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HdeA在细菌外膜囊泡环境下的原位NMR研究
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作者 王欢 陶志清 +4 位作者 姜国胜 张许 王冠 禾立春 刘买利 《波谱学杂志》 CAS 2024年第1期1-8,共8页
HdeA是一种定位于细菌周质的分子伴侣,在维持蛋白质稳态中起着重要的作用.以往对HdeA的研究主要是在体外条件下进行,限制了人们对HdeA在天然环境下发挥作用机制的理解.细菌外膜囊泡是细菌自发分泌到胞外环境的外膜囊泡,其内容物与周质... HdeA是一种定位于细菌周质的分子伴侣,在维持蛋白质稳态中起着重要的作用.以往对HdeA的研究主要是在体外条件下进行,限制了人们对HdeA在天然环境下发挥作用机制的理解.细菌外膜囊泡是细菌自发分泌到胞外环境的外膜囊泡,其内容物与周质环境相似.本研究将HdeA富集到细菌外膜囊泡(OMVs)中,通过核磁共振波谱研究HdeA在OMVs中的构象变化.结果表明,HdeA在其原位环境中表现出酸依赖性的构象变化.在低pH条件下HdeA主要通过S15、W16、T17、S27、T32、E36、G54、T57、C66、Q71、F74及D83等残基启动其分子伴侣功能.此外本研究也为原位研究其它周质分子伴侣的功能提供了新方法. 展开更多
关键词 原位核磁共振波谱 hdea 外膜囊泡 分子伴侣
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分子伴侣HdeA与底物蛋白SurA作用机制的模拟研究 被引量:2
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作者 周丹丹 于延庆 +2 位作者 吴昊 李艳妮 乔建军 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第3期242-252,共11页
分子伴侣HdeA与底物蛋白间的相互作用可帮助底物蛋白复性,这是肠道致病菌得以在酸性环境中幸存的重要原因之一.为探究HdeA发挥伴侣活性的作用机制,本研究采用分子对接和分子动力学的方法,模拟了HdeA与底物蛋白SurA间的相互作用,计算了... 分子伴侣HdeA与底物蛋白间的相互作用可帮助底物蛋白复性,这是肠道致病菌得以在酸性环境中幸存的重要原因之一.为探究HdeA发挥伴侣活性的作用机制,本研究采用分子对接和分子动力学的方法,模拟了HdeA与底物蛋白SurA间的相互作用,计算了二者的结合自由能.通过分析HdeA-SurA复合物体系的作用模式、氢键作用以及能量分解的结果,确定了HdeA与底物蛋白SurA结合时发挥重要作用的关键氨基酸残基.该研究结果为以后采用实验手段探究HdeA与底物蛋白之间的作用提供了重要的理论参考,同时为今后设计与开发HdeA的抑制剂提供了理论指导依据. 展开更多
关键词 hdea 分子伴侣 SurA 分子对接 分子动力学
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分子伴侣HdeA与HdeB的作用机制 被引量:4
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作者 于延庆 于志超 李艳妮 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第5期441-446,共6页
分子伴侣能够与其他蛋白质的不稳定构象相结合并使其稳定.它的功能之一是能够帮助蛋白质进行正确的折叠与组装.最新研究发现,在肠道致病菌的周质空间中存在着酸性条件下能帮助周质蛋白复性的分子伴侣HdeA和HdeB.HdeA在极端酸性的胃部环... 分子伴侣能够与其他蛋白质的不稳定构象相结合并使其稳定.它的功能之一是能够帮助蛋白质进行正确的折叠与组装.最新研究发现,在肠道致病菌的周质空间中存在着酸性条件下能帮助周质蛋白复性的分子伴侣HdeA和HdeB.HdeA在极端酸性的胃部环境中由二聚体迅速解离成具有伴侣活性的单体,HdeA单体能够和变性的底物蛋白结合防止它们酸诱导聚集,从而保护肠道致病菌安全到达肠道.本文对肠道致病菌的耐酸机制进行了总结,最后对HdeA和HdeB作用机制的研究近况进行综述,最后对HdeA和HdeB以后的研究方向进行了展望. 展开更多
关键词 分子伴侣 作用机制 分子伴侣hdea和HdeB
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银催化HDEA电化学发光法测定矿样中的痕量银 被引量:3
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作者 林金明 安镜如 《岩矿测试》 CAS CSCD 北大核心 1991年第1期13-16,共4页
