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题名黄瓜种质资源遗传多样性及其亲缘关系的AFLP分析
被引量:67
- 1
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作者
李锡香
朱德蔚
杜永臣
沈镝
孔秋生
宋江萍
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机构
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
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出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2004年第3期309-314,共6页
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基金
北京市自然科学基金资助项目 ( 6992 0 2 3 )
国家基础性工作项目 ( 2 0 0 2JCXGZ -19)
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文摘
采用AFLP分子标记技术 ,对中国黄瓜种质资源遗传多样性及其与外来种质的关系进行了分析 ,结果表明 8对AFLP引物在 70份黄瓜种质中共扩增出 4 2 5条带 ,多态性带的比例为 6 6 %。供试黄瓜种质的平均期望杂合度为 0 376 ,中国种质的平均期望杂合度为 0 387,明显高于国外种质的 0 2 91。西双版纳黄瓜和印度野生黄瓜具有一些栽培种质没有的特异位点 ,中国栽培种质的特异位点多于外来栽培种质 ,后者也有一些中国栽培种质没有的特异位点。聚类分析将 70份种质分为三大组群 ,即西双版纳黄瓜 (CucumissativusL .var.xishuangbannanesisQietYuan)组群 ,C .sativusvar.hardwickii野生黄瓜组群和栽培黄瓜组群。西双版纳黄瓜与栽培黄瓜的距离最远 ,与野生黄瓜次之。按一定的遗传距离可以将中国和外来栽培种质分开。大多数华南型和华北型种质归属于不同的亚组。
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关键词
黄瓜
种质资源
遗传多样性
aflp分子标记
聚类分析
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Keywords
Cucumis sativus L.
germplasm resources
genetic diversity
aflp marker
cluster analysis
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分类号
S642.2
[农业科学—蔬菜学]
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题名野生哲罗鱼种质资源遗传多样性的AFLP分析
被引量:25
- 2
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作者
佟广香
匡友谊
尹家胜
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机构
农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点开放实验室
中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
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出处
《中国水产科学》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第6期833-841,共9页
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基金
黑龙江水产研究所基本科研专项资金(2007HSYZX-SJ-15)
(2008HSYZX-SJ-08)
+1 种基金
农业部淡水鱼类遗传育种和养殖生物学重点实验室项目(BZ2007-02)
国家"十五"科技攻关计划项目(2004BA526B0116)
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文摘
目前哲罗鱼(Hucho taimen)处于濒危状态,野生样品采集较困难,因此对其种群遗传结构了解甚少。本研究应用7对AFLP引物对5个野生哲罗鱼群体(104个体)进行了扩增和遗传结构分析。结果显示7对引物共扩增出193个多态位点,多态位点比率为70.18%;多态性位点数(AP)、多态性位点比率(P)、观测等位基因(Na)、有效等位基因(Ne)、Nei's基因多样性指数(H)、Shannon's信息指数(I)和遗传距离(D)揭示的规律一致,在5个群体中上述指标从大到小依次均为虎头江段2002、抓吉江段、海青江段、虎头江段2006、呼玛河,H在0.148~0.1953之间,I在0.2215~0.2913之间,5个群体的遗传多样性均偏低;且遗传距离(D)、遗传相似度(S)、遗传分化度(Gst)、基因流(Nm)和聚类结果显示5个群体间的基因交流少,遗传分化程度均很大,并在一定程度上存在近亲交配的现象。以上结果表明,哲罗鱼资源量的减少已经影响了其种群遗传多样性,保护野生哲罗鱼资源已迫在眉睫,应采取及时有效的措施对野生哲罗鱼资源进行保护以期恢复哲罗鱼资源。
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关键词
哲罗鱼
种质资源
遗传多样性
aflp
聚类分析
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Keywords
hucho taimen germplasm resource genetic diversity aflp cluster analysis
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分类号
S91
[农业科学—水产科学]
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题名云南芋种质资源遗传多样性的AFLP分析
被引量:18
- 3
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作者
沈镝
朱德蔚
李锡香
宋江萍
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机构
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
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出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2005年第3期449-453,共5页
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基金
农业部蔬菜遗传与生理重点开放实验室资助项目
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文摘
采用荧光标记引物的AFLP分子标记技术,用筛选出的“3+2”引物组合,对48份云南芋种质进行遗传多样性分析,3对引物共扩增出184个DNA位点,平均每对引物可检测出56.3个多态性位点,多态性位点高达91.8%,云南芋种质资源在DNA分子水平上表现出极为丰富的遗传多样性。聚类分析表明:野生种质和栽培种质的亲缘关系较远,栽培种质基于AFLP标记的分类结果与形态性状基本一致,少数材料差异较大。
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关键词
芋
种质资源
遗传多样性
aflp
聚类分析
