光合组织及非光合组织中均有表达。对非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式进行分析,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理及死皮胁迫调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与橡胶烃的生物合成调控及死皮胁迫应答。此外,HbF2KP表达受部分植物激素或激素类似物如乙烯利(ET)、植物生长素(2,4-D)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控,但调控作用不明显。
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关键词
橡胶树
hbf2kp
基因克隆
基因表达
生物信息学
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题名
橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达
被引量:
4
1
作者
龙翔宇
何斌
曹冰
梁启福
方永军
阳江华
唐朝荣
机构
中国热带农业科学院橡胶研究所
海南大学农学院
出处
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第4期23-28,共6页
基金
国家高技术研究发展计划(2013AA102605)
国家自然科学基金项目(31170630
+2 种基金
31200624
31300570)
海南省自然科学基金项目(312029)
文摘
根据拟南芥、蓖麻及杨树果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶基因(F2KP)的核苷酸序列,使用橡胶树胶乳转录组数据库拼接到1条1 228 bp的核苷酸序列,通过两次RACE-PCR获得了橡胶树长2 629 bp的F2KP基因cDNA序列,命名为HbF2KP。ORF Finder软件分析结果显示,该序列含有211 bp的5'端非编码区,173 bp的3'端非编码区,以及长度为2 244 bp的开放阅读框(ORF)。氨基酸同源性分析发现,该蛋白含有保守的激酶和酯酶结构域,属于具有双功能的果糖-6-磷酸,2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶。生物信息学分析显示,HbF2KP蛋白无导肽酶切位点,不具有跨膜结构域且属于亲水蛋白,推测该蛋白可能在细胞质中发挥作用。实时荧光定量PCR分析表明,HbF2KP基因在光合组织及非光合组织中均有表达。对非光合库组织胶乳(产胶细胞的细胞质)中的表达模式进行分析,结果显示该基因表达受割胶、伤害处理及死皮胁迫调控,推测其在橡胶树胶乳糖代谢中发挥重要的调控作用,参与橡胶烃的生物合成调控及死皮胁迫应答。此外,HbF2KP表达受部分植物激素或激素类似物如乙烯利(ET)、植物生长素(2,4-D)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)及赤霉素(GA)的调控,但调控作用不明显。
关键词
橡胶树
hbf2kp
基因克隆
基因表达
生物信息学
Keywords
Hevea brasiliensis
hbf2kp
gene cloning
gene expression
bioinformatics analysis
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
S794.1 [农业科学—林木遗传育种]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
橡胶树糖代谢调控基因HbF2KP的克隆及表达
龙翔宇
何斌
曹冰
梁启福
方永军
阳江华
唐朝荣
《南京林业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2014
4
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统计分析
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