鹅星状病毒SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法的建立

为建立快速检测鹅星状病毒(GAstV)的方法,本研究根据GenBank中GAstV ORF2基因序列设计1对特异性引物,构建重组质粒pMD19-T-GAstV,以其作为标准品建立了GAstV的SYBR Green I荧光定量RT-PCR检测方法。优化其反应条件及体系,进行特异性、敏感性和重复性试验以及临床样本检测。试验结果显示,除GAstV外,禽白血病病毒(ALV)、血清4型禽腺病毒(FAdV-4)、鸡传染性喉气管炎病毒(ILTV)和鸡传染性贫血病病毒(CIAV)等常见禽病病原利用该方法检测均呈阴性,表明其特异性良好;建立的荧光定量RT-PCR检出的最低模板含量为1μl 3.75×101拷贝,敏感性较高;组内和组间重复性试验变异系数均小于1%。利用该方法对来自安徽地区的32份临床样品进行检测,阳性检出率为43.75%,常规PCR方法阳性检出率为18.75%,阳性检出符合率100%,表明该方法可用于临床样品检测。该方法的建立为临床样品中GAstV的快速高效检测提供了技术支持。

猪细小病毒SYBR Green I荧光定量PCR诊断试剂盒的研制

根据GenBank中猪细小病毒VP2基因序列设计特异性的引物,PCR扩增获得猪细小病毒VP2基因片段,并克隆到p MD-18T载体上作为阳性标准品。通过对SYBR Green I荧光定量PCR反应条件的优化,建立了猪细小病毒的SYBR Green I荧光定量PCR诊断方法,以此为基础研制出试剂盒。试剂盒扩增产物的熔解曲线分析只出现1个单特异峰,无引物二聚体,对PRV、PCV-2、E.coli、CSFV、PRRSV均无阳性信号扩增,可重复性好,测灵敏度可达1.0×101拷贝/μL。结果表明,研制的猪细小病毒SYBR Green I实时荧光定量PCR试剂盒具有特异、灵敏、快速、重复性好等优点,适合于猪细小病毒临床样品的检测。

环形泰勒虫SYBR Green I荧光定量PCR方法的建立及应用

为建立一种快速、敏感检测牛环形泰勒虫的方法,本研究根据GenBank中登录的牛环形泰勒虫Tams1基因序列,设计合成1对特异性引物,通过优化反应条件,建立了检测牛环形泰勒虫SYBR Green I荧光定量PCR检测方法。研究结果显示,该方法可以特异地检测牛环形泰勒虫,而对牛巴贝斯虫、反刍动物艾立希体和弓形虫检测均为阴性;该方法的灵敏度可达到180拷贝/μL,比常规PCR敏感10倍;组内和组间变异系数均小于1.0%。对15份临床血液样品和20只璃眼蜱进行检测,SYBR Green I荧光定量PCR和常规PCR的阳性检出率分别为42.86%和28.57%。本研究建立的SYBR Green I荧光定量PCR检测方法具有特异性强、敏感性高的特点,可准确、高效检测牛环形泰勒虫,为牛环形泰勒虫病防控提供技术支持。

鸽I型腺病毒SYBR Green I荧光定量PCR检测方法的建立

为建立鸽I型腺病毒(PIAdV-I)的快速检测方法,本研究根据PIAdV-I Fiber 2基因的保守区域设计特异性引物,通过优化反应条件,建立了快速检测PIAdV-I的SYBR Green I荧光定量PCR(qPCR)方法。建立的SYBR Green I qPCR方法的标准曲线结果显示,重组质粒标准品pMD19-Fiber在1×10^(3)拷贝/μL^(1)×10^(8)拷贝/μL时和Ct值之间的线性关系良好,相关系数R~2=0.995,扩增效率为90%。利用建立的qPCR方法对鸽II型腺病毒(PIAdV-II)Fiber 2基因保守区质粒标准品、鸽圆环病毒(PICV)、新城疫病毒(NDV)、多杀性巴氏杆菌(PM)和禽致病性大肠杆菌(APEC)的检测结果均为阴性,仅PIAdV-I检测为阳性,特异性强;该方法对浓度为1×10^(0)拷贝/μL^(1)×10^(8)拷贝/μL的重组质粒标准品进行检测,结果显示最低检测限为1×10^(2)拷贝/μL,而普通PCR最低检测限为1×10^(4)拷贝/μL,表明qPCR方法的敏感性更强;该方法批内、批间重复性试验的变异系数分别小于1%和2%,重复性好。利用建立的qPCR方法和普通PCR方法对从呼和浩特市某赛鸽公棚随机采集的30份鸽肝脏样品进行PIAdV-I检测,结果显示前者的阳性检测率为63.3%(19/30),普通PCR方法的阳性率为36.7%(11/30),两种方法的阳性符合率均为100%。本研究首次建立PIAdV-I的q PCR检测方法,为鸽PIAdV-I的感染提供了敏感、快速的检测手段。

