从中国非甲-庚型肝炎病人中克隆到TT病毒样DNA序列

从中国非甲－庚型肝炎病人中克隆到ＴＴ病毒样ＤＮＡ序列张军１杨海杰１苏智军２张奕返２林长青１黄鹤１郭庆１王颖１曾定１夏宁邵１（１厦门大学肿瘤细胞工程国家专业实验室厦门３６１００５２福建省泉州市第一医院泉州３６２０００）肝炎是严重危害我国人民身体健康的疾...

庚型肝炎病毒5’端非编码区cDNA的序列分析

为了解国CBV-C/HCV株的基因序列与国外分离株的同源性状况，对我国GBV-C/HCV的5’端非编码区（5’NCR）。cDNA进行了序列测定。参考国外发表的序列资料，在相对保守的5’NCR设计两对HGV特异性引物。采用热变性法提取云南省一个静脉吸毒者血浆中的GBV－C／HGVRNA逆转录为cDNA后进行巢式聚合酶链反应（PCR）扩增，获得238bp的片段。PCR产物纯化后直接经双脱氧链末端终止法测定核苷酸序列。与国外分离株比较，同源性为86.36％～90.9t％，微分区域变异较大。结果表明，所扩增片段属于GBV－C／HGV基因，所测序列可为引物设计据供依据。对核酸变异性分析有一定意义。

广东地区GBV-C/HGV5′NCR区序列变异的研究

目的 了解广东地区GBV -C/HGV 5′NCR区的序列变异情况。方法 以GBV -C和HGV的 5′NCR区完全同源的序列设计合成引物用于套式RT -PCR。从广东地区的 10例GBV -C/HGV感染者血中扩增了 10个序列 ,分别克隆至pUC19或pT -Adv载体。以 3 5S标记的双脱氧链末端终止法对这 10个序列分别进行正反两个方向的序列测定。结果 10株序列相互间同源性最大为 10 0 % ,最小为 84 4%。与Genbank所载 3个标准株的相应序列比较 ,其同源性最大为89 4% ,最小为 83 9%。与国内周育森报道的相应序列比较 ,两者之间的同源性最大为 96 1% ,最小为 85 0 %。比较还发现 ,这 10株序列的起始处有一段 3 8nt的区域与上述标准序列相比变异比较大 ,其与标准序列的同源性最高只有 79 0 % ,最低为 60 5 %。其中 9株相互间的这一 3 8nt序列的同源性则高达 92 %～ 10 0 %。结论 广东地区流行的庚型肝炎病毒大多带有HGV的特殊点。少数为GBV

山东人群TTV感染状况及TTV山东株部分基因序列分析

1997-10 Nishizawa et al发表了第一篇关于人类肝炎相关DNA病毒基因,暂命名为输血传播病毒(transfusion transmitted virus,TTV)的论文,周育森et al在国内首先测定了中国人TTV部分基因克隆序列,迄今国内少数实验室也相继开展了TTV感染的分子流行病学、临床和实验研究。初步研究结果表明,TTV感染同输血或血液制品密切相关,可能是导致肝功长期损害ALT异常又一重要致病因子,为探讨山东地区TTV感染存在和基因变异的情况及TTV在人类肝炎中作用和地位。我们以套式聚合酶链反应(nested-PCR)法,对输血后丙型肝炎和非甲～庚型肝炎患者进行TTV检测,并对部分病例进行序列分析,现将结果报告如下。

华南地区HGV的流行状况和同源性分析

目的了解华南地区庚型肝炎病毒（ＨＧＶ）的流行状况及ＨＧＶ不同株和不同基因区的同源性。方法采用逆转录聚合酶链反应技术（ＲＴ－ＰＣＲ）检测来自广东、香港、云南的不同人群血清标本共１９９１份。对其中２０份的５端非编码区（５ＵＴＲ）２３８ｂｐ和３份非结构蛋白５区（ＮＳ５）６２１ｂｐ进行了序列测定和同源性分析。结果一般人群ＨＧＶＲＮＡ阳性率为（０．７３～１．３４）％，献血员（２．５２～２．９０）％，静脉吸毒者１７．８６％，血液透析患者１４．１３％，接受骨髓移植者４１．６７％，在非甲～戊型肝炎病人为２５．３０％，肝细胞癌１４．４８％，乙型肝炎７．２２％，丙型肝炎（８．３３～１６．１３）％。不同株５ＵＴＲ同源性介乎（９０．４０～１００）％；不同株ＮＳ５区核苷酸同源性（９３．３０～９４．００）％，氨基酸为（９７～９９．２）％。结论接受骨髓移植、血液透析、静脉吸毒者，乙型、丙型、非甲～戊型肝炎病人及肝细胞癌患者是ＨＧＶ的高感染人群。不同ＨＧＶ株存在一定的地区性差异；同一地区不同人群的ＨＧＶ株变异不明显；

中国大陆庚型肝炎病毒NS区部分基因序列分析及变异的初步研究

目的研究中国庚型肝炎患者分离的病毒基因的特异性及变异规律。方法应用逆转录－巢式聚合酶链反应（ＰＣＲ）技术从１６例庚型肝炎病毒（ＨＧＶ）感染住院病人血清中扩增了ＨＧＶＮＳ５区部分基因片段（１４１ｎｔ）。经纯化后采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。结果观察到在ＨＧＶＮＳ５区第７８２０－７９６０核苷酸之间的５′端较３′端核苷酸及其编码氨基酸变异率高。与Ｌｉｎｎｅｎ等报道的美国株ＨＧＶ相比，中国人ＨＧＶＮＳ５区核苷酸的变异主要集中在ＨＧＶＮＳ５工第７８２４，７８４５～７８６０，７８９２，７９１４，７９１７和７９３５核苷酸位点及区域，各个核苷酸位点的变异率在０～８９．５％，与美国株相比核苷酸序列的同源性为８３．６％～９５．７％，平均８９．６％；氨基酸为８３．０％～１００％，平均为９１．２％。在７９３３核苷酸位点与美国株相比变异率为９３．７％。结论中国人群之间ＨＧＶＮＳ５区部分基因及其推测编码蛋白较保守，但与美国株有明显差别。不同硷基在序列中呈散在分布，而在某些位点虽与美国株相比变异很大，但中国人群之间离散度较小，ＨＧＶ核酸的变异可能与地域因素有关。

庚型肝炎病毒广东株与云南株5′端非编码区的比较

目的:明了中国不同地区(包括广东与云南)庚型肝炎病毒(HGV)株5′端非编码区(NCR)序列的差异。方法:采用逆转录聚合酶链反应扩增 HGV 5′NCR cDNA 片段,产物为238bp,纯化后直接测定核苷酸序列。结果:HGV 广东株与云南株5′NCR 的同源性为96.97%,他们与国外株的同源性介乎86.36%～90.91%。结论:广东株与云南株5′NCR 的同源性较大,与国外分离株的同源性较小;不同碱基在序列中呈散在分布;HGV 核酸变异可能与地域因素有关。