在碱性介质中,痕量Ag(Ⅰ)对新试剂6-(2-羟基-4-二乙基氨苯偶氮)-2,3-二氢-1,4-酞嗪二酮(简称HDEA)的电化学发光具有显著的催化作用。基于此,提出了HDEA-KCI-KOH体系测定矿样中痕量Ag的新方法。方法的检测限为2.0×10^(-8)mol/L Ag,... 在碱性介质中,痕量Ag(Ⅰ)对新试剂6-(2-羟基-4-二乙基氨苯偶氮)-2,3-二氢-1,4-酞嗪二酮(简称HDEA)的电化学发光具有显著的催化作用。基于此,提出了HDEA-KCI-KOH体系测定矿样中痕量Ag的新方法。方法的检测限为2.0×10^(-8)mol/L Ag,线性范围为5.0×10^(-8)—3.0×10^(-6)mol/L Ag。采用巯基棉富集分离,应用本法测定一些矿样中的Ag,结果良好。 展开更多
关键词 矿物 样品 测定 电化学发光
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香港海鸥菌HdeA蛋白的原核表达及活性研究
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作者 钟轶 游晓星 李冉辉 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2015年第7期590-593,共4页
目的表达香港海鸥菌(Laribacter hongkongensis)分子伴侣蛋白HdeA并鉴定其保护功能,为解析其抗酸机制奠定基础。方法通过与相关蛋白进行同源性比较,在香港海鸥菌中找出编码HdeA的基因。以HdeA基因序列为基础,设计特异性引物,PCR扩增Hde... 目的表达香港海鸥菌(Laribacter hongkongensis)分子伴侣蛋白HdeA并鉴定其保护功能,为解析其抗酸机制奠定基础。方法通过与相关蛋白进行同源性比较,在香港海鸥菌中找出编码HdeA的基因。以HdeA基因序列为基础,设计特异性引物,PCR扩增HdeA基因,并将其连接到表达载体pET28a,构建的重组质粒pET28a-HdeA转化大肠埃希菌BL21(DE3),得到重组菌BL/pET28a-HdeA,用IPTG诱导表达目的蛋白并利用镍柱亲和层析纯化HdeA蛋白,采用光散射法分析HdeA蛋白的保护功能。结果通过Blast分析,从香港海鸥菌中找到编码HdeA的基因。以合成的特异性引物扩增出约315bp的HdeA片段,连接到原核表达载体pET28a后转化大肠埃希菌BL21,经IPTG诱导成功表达出HdeA蛋白,其分子质量单位为14.1ku,与理论值相符合。经His-tag亲和层析纯化,获得纯度较高的重组HdeA蛋白。光散射法检测分析HdeA蛋白能够减轻酸性条件下ADH蛋白聚集。结论纯化的重组HdeA蛋白在体外具有抗酸功能,为研究香港海鸥菌的抗酸机制奠定了基础。 展开更多
关键词 香港海鸥菌 hdea蛋白 克隆 表达
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内蒙古自治区宏观经济发展状况综合评价研究 被引量:5
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作者 王丽 马占新 马占英 《内蒙古科技与经济》 2005年第24期4-7,共4页
本文以数据包络分析方法为基础,应用文献[1]中的相关结论探讨了依据效率评价区域经济发展水平问题,并对内蒙古自治区1985~2003年的宏观经济发展效率进行了综合评价.经计算得出的结果表明该方法用于宏观经济发展的综合效率评价是可行的... 本文以数据包络分析方法为基础,应用文献[1]中的相关结论探讨了依据效率评价区域经济发展水平问题,并对内蒙古自治区1985~2003年的宏观经济发展效率进行了综合评价.经计算得出的结果表明该方法用于宏观经济发展的综合效率评价是可行的,评价结果在一定程度上能够反映内蒙古自治区的宏观经济发展情况. 展开更多
关键词 IDEA方法 hdea有效 hdea方法
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宏观经济发展状况综合评价的DEA方法 被引量:35
7
作者 马占新 唐焕文 《系统工程》 CSCD 北大核心 2002年第2期30-34,共5页
以 DEA方法为基础 ,应用文 [1]中的相关结论给出了一种用于区域经济发展评价的 DEA方法 ,并对某省 1987- 1995年的宏观经济发展状况进行了试评价。计算结果表明该方法用于宏观经济发展状况综合评价是有效的 ,评价结果能够反映该省宏观... 以 DEA方法为基础 ,应用文 [1]中的相关结论给出了一种用于区域经济发展评价的 DEA方法 ,并对某省 1987- 1995年的宏观经济发展状况进行了试评价。计算结果表明该方法用于宏观经济发展状况综合评价是有效的 ,评价结果能够反映该省宏观经济发展的实际情况。 展开更多
