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火龙果HuABAR的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
被引量:
2
1
作者
汤纬玮
王庆竹
+1 位作者
李慧平
文晓鹏
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期18-24,共7页
在前期利用SSH筛选到抗旱相关基因HuABAR的Unigene序列的基础上,进行了HuABAR的全长cDNA克隆、生物信息学分析及亚细胞定位。结果表明:HuABAR基因cDNA全长为1 239bp,5′-UTR为264bp,3′-UTR为414bp,完整开放阅读框(ORF)共561bp,编码187...
在前期利用SSH筛选到抗旱相关基因HuABAR的Unigene序列的基础上,进行了HuABAR的全长cDNA克隆、生物信息学分析及亚细胞定位。结果表明:HuABAR基因cDNA全长为1 239bp,5′-UTR为264bp,3′-UTR为414bp,完整开放阅读框(ORF)共561bp,编码187个氨基酸;生物信息学分析显示,HuABAR基因编码蛋白具有典型的SRPBCC结构域,并与PYR1/PYLs(pyrabactin resistance 1/PYR1like)家族具有较高的相似性;HuABAR在干旱、高温(42℃)和低温(4℃)等逆境胁迫下显著上调表达,并在干旱胁迫5d、高温3d时表达量最高,低温处理5d内,表达量持续上升;通过PEG介导法瞬时转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,发现该基因定位于细胞质,与已报道的其他PYR1/PYLs家族基因一致。因此,HuABAR基因可能在火龙果干旱胁迫应答中发挥重要作用。
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关键词
火龙果
非生物胁迫
脱落酸受体基因
生物信息学分析
亚细胞定位
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职称材料
题名
火龙果HuABAR的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
被引量:
2
1
作者
汤纬玮
王庆竹
李慧平
文晓鹏
机构
贵州大学农业生物工程研究院/生命科学学院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室
出处
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第5期18-24,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31760566)
文摘
在前期利用SSH筛选到抗旱相关基因HuABAR的Unigene序列的基础上,进行了HuABAR的全长cDNA克隆、生物信息学分析及亚细胞定位。结果表明:HuABAR基因cDNA全长为1 239bp,5′-UTR为264bp,3′-UTR为414bp,完整开放阅读框(ORF)共561bp,编码187个氨基酸;生物信息学分析显示,HuABAR基因编码蛋白具有典型的SRPBCC结构域,并与PYR1/PYLs(pyrabactin resistance 1/PYR1like)家族具有较高的相似性;HuABAR在干旱、高温(42℃)和低温(4℃)等逆境胁迫下显著上调表达,并在干旱胁迫5d、高温3d时表达量最高,低温处理5d内,表达量持续上升;通过PEG介导法瞬时转化拟南芥原生质体进行亚细胞定位分析,发现该基因定位于细胞质,与已报道的其他PYR1/PYLs家族基因一致。因此,HuABAR基因可能在火龙果干旱胁迫应答中发挥重要作用。
关键词
火龙果
非生物胁迫
脱落酸受体基因
生物信息学分析
亚细胞定位
Keywords
Hylocereus undatus
abiotic stress
huabar
bioinformatics analyses
subcellular localization
分类号
S667.903.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
火龙果HuABAR的克隆、生物信息学分析及亚细胞定位
汤纬玮
王庆竹
李慧平
文晓鹏
《华中农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
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