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题名两种香椿不同时期嫩芽转录组测序分析花青素代谢差异
被引量:4
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作者
冉浩
李文华
刘常金
许雅荟
王丽萍
郭小诗
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机构
天津科技大学食品科学与工程学院
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出处
《分子植物育种》
CAS
北大核心
2022年第2期422-434,共13页
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基金
天津科技大学2019年大学生实验室创新基金项目(201909000009)资助。
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文摘
黑油椿和青油椿嫩芽颜色特征具有显著差异,黑油椿嫩芽花青苷含量最高可达同时期青油椿的5倍。本研究使用Illumina HiSeq^(TM)2000高通量测序平台对两种香椿四个时期的嫩芽进行转录组测序,探讨分析两种香椿花青素表达差异的相关基因。结果显示,共获得63437条Unigene,平均长度为1243 bp,有44705条被注释,其中4894条在各个数据库均被成功注释。KEGG分析获得花青素合成相关差异表达的关键基因中,黑油椿相对于青油椿上调表达的有苯丙氨酸解氨酶(PAL)、香豆素-CoA连接酶(4CL)、查尔酮合成酶(CHS)、类黄酮-3-羟化酶(F3’H)和花青素合酶(ANS),下调表达的为C3’H(CYP98A)和黄酮醇合酶(FLS)。此外,在香椿嫩芽转录组中,检测到了17839个简单重复序列(SSR)位点,单碱基重复序列最为丰富,占62.08%。试验结果为研究不同品种香椿嫩芽颜色表达差异原因、基因功能验证以及遗传改良奠定了理论基础。
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关键词
黑油椿
青油椿
转录组测序
花青素代谢
差异分析
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Keywords
heiyouchun
Qingyouchun
Transcriptome sequencing
Anthocyanin metabolism
Differential analysis
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分类号
S644.4
[农业科学—蔬菜学]
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