关键词 DEA方法 hdea方法 偏序集 宏观经济发展 可持续发展 中国
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我国区域经济发展不平衡性研究 被引量:25
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作者 夏万军 余功菊 《安徽师范大学学报(社会科学版)》 CSSCI 北大核心 2018年第4期111-121,共11页
文章利用截面和面板数据对我国区域经济发展不平衡性进行综合测度分析:首先基于1978-2016年各地区人均GDP数据利用泰尔指数对我国区域经济发展水平进行测度,而后基于我国30个地区2007-2016年的面板数据,在HDEA和SBM综合模型基础上得出... 文章利用截面和面板数据对我国区域经济发展不平衡性进行综合测度分析:首先基于1978-2016年各地区人均GDP数据利用泰尔指数对我国区域经济发展水平进行测度,而后基于我国30个地区2007-2016年的面板数据,在HDEA和SBM综合模型基础上得出我国四个区域30个省份的经济相对发展效率,并结合理论模型和静、动态面板模型对四个区域经济发展效益效率的影响机制进行了分析,结果表明:我国区域经济发展水平存在明显差异,特别是东、中、西部差异较大。对于区域经济效益效率整体上略呈W型,并且伴有一定的省际差异,东西及东中西部差距较大,而不同区域的经济发展效益效率的影响机制作用效果有所不同,文章从内部和外部两个因素给予分析,表明各区域之间应根据其实际情况对经济发展制定相应的政策,以此实现稳定、健康、高效的经济发展。 展开更多
关键词 区域经济 不平衡性 hdea、SBM模型 效率
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蛋白质之活细胞探究
9
作者 昌增益 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2021年第35期4524-4538,共15页
人类对蛋白质的认识过程经历了200多年,但大部分研究都在活细胞体之外开展.随着认识生命之手段和方法的不断更新与改进,科学家更加关注生命体内发生的事件.因此,从体外到体内,从定性到定量将成为蛋白质研究领域的新趋势.本文简要总结了... 人类对蛋白质的认识过程经历了200多年,但大部分研究都在活细胞体之外开展.随着认识生命之手段和方法的不断更新与改进,科学家更加关注生命体内发生的事件.因此,从体外到体内,从定性到定量将成为蛋白质研究领域的新趋势.本文简要总结了活细胞内蛋白质研究的现状以及我们实验室的部分代表性研究成果.首先介绍已经建立的主要方法体系,包括绿色荧光蛋白标记法、活细胞核磁共振波谱法、非天然氨基酸标记法等.之后,重点介绍非天然氨基酸标记方法体系,以及我们实验室对这一技术体系进行的改进,包括:创建用于在目标蛋白质中引入非天然氨基酸Bpa的LY928大肠杆菌菌株;建立将非天然氨基酸随机引入目标蛋白质的任何氨基酸残基位点的方法体系;建立直接在大肠杆菌基因组中对目标蛋白质编码基因进行碱基点突变的方法体系;开发单块胶可分析384种蛋白质样品的高通量聚丙烯酰胺凝胶电泳技术.为说明这种通过非天然氨基酸引入而开展活细胞内蛋白质研究体系的有效性,列举了我们实验室所获得的部分代表性成果:在研究细菌分裂关键蛋白质FtsZ动态组装机制时意外发现的、存在于停止分裂细胞中的、可逆亚细胞结构——复苏延迟体(regrowth delay body);揭示细菌ATP合酶复合体在细胞处于不同条件下实施独特的"换挡"活性调节机制;揭示一种参与细菌外膜蛋白新生肽链转运的超级蛋白质复合体的存在;揭示抗酸分子伴侣蛋白HdeA在极端酸性细胞条件下通过丧失其三维空间结构而保护包括中性分子伴侣蛋白在内的底物蛋白质的独特机制;揭示一直被认为具有双功能的DegP蛋白主要发挥蛋白质水解酶功能,不具明显的分子伴侣功能;揭示活细胞中小分子热休克蛋白响应温度变化而发生层级性结构和活性变化.最后,作者通过提出一系列有待回答的科学问题对在活细胞中探究蛋白质的前景进行了展望. 展开更多
关键词 非天然氨基酸介导的蛋白质活细胞光交联 高通量聚丙烯酰胺凝胶电泳 复苏延迟体 ATP合酶 蛋白质生成 抗酸分子伴侣蛋白hdea
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新试剂6-(2-羟基-4-二乙基氨苯偶氮)-2,3-二氢-1.4-酞嗪二酮的电化学发光研究
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作者 林金明 安镜如 《福州大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1991年第1期49-53,共5页
