番茄抗枯萎病I-2基因的SNP分型

利用直接测序方法检测番茄抗感品种I-2基因的DNA序列,发现了2个SNPs。以其为3′端,设计等位基因特异引物及其互补引物,研究了特异引物3′端碱基错配类型和位置对等位基因特异PCR的影响,并对52份种质资源进行了SNP分型。结果表明在下游引物3′末端第1、2位引入错配碱基可以提高反应的准确性;引入C-T碱基错配的引物,退火温度在58℃时能把I-2基因的突变位点和感病品种的对应位点区分开来,为番茄抗枯萎病辅助育种提供了有力工具。

由基因序列开发番茄枯萎病抗性基因I-2的共显性分子标记

根据I-2的基因序列设计特异扩增引物对I-2/5F和I-2/5R,扩增I-2基因3132～3765bp之间片段,基因型为I-2/I-2的材料03F-7可扩增出633bp的条带,而基因型为i-2/i-2的材料Moneymaker可扩增出693bp的条带,杂合型材料可扩增出以上2个条带。通过这两个特异扩增片段的克隆和测序证明,抗病材料扩增的633bp片段为I-2基因的3132～3765bp之间的序列,而感病等位基因中出现大量的碱基突变和60bp片段插入。利用引物对I-2/5F和I-2/5R,可区分纯合抗病材料、杂合抗病材料和纯合感病材料,从而建立了I-2基因的共显性分子标记。在此基础上,利用该标记对16个主要番茄品种进行基因型鉴定,8个品种含有I-2基因,其中1个品种基因型为I-2/I-2,其他品种为I-2/i-2。通过一次PCR和一次HindⅢ酶切建立了I-2和Tm-22双基因检测体系,为多基因鉴定及标记辅助选择提供了有力工具。

番茄枯萎病抗性基因I-2的显性分子标记及其应用

番茄是世界上最主要的蔬菜作物之一，番茄枯萎病（Fusarium oxysporumf．sp．lycopersici）的发生和蔓延使番茄生产受到严重影响，培育抗枯萎病的番茄品种是控制该病害最经济有效的方法。本研究根据I-2的基因序列设计特异扩增引物，以不同抗病基因型的番茄为材料，扩增I-2基因3132～3640bp之间的单拷贝片段，基因型为，I-2／-的材料均特异地扩增出一条509bp的条带，而基因型为i-2/i-2的材料均无扩增条带。从而可建立了I-2基因的显性标记，对I-2基因进行分子识别。在此基础上，利用该标记对16个主要番茄品种进行了I-2基因鉴定，其中8个品种含有I-2基因。另外，本研究通过一次PCR和一次HindⅢ酶切建立了，-2和Tm-2^2双基因检测体系，为多基因鉴定及标记辅助选择提供了有力工具。