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三角帆蚌KuSPI基因的克隆及表达分析
1
作者
王雅昱
徐龙威
+2 位作者
汪桂玲
吴丛迪
李家乐
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期2374-2379,共6页
Kuntiz型丝氨酸蛋白酶抑制剂(Kuntiz-type serine proteinase inhibitor,KuSPI)又称胰腺胰蛋白酶抑制剂,能够和相应的蛋白酶互作来调控生物体内的级联反应。本研究通过RACE克隆得到三角帆蚌KuSPI cDNA全序列共624 bp,包含38 bp和148 bp...
Kuntiz型丝氨酸蛋白酶抑制剂(Kuntiz-type serine proteinase inhibitor,KuSPI)又称胰腺胰蛋白酶抑制剂,能够和相应的蛋白酶互作来调控生物体内的级联反应。本研究通过RACE克隆得到三角帆蚌KuSPI cDNA全序列共624 bp,包含38 bp和148 bp的5'和3'端UTR,ORF(open reading frame)438 bp,编码氨基酸145个,分子量为16 397.5 u,KuSPI氨基酸序列的同源性分析后发现其包含1个典型Kuntiz结构域,属于典型的KuSPI基因。qRT-PCR检测表明:KuSPI基因在闭壳肌、外套膜、肠、斧足、肝、血液、鳃、性腺和肾脏中均有表达,在外套膜中最高。利用嗜水气单胞菌进行诱导后发现,KuSPI基因在外套膜中表达量变化最大,呈现明显的先升高再降低趋势。外套膜是三角帆蚌先天免疫的首道防线,我们推测Ku SPI基因在其免疫反应中起到重要作用。
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关键词
三角帆蚌
kuspi
基因
表达分析
原文传递
三角帆蚌BPI/LBP基因cDNA的分子特征及表达分析
被引量:
1
2
作者
王芹
徐龙威
+2 位作者
汪桂玲
徐智诚
李家乐
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第9期3720-3727,共8页
杀菌通透性增加蛋白/脂多糖结合蛋白(bactericidal permeability-increasing protein/LPS-binding protein,BPI/LBP)在生物体的免疫应答过程中发挥着重要作用,但是在三角帆蚌中未见其相关的研究。我们采用RACE法获得三角帆蚌BPI/LBP基因...
杀菌通透性增加蛋白/脂多糖结合蛋白(bactericidal permeability-increasing protein/LPS-binding protein,BPI/LBP)在生物体的免疫应答过程中发挥着重要作用,但是在三角帆蚌中未见其相关的研究。我们采用RACE法获得三角帆蚌BPI/LBP基因c DNA全长(Gen Bank KX363568),该基因序列全长为1 793 bp,5'非编码区(untranslated region,UTR)和3'UTR分别为65 bp和219 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)1 509 bp,共编码氨基酸502个。氨基酸序列包括BPI1和BPI2两个结构域,同源性分析其与一些已知物种的BPI/LBP基因氨基酸发现各物种间具有相似的结构域,属于典型的BPI/LBP基因。q RT-PCR(Quantitative Real-time PCR)分析结果表明BPI/LBP基因表达于血液、肠、肾脏、外套膜、肝、腮、闭壳肌、性腺和斧足9个正常组织,表达量最高的是血液,最低的是肝脏。利用嗜水气单胞菌诱导后检测发现,血液、外套膜变化趋势最为明显,均呈现出先升高再降低的趋势,在3 h或12 h达到最大值,之后开始逐渐下降并趋于稳定,我们推测BPI/LBP基因在三角帆蚌的免疫反应中发挥着重要的作用。
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关键词
三角帆蚌
BPI/LBP
分子特征
表达分析
原文传递
三角帆蚌SOX2基因的分子鉴定及表达分析
被引量:
1
3
作者
徐智诚
刘斐斐
汪桂玲
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期3960-3966,共7页
SOX基因家族是一系列在性别分化、胚胎发育、细胞多功能性的维持等方面具有重要作用的转录因子,在高等脊椎动物中研究比较深入,但在淡水珍珠蚌中却很少见。本研究利用RACE法克隆获得了三角帆蚌SOX2基因的序列,其cDNA全长为1840bp,开放...