应用自制的ECL-1型电致化学发光仪,对新试剂6-(2-羟基-4-二乙基氨苯偶氮)-2.3-二氢-1,4-酞嗪二酮(HDEA)在Na2CO3-NaHCO3缓冲介质中的电化学发光行为作了研究.结果发现,当介质pH值为 ... 应用自制的ECL-1型电致化学发光仪,对新试剂6-(2-羟基-4-二乙基氨苯偶氮)-2.3-二氢-1,4-酞嗪二酮(HDEA)在Na2CO3-NaHCO3缓冲介质中的电化学发光行为作了研究.结果发现,当介质pH值为 10.54时,在一定的实验条件下,施加 1.7V (VS.SCE)三角波脉冲电压,体系的发光强度与HDEA浓度在5.0 × 10-9~1.0×10-6mol/L范围内呈线性关系,反应的检测限达1.0×10-9mol/L. 展开更多
关键词 试剂 hdea 电致化学发光 鲁米诺
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Posttranslational modulation on the biological activities of molecular chaperones 被引量:3
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作者 CHANG ZengYi Center for Protein Science,School of Life Science,National Laboratory of Protein Engineering and Plant Genetic Engineering,Peking University,Beijing 100871,China 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS 2009年第6期515-520,共6页
Molecular chaperones are a family of proteins that were first noticed to exist about 45 years ago from their increased transcription under heat shock conditions.As a result,the regulation of their encoding genes has b... Molecular chaperones are a family of proteins that were first noticed to exist about 45 years ago from their increased transcription under heat shock conditions.As a result,the regulation of their encoding genes has been subject to extensive studies.Recent studies revealed that the biological activities of molecular chaperones can also be effectively modulated at the protein level.The ways of modulation so far elucidated include allosteric effect,covalent modification,protein-protein interaction,and con-formational alteration induced by such macro-environmental conditions as temperature and pH.These latter aspects were reviewed here.Emphasized here is the importance of such immediate structural alterations that lead to an immediate activity increase,providing the immediate protection needed for the cells to survive the stress conditions. 展开更多
关键词 molecular CHAPERONE activity MODULATION SHSP HSP60 HSP70 HSP90 Hsp100 hdea DegP
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