槲皮素、山萘酚与Cu^(2+)配位特性的计算化学解析

在分离介质中添加配位剂可提高分离效率。利用MVD2007软件中的Grid计算程序包,应用分子力场的计算模型模拟了Cu2+与处于最低能量构象的山萘酚、槲皮素等黄酮类化合物的配位相互作用,得到了Cu2+与山萘酚、槲皮素等分子间的作用力场势能曲面和相对结合能。通过对山萘酚、槲皮素与Cu2+相对结合能的比较,并与高效液相色谱实验结果进行对照分析,得到的研究结果为Cu2+与山萘酚的配位结合要优于其与槲皮素的配位结合。模拟计算与实验结果具有很好的相关性。

量子化学中的高性能计算

高性能计算在化学的计算模拟中有着广泛的应用.本文回顾了量子化学并行计算方法的现状,从量子化学的基本原理出发,阐述了不同量子化学计算方法的特点、软件技术和并行实现,并展望了未来的发展.

计算化学在生命科学中的应用

计算化学主要是运用物理和化学基本原理结合计算机技术来解决化学问题。随着计算机技术的发展和计算软件的日益完善,计算化学在生物、药物研发和材料等领域取得了广泛的应用。本文简单综述了计算化学的理论方法及其在生命科学领域的应用,并介绍了高性能计算在生命科学中的应用。

基于网络的新型虚拟研究组织——计算化学虚拟实验室

2004年,一批来自国内外20多个单位的化学家和计算数学、信息技术科研工作者,在中国科学院计算机网络信息中心联合组建了一个新型的基于网络协同工作的虚拟研究组织——计算化学虚拟实验室。本文介绍了它的发展历程及长期发展目标,并总结了自成立以来在科学研究、自主软件开发和国内外学术交流等方面取得的突出成果。文章最后展望了实验室在‘十一五'期间的工作和任务。