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橡胶树HbREF3基因的克隆及功能初步分析
1
作者
录亿隆
刘星
+2 位作者
张宇豪
刘开业
唐朝荣
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第3期491-498,共8页
橡胶延伸因子(REFs)是橡胶粒子上的一种主要膜蛋白,在橡胶生物合成途径中具有延伸橡胶烃和稳定橡胶粒子等重要作用。对橡胶树不同组织的转录组测序发现,HbREF3在胶乳中具有特异性的高表达,且其在HbREFs基因家族中表达水平也相对较高,仅...
橡胶延伸因子(REFs)是橡胶粒子上的一种主要膜蛋白,在橡胶生物合成途径中具有延伸橡胶烃和稳定橡胶粒子等重要作用。对橡胶树不同组织的转录组测序发现,HbREF3在胶乳中具有特异性的高表达,且其在HbREFs基因家族中表达水平也相对较高,仅次于表达丰度最高的HbREF1。HbREF3的开放阅读框为528 bp,编码175个氨基酸,对应的蛋白相对分子质量为19.62 kDa,理论等电点(pI)为5.28。系统进化树分析表明,HbREF3与橡胶树其他HbREFs虽均属于分组Ⅰ,但与HbREF1明显属于不同分支。HbREFs均含有REF保守结构域,但在保守motif的分布上,不同HbREFs蛋白含有保守motif数量不等,HbREF3比HbREF1多了一个motif。生信预测分析表明,该蛋白属于亲水性蛋白,无跨膜结构域,具有14个磷酸化位点。亚细胞定位分析发现HbREF3蛋白定位在内质网上,推测其可能参与橡胶粒子的形成和胶乳的再生。本研究结果为进一步阐明HbREF3基因在橡胶树胶乳再生中的作用机制奠定了基础。
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关键词
橡胶树
橡胶延伸因子
hbref
3
生物信息学分析
亚细胞定位
下载PDF
职称材料
巴西橡胶树产胶基因HbREF、HbHMGR1与MYCs转录因子互作
2
作者
党丹
翟金玲
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第13期4253-4258,共6页
天然橡胶主要来自巴西橡胶树,巴西橡胶树是海南省主要的经济作物之一。胶乳在乳管中合成储存,乳管数量影响胶乳产量。乳管分化一直被证明与茉莉酸信号途径相关,本实验室已在前期研究中鉴定了茉莉酸信号途径中的关键转录因子MYCs与G-box...
天然橡胶主要来自巴西橡胶树,巴西橡胶树是海南省主要的经济作物之一。胶乳在乳管中合成储存,乳管数量影响胶乳产量。乳管分化一直被证明与茉莉酸信号途径相关,本实验室已在前期研究中鉴定了茉莉酸信号途径中的关键转录因子MYCs与G-box顺式作用元件的互作,为了验证HbMYCs是否与含G-box(CACGTG)顺式作用元件的产胶相关基因互作,本研究克隆了两个产胶相关基因HbREF与HbHMGR1的全长启动子序列,并设计了相应的单荧光素酶报告基因实验,经生物信息学分析发现,2个基因的启动子上均含G-box(CACGTG)顺式作用元件,单荧光素酶报告基因实验的结果表明,HbREF和HbHMGR1分别与Hb MYC2、Hb MYC3、Hb MYC4互作,且受HbMYCs转录因子的正向调控,说明茉莉酸信号通路中的转录因子可以调控橡胶产排胶基因的表达,对阐明橡胶树产排胶机理具有重要意义。
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关键词
巴西橡胶树(Hevea
brasiliensis)
JA信号通路
HbMYCs
hbref
HbHMGR1
原文传递
题名
橡胶树HbREF3基因的克隆及功能初步分析
1
作者
录亿隆
刘星
张宇豪
刘开业
唐朝荣
机构
海南大学热带作物学院/天然橡胶省部共建协同创新中心
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022年第3期491-498,共8页
基金
国家自然科学基金项目(No.31825007)
海南大学高层次人才科研启动资金。
文摘
橡胶延伸因子(REFs)是橡胶粒子上的一种主要膜蛋白,在橡胶生物合成途径中具有延伸橡胶烃和稳定橡胶粒子等重要作用。对橡胶树不同组织的转录组测序发现,HbREF3在胶乳中具有特异性的高表达,且其在HbREFs基因家族中表达水平也相对较高,仅次于表达丰度最高的HbREF1。HbREF3的开放阅读框为528 bp,编码175个氨基酸,对应的蛋白相对分子质量为19.62 kDa,理论等电点(pI)为5.28。系统进化树分析表明,HbREF3与橡胶树其他HbREFs虽均属于分组Ⅰ,但与HbREF1明显属于不同分支。HbREFs均含有REF保守结构域,但在保守motif的分布上,不同HbREFs蛋白含有保守motif数量不等,HbREF3比HbREF1多了一个motif。生信预测分析表明,该蛋白属于亲水性蛋白,无跨膜结构域,具有14个磷酸化位点。亚细胞定位分析发现HbREF3蛋白定位在内质网上,推测其可能参与橡胶粒子的形成和胶乳的再生。本研究结果为进一步阐明HbREF3基因在橡胶树胶乳再生中的作用机制奠定了基础。
关键词
橡胶树
橡胶延伸因子
hbref
3
生物信息学分析
亚细胞定位
Keywords
Hevea brasiliensis
rubber elongation factor
hbref
3
bioinformatics analysis
subcellular localization
分类号
S794.1 [农业科学—林木遗传育种]
下载PDF
职称材料
题名
巴西橡胶树产胶基因HbREF、HbHMGR1与MYCs转录因子互作
2
作者
党丹
翟金玲
机构
海南大学热带农林学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第13期4253-4258,共6页
基金
国家自然科学基金(31860222)
海南大学世界一流学科建设经费项目与成果培育专项课题(RZZX201901)共同资助。
文摘
天然橡胶主要来自巴西橡胶树,巴西橡胶树是海南省主要的经济作物之一。胶乳在乳管中合成储存,乳管数量影响胶乳产量。乳管分化一直被证明与茉莉酸信号途径相关,本实验室已在前期研究中鉴定了茉莉酸信号途径中的关键转录因子MYCs与G-box顺式作用元件的互作,为了验证HbMYCs是否与含G-box(CACGTG)顺式作用元件的产胶相关基因互作,本研究克隆了两个产胶相关基因HbREF与HbHMGR1的全长启动子序列,并设计了相应的单荧光素酶报告基因实验,经生物信息学分析发现,2个基因的启动子上均含G-box(CACGTG)顺式作用元件,单荧光素酶报告基因实验的结果表明,HbREF和HbHMGR1分别与Hb MYC2、Hb MYC3、Hb MYC4互作,且受HbMYCs转录因子的正向调控,说明茉莉酸信号通路中的转录因子可以调控橡胶产排胶基因的表达,对阐明橡胶树产排胶机理具有重要意义。
关键词
巴西橡胶树(Hevea
brasiliensis)
JA信号通路
HbMYCs
hbref
HbHMGR1
Keywords
Brazilian rubber tree(Hevea brasiliensis)
JA signal pathway
HbMYCs
hbref
HbHMGR1
分类号
S794.1 [农业科学—林木遗传育种]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
橡胶树HbREF3基因的克隆及功能初步分析
录亿隆
刘星
张宇豪
刘开业
唐朝荣
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
2
巴西橡胶树产胶基因HbREF、HbHMGR1与MYCs转录因子互作
党丹
翟金玲
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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