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基于ITS序列分析的赤潮异弯藻(Heterosigma akashiwo)分子鉴别
被引量:
6
1
作者
梁斌
陈斌
+1 位作者
洛昊
郭皓
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期107-112,共6页
对五株赤潮异弯藻核糖体转录单元内间隔区(ITS区)进行了PCR扩增和序列测定,并结合GenBank中收录的所有赤潮异弯藻ITS序列信息,比较了它们的遗传距离和相似系数,同时结合GenBank中发布的针胞藻纲其他三个属的代表种ITS序列信息,采用邻接...
对五株赤潮异弯藻核糖体转录单元内间隔区(ITS区)进行了PCR扩增和序列测定,并结合GenBank中收录的所有赤潮异弯藻ITS序列信息,比较了它们的遗传距离和相似系数,同时结合GenBank中发布的针胞藻纲其他三个属的代表种ITS序列信息,采用邻接法(neighbour-joining,NJ)和最小进化法(minimum evolution,ME)构建系统发育树。结果表明,五株赤潮异弯藻ITS全序列总长度及碱基组成完全一致,均为538 bp,与GenBank中收录的四株赤潮异弯藻仅有一个碱基不同,遗传距离和相似系数分别为0.002和0.980,而与其他赤潮异弯藻ITS序列完全相同,遗传距离和相似系数分别为0.000和1.000。用两种方法构建的系统发育树结构完全一致,赤潮异弯藻属与海洋卡盾藻属亲缘关系较近,而与另外两属的亲缘关系较远。
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关键词
赤潮异弯藻
ITS
分子鉴定
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职称材料
题名
基于ITS序列分析的赤潮异弯藻(Heterosigma akashiwo)分子鉴别
被引量:
6
1
作者
梁斌
陈斌
洛昊
郭皓
机构
国家海洋环境监测中心
大连水产学院生命科学与技术学院
出处
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008年第5期107-112,共6页
基金
国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室基金资助项目(200504)
文摘
对五株赤潮异弯藻核糖体转录单元内间隔区(ITS区)进行了PCR扩增和序列测定,并结合GenBank中收录的所有赤潮异弯藻ITS序列信息,比较了它们的遗传距离和相似系数,同时结合GenBank中发布的针胞藻纲其他三个属的代表种ITS序列信息,采用邻接法(neighbour-joining,NJ)和最小进化法(minimum evolution,ME)构建系统发育树。结果表明,五株赤潮异弯藻ITS全序列总长度及碱基组成完全一致,均为538 bp,与GenBank中收录的四株赤潮异弯藻仅有一个碱基不同,遗传距离和相似系数分别为0.002和0.980,而与其他赤潮异弯藻ITS序列完全相同,遗传距离和相似系数分别为0.000和1.000。用两种方法构建的系统发育树结构完全一致,赤潮异弯藻属与海洋卡盾藻属亲缘关系较近,而与另外两属的亲缘关系较远。
关键词
赤潮异弯藻
ITS
分子鉴定
Keywords
heterosigma akshiwo
ITS
molecular identification
分类号
Q949.2 [生物学—植物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于ITS序列分析的赤潮异弯藻(Heterosigma akashiwo)分子鉴别
梁斌
陈斌
洛昊
郭皓
《海洋学报》
CAS
CSCD
北大核心
2008
6
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职称材料
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参考文献
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