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Keywords
Taro
germplasm resource
genetic diversity
aflp
cluster analysis
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分类号
S632.3
[农业科学—蔬菜学]
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题名全国7省本地早橘基因组间相关性的AFLP分析
被引量:5
- 4
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作者
付春华
陈方永
邓秀新
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机构
华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室国家农作物分子育种中心
浙江省农业科学院柑橘研究所
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出处
《遗传》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第3期268-272,共5页
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基金
国家自然科学基金(编号:30000117)资助~~
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文摘
采用AFLP分子标记对全国7省的12份本地早橘资源进行遗传多样性分析。使用了28对选择性引物组合,共扩增出882个遗传位点,其中192条(21.8%)为多态性位点;以黄岩本地早橘为对照,各地的本地早橘的多态性位点数不多(3.5%~10.54%),且来源于浙江省外的本地早橘样品的AFLP多态性位点数要多于浙江省内的,说明区域生态差异对遗传多样性有着一定的影响。对12个样品进行聚类分析结果表明,样品间的遗传距离最大为0.229,说明差异不大,引种后的变异率不高。这些结果有助于揭示其遗传变异与生态条件的关系,对柑橘品种的遗传改良提供参考意见。
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关键词
本地早橘
种质资源
遗传多样性
aflp
聚类分析
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Keywords
Citrus succosa hort. Ex Tanaka
germplasm resources
aflp
genetic diversity
cluster analysis
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分类号
S666.2
[农业科学—果树学]
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题名山东核桃主要分布区种质资源遗传多样性AFLP分析
被引量:4
- 5
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作者
王磊
解孝满
李文清
韩彪
刘丹
韩庆军
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机构
山东省林木种质资源中心
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出处
《西北林学院学报》
CSCD
北大核心
2014年第3期113-118,124,共7页
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基金
山东省农业良种工程重大课题(鲁农良字[2010]6号)
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文摘
利用AFLP技术对山东省核桃主要分布区收集的55份核桃材料进行遗传多样性分析。结果表明,9对AFLP引物共扩增出566条谱带,其中440条为多态性条带,占总条带数的77.82%。聚类分析表明,材料间的遗传相似系数变幅为0.67-0.86;位点多态性信息含量(PIC)变幅为0.705-0.904,平均值为0.786;在遗传相似系数0.738水平上,55份核桃种质资源可聚成3大类。AFLP标记揭示出该55份核桃各群体之间存在较大遗传变异,各地区群体内遗传相似系数较高。
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关键词
核桃
种质资源
遗传多样性
aflp
聚类分析
主坐标分析
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Keywords
Juglans regia
germplasm resource
genetic diversity
aflp
cluster analysis
principal coordinate analysis
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分类号
S759.3
[农业科学—森林经理学]
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题名短柄乌头遗传多样性的AFLP分析
被引量:7
- 6
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作者
杜春华
普春霞
刘小莉
杨礼攀
张爱丽
钱子刚
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机构
云南省药物研究所云南白药集团创新研发中心
云南中医学院
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出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第2期439-443,共5页
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文摘
目的对濒危药用植物短柄乌头Aconitum brachypodum遗传多样性进行研究。方法选用3对引物对短柄乌头4个自然居群105个样品进行了AFLP分析,利用POPGENE32、MEGA4、NTSYS等生物统计软件进行相关参数计算和聚类分析。结果在短柄乌头物种居群间的遗传多样性水平上,多态位点百分率为80.57%,Nei’s基因多样性指数(He)为0.322 9±0.179 8,Shannon’s信息指数(I)为0.472 0±0.251 7。在其居群内,多态位点百分率为12%,He为0.115 4±0.044,I为0.168 0±0.065 3。Nei’s基因分化系数(Gst)为0.864 2。聚类分析表明,禄劝居群和东川居群聚为一支,丽江居群和会泽居群聚为一支。结论短柄乌头物种居群间的遗传多样性丰富,居群内的多样性偏低。居群间存在显著的遗传分化。AFLP对短柄乌头的遗传多样性分析对其保护提供依据。
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关键词
短柄乌头
aflp
遗传多样性
聚类分析
种质资源
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Keywords
Aconitum brachypodum Diels
aflp
genetic diversity
cluster analysis
germplasm resources
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分类号
R282.12
[医药卫生—中药学]
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