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玉米HD-ZIP I亚家族基因鉴定及表达分析
被引量:
6
1
作者
梁思维
姜昊梁
+4 位作者
翟立红
万小荣
李小琴
蒋锋
孙伟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期532-543,共12页
转录因子是植物响应逆境胁迫的重要调节因子,在其整个生长发育过程中发挥着重要的作用。HD-ZIP家族蛋白是植物中特有的一大类转录因子,包含4个亚家族(HD-ZIP I^IV),其中HD-ZIP I亚家族成员主要参与干旱、渗透压等极端环境和ABA及乙烯等...
转录因子是植物响应逆境胁迫的重要调节因子,在其整个生长发育过程中发挥着重要的作用。HD-ZIP家族蛋白是植物中特有的一大类转录因子,包含4个亚家族(HD-ZIP I^IV),其中HD-ZIP I亚家族成员主要参与干旱、渗透压等极端环境和ABA及乙烯等激素处理的响应过程。本文采用隐马可夫模型(HMM)在玉米参考基因组中鉴定到17个HD-ZIP I亚家族成员,这些基因不均匀分布于玉米6条染色体上,与水稻的亲缘关系要近于拟南芥。玉米HDZIP I亚家族基因在玉米7种组织中表现出多种表达模式,具有明显的组织表达特异性。另外, HD-ZIP I亚家族基因对高盐、淹水及冷害等不同的逆境胁迫处理呈现出不同的响应模式及响应程度差异。5种不同激素处理后,玉米HD-ZIP I亚家族基因也表现出复杂的响应模式。这些结果为进一步解析玉米HD-ZIP I亚家族基因的生物学功能和作用机理提供了一定的参考价值。
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关键词
HD-ZIP
i亚家族
逆境胁迫
表达分析
玉米
下载PDF
职称材料
题名
玉米HD-ZIP I亚家族基因鉴定及表达分析
被引量:
6
1
作者
梁思维
姜昊梁
翟立红
万小荣
李小琴
蒋锋
孙伟
机构
仲恺农业工程学院农业与生物学院
湖北文理学院医学院
出处
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第4期532-543,共12页
基金
国家自然科学基金项目(31901565)
广东省重点领域研发计划项目(2018B020202013)
广东省科学技术厅项目(粤科产学研字[2016]176号)资助~~
文摘
转录因子是植物响应逆境胁迫的重要调节因子,在其整个生长发育过程中发挥着重要的作用。HD-ZIP家族蛋白是植物中特有的一大类转录因子,包含4个亚家族(HD-ZIP I^IV),其中HD-ZIP I亚家族成员主要参与干旱、渗透压等极端环境和ABA及乙烯等激素处理的响应过程。本文采用隐马可夫模型(HMM)在玉米参考基因组中鉴定到17个HD-ZIP I亚家族成员,这些基因不均匀分布于玉米6条染色体上,与水稻的亲缘关系要近于拟南芥。玉米HDZIP I亚家族基因在玉米7种组织中表现出多种表达模式,具有明显的组织表达特异性。另外, HD-ZIP I亚家族基因对高盐、淹水及冷害等不同的逆境胁迫处理呈现出不同的响应模式及响应程度差异。5种不同激素处理后,玉米HD-ZIP I亚家族基因也表现出复杂的响应模式。这些结果为进一步解析玉米HD-ZIP I亚家族基因的生物学功能和作用机理提供了一定的参考价值。
关键词
HD-ZIP
i亚家族
逆境胁迫
表达分析
玉米
Keywords
HD-ZIP I subfamily
abiotic stress
expression analysis
maize
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
S513 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
玉米HD-ZIP I亚家族基因鉴定及表达分析
梁思维
姜昊梁
翟立红
万小荣
李小琴
蒋锋
孙伟
《作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
6
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