山核桃EST-SSR引物的筛选及通用性分析

为了研究核桃EST序列的通用性以及山核桃的遗传多样性,从NCBI数据库的核桃EST序列中设计了20对引物,并从中筛选出6对,对24份山核桃以及27份核桃样品进行分析,共检测到46个位点,其中多态性位点41个。利用Popgen32软件对6组引物进行分析。结果表明,观察等位基因数(N a)平均为1.869 6,有效等位基因数(N e)平均为1.623 4,基因多样性指数(H)平均为0.344 7,Shannon信息指数(I)平均为0.502 3。采用UPGMA法进行聚类分析,在相似系数为0.73时所有样品可明显区分为2个类群,说明由核桃EST筛选出的EST-SSR引物具有较好的通用性,可用于山核桃遗传分析、系统分类以及品种鉴定。

基于种子发育过程RNA-Seq的山核桃SSR位点分析

本研究基于山核桃种子发育过程胚和胚乳转录组测序数据,采用MISA软件检测从中所得110 959条Unigene中的SSR位点,并与发育雌花芽中所得的SSR位点数据进行了比较,旨在为今后山核桃多态SSR标记的筛选、开发与应用提供借鉴。分析发现,种子RNA-Seq数据中含有SSR位点的Unigene占23.76%,其中单核苷酸(Mononucleotide,59.62%)和二核苷酸(Dinucleotide,32.07%)重复是山核桃中主要的SSR重复类型;SSR重复单元的重复次数分布在5~24次之间,其中5~9次重复SSR位点有11 862个,占总数的36.62%;10~14次重复的SSR位点有15 286个,占总数的47.19%;获得了11 883对可供筛选的SSR引物;并发现同一物种不同器官SSR的分布是有所差别的。

生草提高山核桃林土壤有机碳含量及微生物功能多样性

山核桃（Carya cathayensis）是中国特有的高档干果和木本油料树种,但高强度经营导致林地土壤性质的改变,为了解生草对土壤的修复效果,在山核桃主产区设置了紫云英（Astragalus sinicus）、油菜（Brassica campestris）、黑麦草（Lolium perenne）和免耕4种处理,对土壤有机碳及微生物功能多样性进行分析。结果表明,不同生草栽培后,山核桃林地土壤总有机碳（total organic carbon,TOC）质量分数显著增加,与免耕相比,种植油菜、黑麦草、紫云英4 a后土壤TOC分别提高了23.12%,26.61%和24.74%,增加的组分以羰基碳为主,但并未改变土壤碳库的稳定性;同时也显著提高了林地土壤微生物量碳（microbial biomass carbon,MBC）和水溶性有机碳（water-soluble organic carbon,WSOC）的质量分数,MBC增加了138.61%~159.68,WSOC提高了56.24%~69.47%%。3种生草的土壤微生物活性（average well color development,AWCD）显著高于免耕,微生物多样性指数（Shannon index,H）和均匀度指数（evenness index,E）则表现为油菜、紫云英处理显著高于免耕。研究表明,生草栽培能有效提高林地土壤TOC质量分数和微生物功能多样性,为山核桃林地土壤修复和科学管理提供参考。