HBV基因型分析及B/C型共感染的血清病毒种群分析

为了解HBV大三阳青年妇女的HBV基因型及体内病毒种群特征,从19～35岁青年妇女HBV感染者血清样本中筛选出24例HBV血清学标志物检测结果为大三阳的样本进行HBV基因分型检测,14例为B型,9例为C型,1例为B/C基因型共感染。对14例大S蛋白基因通过特异性扩增、序列克隆和测序确认的分型结果与分型检测一致。发现的1例B/C共感染样本来自阿德福韦酯抗病毒治疗35周患者,大S蛋白基因序列分析显示10条序列中4条为B型,准种分散值为2.8;其6条为C型,准种分散值为0.6。α决定簇分析该患者体内病毒种群包含3种血清型。病毒种群分析结果提示本地区青年妇女HBV感染的基因型主要为B型和C型,B/C基因型共感染患者体内HBV病毒种群呈复杂的多基因型分布,不同基因型内部以准种形式存在。

乙型肝炎病毒大S蛋白基因纵向研究方法及应用

目的:建立乙型肝炎病毒(HBV)大S蛋白基因纵向研究方法,并将其应用于疾病进程中HBV的准种动态研究.方法:以2例HBV感染者(对象A,男,38岁;对象B,女,22岁.对象A研究期间未经任何抗病毒治疗,B则1年持续接受ADV抗病毒药物治疗)体内不同时期的血清样本核酸提取物为模板,通过特异性扩增获取病毒大S蛋白基因序列并克隆测序,依据生物信息学方法对发生于序列结构不同区域的变异进行分析,利用比对数据对不同样本HBV准种予以描述与评价.结果:所得24条HBV大S蛋白基因序列中2条源于对象B样本的基因序列PreS2编码区存在30nt的缺失,其余22条序列大小均为1203bp;24条序列的HBV基因型均为C型.对象A大S蛋白基因序列分散值DA、DB、DC分别为:0.29、0.16、0.23,对象B则为0.80、2.30、1.82.来自对象A的全部10条HBV大S蛋白基因序列内部的"a"决定簇与参考基因完全一致;对象B的14条序列期初有2条(29%)期终有6条(86%)存在G145R突变,期终序列中有1条序列"a"决定簇内发现4个位点的突变.结论:人体内感染HBV以准种形式存在且可以用分散值DA、DB、DC对其进行描述,并应用于HBV准种动态的纵向研究.而抗病毒药物ADV的1年期治疗可使本例HBV准种分散性增高,可能增加本例耐药性突变出现的风险,同时增加本例"a"决定簇的变异出现.

Excel软件规划求解功能拟合与优选血清乙型肝炎病毒大蛋白质量浓度标准曲线

目的探讨拟合和优选血清乙型肝炎病毒大蛋白(HBV-LP)质量浓度标准曲线的一种简便的实用方法。方法HBV-LP标准品吸光度检测采用酶联免疫吸附试验,利用Excel软件规划求解功能对HBV-LP标准品质量浓度与吸光度进行四参数方程模型、线性模型、对数线性模型、二次多项式模型、三次多项式模型、S模型的曲线拟合,根据各回归模型决定系数的大小来确定测定血清HBV-LP质量浓度的最适标准曲线。结果HBV-LP标准品质量浓度与吸光度的散点图呈非线性趋势;四参数方程模型、线性模型、对数线性模型、二次多项式模型、三次多项式模型、S模型的回归方程均有意义(P<0.001),决定系数分别为0.9995、0.9249、0.8765、0.9975、0.9989、0.9799,其中四参数方程模型、二次多项式模型、三次多项式模型、S模型的拟合精度较好,以四参数方程模型最佳。结论Excel软件规划求解是一种具有较高临床实用价值的血清HBV-LP质量浓度标准曲线的拟合与优选方法;四参数方程模型的拟合标准曲线是测定血清HBV-LP质量浓度的最适标准曲线。

SPSS和Excel对血清乙型肝炎病毒大蛋白浓度标准曲线的拟合效果比较

目的:考察SPSS和Excel对血清乙型肝炎病毒(HBV)大蛋白(-LP)浓度标准曲线的拟合效果。方法:HBV-LP标准品吸光度检测采用酶联免疫吸附试验,分别用SPSS软件曲线估计和Excel软件规划求解对HBV-LP标准品浓度与吸光度进行线性模型、对数线性模型、二次多项式模型、三次多项式模型的曲线拟合,比较两种拟合方法的各回归模型拟合效果的一致性,并根据各回归模型决定系数的大小来优选血清HBV-LP浓度标准曲线回归模型。结果:HBV-LP标准品浓度与吸光度的散点图呈非线性趋势;两种拟合方法的线性模型、对数线性模型、二次多项式模型、三次多项式模型的回归方程均有意义(P<0.001),其决定系数小数点后四位是一致的;其中二次多项式模型、三次多项式模型的拟合精度较高,决定系数均大于0.95。结论:Excel软件规划求解拟合血清HBV-LP浓度标准曲线的效果与SPSS高度一致,是一种临床实验室定量标准曲线拟合与优选的有效方法。