SOX基因家族是一系列在性别分化、胚胎发育、细胞多功能性的维持等方面具有重要作用的转录因子,在高等脊椎动物中研究比较深入,但在淡水珍珠蚌中却很少见。本研究利用RACE法克隆获得了三角帆蚌SOX2基因的序列,其cDNA全长为1840bp,开放阅读框为672bp,编码氨基酸223个。该基因具有SOX基因家族典型的HMG-box蛋白结构域,与其他物种对比发现,保守性极高。实时荧光定量PCR组织表达结果显示,在斧足中表达量最高,在肝脏中最低,同时发现雌雄性腺之间存在极显著性差异,雌性性腺表达量明显高于雄性性腺;性腺在早期胚胎中表达量明显高于其他时期,推测SOX2基因参与了三角帆蚌的性别分化和胚胎发育过程。
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关键词
三角帆蚌
SOX2
性腺
表达分析
原文传递
题名
三角帆蚌KuSPI基因的克隆及表达分析
1
作者
王雅昱
徐龙威
汪桂玲
吴丛迪
李家乐
机构
上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室
上海市水产养殖工程技术研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期2374-2379,共6页
基金
国家自然科学基金项目(31101939)
上海市教委科研创新重点项目(13ZZ128)
上海高校知识服务平台项目(ZF1206)共同资助
文摘
Kuntiz型丝氨酸蛋白酶抑制剂(Kuntiz-type serine proteinase inhibitor,KuSPI)又称胰腺胰蛋白酶抑制剂,能够和相应的蛋白酶互作来调控生物体内的级联反应。本研究通过RACE克隆得到三角帆蚌KuSPI cDNA全序列共624 bp,包含38 bp和148 bp的5'和3'端UTR,ORF(open reading frame)438 bp,编码氨基酸145个,分子量为16 397.5 u,KuSPI氨基酸序列的同源性分析后发现其包含1个典型Kuntiz结构域,属于典型的KuSPI基因。qRT-PCR检测表明:KuSPI基因在闭壳肌、外套膜、肠、斧足、肝、血液、鳃、性腺和肾脏中均有表达,在外套膜中最高。利用嗜水气单胞菌进行诱导后发现,KuSPI基因在外套膜中表达量变化最大,呈现明显的先升高再降低趋势。外套膜是三角帆蚌先天免疫的首道防线,我们推测Ku SPI基因在其免疫反应中起到重要作用。
关键词
三角帆蚌
kuspi
基因
表达分析
Keywords
hypriopsis cumingii
,
kuspi gene
,
expression analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
三角帆蚌BPI/LBP基因cDNA的分子特征及表达分析
被引量:
1
2
作者
王芹
徐龙威
汪桂玲
徐智诚
李家乐
机构
上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室
上海市水产养殖工程技术研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第9期3720-3727,共8页
基金
国家自然科学基金项目(31101939)
上海市教委科研创新重点项目(13ZZ128)
上海高校知识服务平台项目(ZF1206)共同资助
文摘
杀菌通透性增加蛋白/脂多糖结合蛋白(bactericidal permeability-increasing protein/LPS-binding protein,BPI/LBP)在生物体的免疫应答过程中发挥着重要作用,但是在三角帆蚌中未见其相关的研究。我们采用RACE法获得三角帆蚌BPI/LBP基因c DNA全长(Gen Bank KX363568),该基因序列全长为1 793 bp,5'非编码区(untranslated region,UTR)和3'UTR分别为65 bp和219 bp,开放阅读框(open reading frame,ORF)1 509 bp,共编码氨基酸502个。氨基酸序列包括BPI1和BPI2两个结构域,同源性分析其与一些已知物种的BPI/LBP基因氨基酸发现各物种间具有相似的结构域,属于典型的BPI/LBP基因。q RT-PCR(Quantitative Real-time PCR)分析结果表明BPI/LBP基因表达于血液、肠、肾脏、外套膜、肝、腮、闭壳肌、性腺和斧足9个正常组织,表达量最高的是血液,最低的是肝脏。利用嗜水气单胞菌诱导后检测发现,血液、外套膜变化趋势最为明显,均呈现出先升高再降低的趋势,在3 h或12 h达到最大值,之后开始逐渐下降并趋于稳定,我们推测BPI/LBP基因在三角帆蚌的免疫反应中发挥着重要的作用。
关键词
三角帆蚌
BPI/LBP
分子特征
表达分析
Keywords
Hyriopsis
cumingii
BPI/LBP
gene
Molecular characteristics
expression analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
三角帆蚌SOX2基因的分子鉴定及表达分析
被引量:
1
3
作者
徐智诚
刘斐斐
汪桂玲
机构
上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室
上海市水产养殖工程技术研究中心
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第9期3960-3966,共7页
基金
国家自然科学基金(31772835)
农业产业技术体系建设专项资金(CARS-49)共同资助
文摘
SOX基因家族是一系列在性别分化、胚胎发育、细胞多功能性的维持等方面具有重要作用的转录因子,在高等脊椎动物中研究比较深入,但在淡水珍珠蚌中却很少见。本研究利用RACE法克隆获得了三角帆蚌SOX2基因的序列,其cDNA全长为1840bp,开放阅读框为672bp,编码氨基酸223个。该基因具有SOX基因家族典型的HMG-box蛋白结构域,与其他物种对比发现,保守性极高。实时荧光定量PCR组织表达结果显示,在斧足中表达量最高,在肝脏中最低,同时发现雌雄性腺之间存在极显著性差异,雌性性腺表达量明显高于雄性性腺;性腺在早期胚胎中表达量明显高于其他时期,推测SOX2基因参与了三角帆蚌的性别分化和胚胎发育过程。
关键词
三角帆蚌
SOX2
性腺
表达分析
Keywords
Hyriopsis
cumingii
SOX2
gene
Gonad
expression
analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三角帆蚌KuSPI基因的克隆及表达分析
王雅昱
徐龙威
汪桂玲
吴丛迪
李家乐
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
原文传递
2
三角帆蚌BPI/LBP基因cDNA的分子特征及表达分析
王芹
徐龙威
汪桂玲
徐智诚
李家乐
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
原文传递
3
三角帆蚌SOX2基因的分子鉴定及表达分析
徐智诚
刘斐斐
汪桂玲
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2019
1
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