延边白鹅CD4与CD8基因SYBR Green I荧光定量PCR方法的建立与应用

为建立延边白鹅CD4与CD8基因在细胞免疫中的动态变化的检测方法,本研究根据CD4与CD8基因保守区分别设计两对特异性引物,在克隆目的基因的基础上,进行TA克隆和转化,构建的阳性质粒作为标准品,经反应条件优化建立了检测延边白鹅CD4与CD8基因的荧光定量PCR方法,并进行特异性、敏感性和重复性试验。结果显示,建立的SYBR Green I荧光定量PCR方法在质粒标准品稀释倍数为101~108倍(CD4:1.2×10^8拷贝/μL^1.2×10^1拷贝/μL;CD8:1.8×10^8拷贝/μL^1.8×10^1拷贝/μL)范围内具有良好的线性关系,相关系数均为0.999,与其它相关鹅细胞因子基因不发生交叉反应,敏感性均是普通PCR的100倍,组内和组间变异系数均小于2%。初步应用本研究建立的方法检测鹅脾脏淋巴细胞CD4与CD8基因的转录水平,结果显示ConA可诱导目的基因转录水平升高,且显著高于PBS对照组(p<0.05)。本研究建立的SYBR Green I荧光定量PCR方法为进一步研究鹅细胞免疫水平和CD4、CD8生物学活性奠定了基础。

结核杆菌实时荧光定量PCR快速检测方法的建立及应用

针对结核杆菌CFP10基因序列设计并合成了1对引物,以构建的含有该引物扩增序列的重组质粒作为阳性标准品,建立了检测CFP10基因的SYBR GreenⅠreal-timePCR方法。检测结果显示,该方法线性关系好,标准曲线的相关系数达到0.997,对初始模板的检出下限为1×101copies/μL,比常规PCR方法高100倍。表明建立的real-time PCR检测方法灵敏度高、特异性强、重复性好,可以用于结核杆菌CFP10的病原检测及定量分析。

猪圆环病毒2型SYBR GreenⅠ荧光定量PCR诊断方法的建立

根据Gen Bank中猪圆环病毒2型ORF2基因序列设计特异性引物,PCR扩增获得猪圆环病毒2型ORF2基因片段,并克隆到p MD-18T载体上作为阳性标准品。通过对SYBR Green I荧光定量PCR反应条件的优化,建立了猪圆环病毒2型的SYBR Green I荧光定量PCR诊断方法。扩增产物的溶解曲线分析只出现1个单特异峰,无引物二聚体,对PRV、PPV、E.coli、CSFV、PRRSV均无阳性信号,可重复性好,测灵敏度可达4.0×101拷贝/μL。结果表明,建立的猪圆环病毒2型SYBR Green I实时荧光定量PCR具有特异、灵敏、快速、重复性好,适合于猪圆环病毒2型临床样品的检测。

乙型肝炎病毒SYBR GreenⅠ实时荧光定量PCR方法的建立及临床应用

目的建立 SYBR Green I实时荧光定量 PCR检测乙型肝炎病毒 DNA的快速方法，并探讨其临床应用价值。方法根据GenBank公布的Hepatitis B virus gp1基因序列设计引物，建立SYBR Green I实时荧光定量PCR，并对反应体系和扩增程序进行优化。定量标准品通过基因克隆方法获得，同时以浙江省夸克公司 HBV DNA定量检测试剂盒作对照，应用于随机选取的100份乙型肝炎患者血清检测。结果 SYBR Green I 实时荧光定量 PCR 检出限范围为5＆#215;102 copies／ml～5＆#215;108 copies／ml，HBV DNA浓度与CT值有良好线性关系，无交叉反应，整个过程仅需2.5 h。在随机抽取的100份临床标本应用中，与浙江省夸克公司的 HBV荧光定量 PCR检测试剂相比，建立的 SYBR Green I实时荧光定量PCR体系灵敏度100％，特异度92.5％。结论 SYBR Green实时荧光定量PCR快速、简便、灵敏度高、特异度强，可用于乙型肝炎患者病情监测，有效指导临床用药，准确评价 HBV感染者的病情。

