22株猪瘟病毒E2基因部分编码序列的序列分析

利用RT PCR方法获得了 1 3株猪瘟病毒分离株、石门系强毒、中国C株及法国温度敏感株Thiverval株的E2基因部分编码序列的扩增片段 ,并对其进行了测序 ,得到了 2 5 1bp的E2基因部分编码序列。利用DNAStar软件对其中 2 2 4bp的片段进行了序列分析 ,并与已发表的Alfort、Brescia等毒株进行比较 ,结果 1 3株猪瘟分离株所测片段均为猪瘟病毒E2基因的序列 ,与石门系强毒的序列相比所有毒株的碱基替换随机地分布于整个序列 ,无碱基缺失和碱基插入。其中变化较大的区域位于序列的 3′端。 2 2株HCVE2基因部分编码序列的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :78 1 %～ 1 0 0 %、 78 4%～ 1 0 0 % ,其中 1 3株猪瘟病毒流行毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :78 1 %～ 1 0 0 %、 78 4%～ 1 0 0 % ,4株 70～ 80年代分离的毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :79 0 %～ 88 3%、 81 1 %～87 8% ,9株 90年代分离的毒株的核苷酸及氨基酸同源性范围分别为 :80 8%～ 1 0 0 %、83 8%～ 1 0 0 % ;

猪瘟流行毒E2基因部分编码序列的分析与比较

利用RT-PCR方法获得16个猪瘟流行毒株、5株弱毒疫苗株和外来的4株猪瘟E2基因部分编码序列的扩增片断,并对其进行测序,获得659bp含E2基因N段A、B、C、D四区域的编码序列。利用DNAstar软件对其中616bp的片段进行序列分析,并与Genebank中的Alfort﹑Brescia﹑HCLV﹑Shimen等毒株进行比较,结果20株病毒所测序列均为猪瘟E2基因序列,所有毒株碱基替换随机分布于整个序列,部分毒株出现碱基缺失现象。序列分析结果表明近期流行的毒株不仅与50年代流行的Shimen株、现用的疫苗株距离较远,而且流行毒株呈不同亚群方向演变。本研究所测的20株流行株E2基因N端6个与C端的2个半胱氨酸(Cys)均未发生变异,但其他位点的核甘酸变异与缺失,引起各区的抗原表位呈现不同程度的变异。

不同批猪瘟活疫苗中猪瘟兔化弱毒E2基因主要抗原编码区序列分析

对 1 2批猪瘟活疫苗中的猪瘟兔化弱毒病毒 ,以 RT- PCR获得了 E2基因的主要编码区的大约 2 5 0 bp大小的节片 ,在 DNA star上对这些节片的 2 1 1 pb进行了测序 ,观察到这些节片的编码序列高度同源性。其核苷酸序列和氨基酸序列有 98.1 %～ 1 0 0 %相同 ,其中 9批完全一致 ,结果表明猪瘟兔毒疫苗株的分子结构极其稳定。