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人Daintain基因5'调控区序列的生物信息学分析
1
作者
颜冬菁
王青松
+3 位作者
唐敏
王咸寿
冯秋芳
陈正望
《现代生物医学进展》
CAS
2015年第21期4178-4181,共4页
目的:探讨人Daintain基因5’调控区的序列特征。方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher和TFSEARCH预测人Daintain基因启动子区域、CpG岛分布和转...
目的:探讨人Daintain基因5’调控区的序列特征。方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher和TFSEARCH预测人Daintain基因启动子区域、CpG岛分布和转录因子结合位点。结果:人Daintain基因5’调控区存在1个CAAT盒。Daintain基因可能存在6个启动子位点,CpG岛可能位于216bp区间(23~238bp)。评分85分以上时,该序列存在251个可能的转录因子结合位点;评分90分以上时,该序列存在70个可能的转录因子结合位点;评分95分以上时,该序列存在16个可能的转录因子结合位点;评分100分以上时,该序列存在7个可能的转录因子结合位点;这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关。结论:人Daintain基因5’调控区的生物信息学研究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控,为研究Daintain基因启动子的功能提供理论基础。
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关键词
人
daintain
基因
5’调控区
启动子
CPG岛
转录因子结合位点
原文传递
题名
人Daintain基因5'调控区序列的生物信息学分析
1
作者
颜冬菁
王青松
唐敏
王咸寿
冯秋芳
陈正望
机构
海南医学院理学院生化与分子生物学教研室
华中科技大学生命科学与技术学院
海南医学院理学院生物技术专业实验室
出处
《现代生物医学进展》
CAS
2015年第21期4178-4181,共4页
基金
国家自然科学基金项目(81460558
81172511)
海南医学院人才引进科研启动经费(2013005)
文摘
目的:探讨人Daintain基因5’调控区的序列特征。方法:利用在线软件BLAST、Neural Network Promoter Prediction、Promoter2.0、Promoter SCAN、EMBOSS、CpG Island Searcher和TFSEARCH预测人Daintain基因启动子区域、CpG岛分布和转录因子结合位点。结果:人Daintain基因5’调控区存在1个CAAT盒。Daintain基因可能存在6个启动子位点,CpG岛可能位于216bp区间(23~238bp)。评分85分以上时,该序列存在251个可能的转录因子结合位点;评分90分以上时,该序列存在70个可能的转录因子结合位点;评分95分以上时,该序列存在16个可能的转录因子结合位点;评分100分以上时,该序列存在7个可能的转录因子结合位点;这些结合的转录因子基本是与免疫细胞增殖或性别发生有关。结论:人Daintain基因5’调控区的生物信息学研究表明其转录受甲基化和多种转录因子的调控,为研究Daintain基因启动子的功能提供理论基础。
关键词
人
daintain
基因
5’调控区
启动子
CPG岛
转录因子结合位点
Keywords
human daintain gene
5' regulatory region
Promoter
CpG island
Transcriptional binding sites
分类号
R34 [医药卫生—基础医学]
Q756 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人Daintain基因5'调控区序列的生物信息学分析
颜冬菁
王青松
唐敏
王咸寿
冯秋芳
陈正望
《现代生物医学进展》
CAS
2015
0
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已选择
0
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参考文献
引证文献
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