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青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达
被引量:
4
1
作者
姚晓华
王越
+3 位作者
姚有华
安立昆
王燕
吴昆仑
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期1181-1190,共10页
为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO。HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋...
为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO。HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋白质编码区(CDS,coding domain sequence)在昆仑14号和1141品种中的一致性为100%,无内含子,全长3161 bp,包含一个3129 bp开放阅读框,编码1043个氨基酸,理论等电点为9.33,预测蛋白分子量为115,865.58 Da。蛋白质序列分析表明,HvMEL1 AGO为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域,属于AGO基因家族成员。进化树分析表明,HvMEL1 AGO与大麦AGO家族中HvAGO12、HvAGO18、HvAGO1D、HvAGO1B在拟南芥AGO家族系统发育树上属于AGO1一类;与HvAGO12的亲缘关系最近。蛋白质互作预测结果表明,在水稻中与MEL1作用密切的已知蛋白为DCL类,分别为DCL1、DCL2A、DCL3A、DCL3B和DCL4。半定量和定量PCR结果表明,条纹病胁迫下,抗病品种昆仑14号与感病品种1141的HvMEL1 AGO基因表达量显著下降;且1141显著高于昆仑14号(P<0.01)。推测青稞HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中发挥重要作用。本研究为探索HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中的作用及调控机制奠定基础。
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关键词
青稞
条纹病
hvmel1
ago
基因
基因表达
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职称材料
题名
青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达
被引量:
4
1
作者
姚晓华
王越
姚有华
安立昆
王燕
吴昆仑
机构
青海大学
青海省农林科学院/青海省青稞遗传育种重点实验室/国家麦类改良中心青海青稞分中心
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期1181-1190,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31960427,31660388)
青海省科技厅应用基础研究项目(2019-ZJ-7075)
+1 种基金
国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-05)
国家重点研发计划项目(2020YFD1001403)资助。
文摘
为筛选与青稞条纹病相关的AGO类基因,本研究以青稞抗病品种昆仑14号和感病品种1141为材料,从感病和正常叶片的转录组测序结果中获得一个差异表达的AGO家族新基因,克隆验证了该基因为青稞HvMEL1 AGO。HvMEL1 AGO基因全长3462 bp,其中蛋白质编码区(CDS,coding domain sequence)在昆仑14号和1141品种中的一致性为100%,无内含子,全长3161 bp,包含一个3129 bp开放阅读框,编码1043个氨基酸,理论等电点为9.33,预测蛋白分子量为115,865.58 Da。蛋白质序列分析表明,HvMEL1 AGO为亲水性的不稳定酸性蛋白,具有高度保守的DUF1785、PAZ和PIWI结构域,属于AGO基因家族成员。进化树分析表明,HvMEL1 AGO与大麦AGO家族中HvAGO12、HvAGO18、HvAGO1D、HvAGO1B在拟南芥AGO家族系统发育树上属于AGO1一类;与HvAGO12的亲缘关系最近。蛋白质互作预测结果表明,在水稻中与MEL1作用密切的已知蛋白为DCL类,分别为DCL1、DCL2A、DCL3A、DCL3B和DCL4。半定量和定量PCR结果表明,条纹病胁迫下,抗病品种昆仑14号与感病品种1141的HvMEL1 AGO基因表达量显著下降;且1141显著高于昆仑14号(P<0.01)。推测青稞HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中发挥重要作用。本研究为探索HvMEL1 AGO基因在青稞抗条纹病过程中的作用及调控机制奠定基础。
关键词
青稞
条纹病
hvmel1
ago
基因
基因表达
Keywords
hulless barley
leaf stripe
hvmel1 ago gene
relative expression level
分类号
S435.123 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
青稞新基因HvMEL1 AGO的克隆和条纹病胁迫下的表达
姚晓华
王越
姚有华
安立昆
王燕
吴昆仑
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
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