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三角帆蚌组织蛋白酶L基因的克隆和序列特征与进化分析
被引量:
9
1
作者
白志毅
汪桂玲
李家乐
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期104-111,共8页
组织蛋白酶L在多种生理过程中具有重要作用。根据本实验室构建的三角帆蚌(Hyriopsis cummgii)cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE方法克隆了三角帆蚌组织蛋白酶L基因的cDNA全序列(GenBank登录号为HQ610996)。结果表明,该序列全长为1 10...
组织蛋白酶L在多种生理过程中具有重要作用。根据本实验室构建的三角帆蚌(Hyriopsis cummgii)cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE方法克隆了三角帆蚌组织蛋白酶L基因的cDNA全序列(GenBank登录号为HQ610996)。结果表明,该序列全长为1 105 bp,包括24 bp的5′-末端非转录区,1 002 bp的开放阅读框和79 bp的3′-末端非转录区,共编码333个氨基酸,包含1个由20个氨基酸组成的信号肽。推测的三角帆蚌组织蛋白酶L前体肽具有组织蛋白酶前体抑制因子功能结构域,具有组织蛋白酶L家族高度保守结构基序ERFNIN[E-X3-R-X2-(L/V)-F-X3-N-X3-I-X3-N]、GNFD和GCXGG;该蛋白的半胱氨酸类蛋白酶半胱氨酸、组氨酸和天冬氨酸活性位点均高度保守。同源性分析表明,推测的三角帆蚌组织蛋白酶L氨基酸序列与其他贝类高度保守,同源性在60%-74%之间。进化分析显示,三角帆蚌组织蛋白酶L与其他贝类组织蛋白酶L聚为一支,在该支中,三角帆蚌与软体动物淡水螺(R.peregra)的亲缘关系最近。本研究结果为进一步研究三角帆蚌组织蛋白酶L的生理功能提供基础资料。
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关键词
三角帆蚌
组织蛋白酶
l
基因克隆
进化分析
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职称材料
题名
三角帆蚌组织蛋白酶L基因的克隆和序列特征与进化分析
被引量:
9
1
作者
白志毅
汪桂玲
李家乐
机构
上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
上海高校水产养殖学E-研究院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第6期104-111,共8页
基金
"973"计划前期研究专项项目(2009CB126001)
上海市科委地方院校能力建设项目(08390510100)
+1 种基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31001110)
上海市水产养殖重点学科建设项目(Y1101)
文摘
组织蛋白酶L在多种生理过程中具有重要作用。根据本实验室构建的三角帆蚌(Hyriopsis cummgii)cDNA文库中已标注的EST序列,利用RACE方法克隆了三角帆蚌组织蛋白酶L基因的cDNA全序列(GenBank登录号为HQ610996)。结果表明,该序列全长为1 105 bp,包括24 bp的5′-末端非转录区,1 002 bp的开放阅读框和79 bp的3′-末端非转录区,共编码333个氨基酸,包含1个由20个氨基酸组成的信号肽。推测的三角帆蚌组织蛋白酶L前体肽具有组织蛋白酶前体抑制因子功能结构域,具有组织蛋白酶L家族高度保守结构基序ERFNIN[E-X3-R-X2-(L/V)-F-X3-N-X3-I-X3-N]、GNFD和GCXGG;该蛋白的半胱氨酸类蛋白酶半胱氨酸、组氨酸和天冬氨酸活性位点均高度保守。同源性分析表明,推测的三角帆蚌组织蛋白酶L氨基酸序列与其他贝类高度保守,同源性在60%-74%之间。进化分析显示,三角帆蚌组织蛋白酶L与其他贝类组织蛋白酶L聚为一支,在该支中,三角帆蚌与软体动物淡水螺(R.peregra)的亲缘关系最近。本研究结果为进一步研究三角帆蚌组织蛋白酶L的生理功能提供基础资料。
关键词
三角帆蚌
组织蛋白酶
l
基因克隆
进化分析
Keywords
hyriopsis cumingii cathepsin l gene cloning evolution analysis
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
Q78 [生物学—分子生物学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
三角帆蚌组织蛋白酶L基因的克隆和序列特征与进化分析
白志毅
汪桂玲
李家乐
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
9
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