禽脑脊髓炎病毒SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立与应用

利用禽脑脊髓炎病毒(Avian encephalomyelitis virus,AEV)YBF02株VPI基因序列设计一对特异性引物,通过对反应体系条件的确定和阳性质粒标准曲线的建立,建立了用于快速检测AEV含量的SYBR Green I荧光定量RT-PCR。结果显示:该方法能特异性地检测AEV YBF02株,且与其他禽类病毒无交叉反应;敏感性试验表明,该方法最低能检出10拷贝的AEV RNA模板,为普通PCR的100倍;使用该方法和鸡胚半数感染量(EID50)法对样品进行检测,二者具有良好的线性关系,且重复性试验的变异系数均小于4%。研究表明,建立的SYBR Green I荧光定量RT-PCR敏感性高、特异性强、重复性好,为AEV含量的快速检测提供了一种新的技术手段。

外源性雌二醇对异育银鲫脑垂体-甲状腺轴的影响

运用SYBR Green I荧光定量RT-PCR方法和放射免疫方法(RIA)分析了外源性雌二醇(estradiol-17β,E2)对异育银鲫脑垂体-甲状腺轴的影响。实验设计时间为10周,实验组每2周注射一次0.5mg.kg-1体重的E2(用57%酒精溶解),对照组注射同剂量的57%酒精。实验期间没有投喂饲料。在实验条件下,SYBR Green I荧光定量RT-PCR分析结果显示,注射3和5次外源性E2后,促甲状腺激素β亚基mRNA的表达水平与对照组相比均未有显著变化,但随着注射次数的增加,总体呈现升高的趋势。另一方面,RIA结果显示,注射3次外源性E2后,血清中甲状腺激素T3和T4含量水平与对照组相比均显著升高(P<0.05);注射5次后,与对照群相比差异极显著(P<0.01)。以上结果提示,外源性E2影响异育银鲫的正常生理状态。

牙龈卟啉菌和牙垢密螺旋体在不同深度牙周袋内的分布

目的：建立检测牙龈卟啉菌（Porphyromonas gingivalis，Pg）和牙垢密螺旋体（Treponema denticola，Td）的实时荧光定量PCR方法，探讨尸窖和喇的定植量与牙周状况的关系。方法：建立SYBRGreenI荧光实时定量PCR法检测Pg和Td细菌数量的方法。采集43例慢性牙周炎患者的龈下菌斑并检测Pg和Td的检出率和细菌量，同时记录取样位点的牙周探诊深度。结果：在10^2-10^7范围内细菌数与Ct值有良好的线性关系，最低检测到Pg和蹦的DNA模板为100拷贝。尸窖和刚在慢性牙周炎患者中的阳性检出率、共同检出率和两种细菌数量均随着牙周探诊深度的增加而升高，多组探诊深度间有统计学差异。结论：慢性牙周炎的牙周状况与欢和刚的细菌数量密切相关。

鸡白色念珠菌和烟曲霉双重SYBR Green Ⅰ荧光定量PCR检测方法的建立

为了对白色念珠茵和烟曲霉实现快速检测，分别设计特异性引物，建立了白色念珠菌和烟曲霉SYBR Green I双重荧光定量PCR检测方法。结果显示，该方法灵敏度高，对白色念珠菌和烟曲霉的最低检出量分别为4．34×10CFU／mL和3．76×10CFU／mL；重复性好，批内变异系数均小于1％；特异性强，与黄曲霉、土曲霉、黑曲霉、塔宾曲霉、光滑念珠茵、克柔念珠茵、热带念珠茵、近平滑念珠菌等病原真菌无交叉反应；耗时短．只需2h即可完成整个试验过程，可同时检测白色念珠菌和烟曲霉。上述结果表明，该方法可应用于白色念珠菌和烟曲霉感染的快速检测。