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利用Bayesian-MC MC方法进行畜禽远交群多家系离散性状QTL连锁检测 被引量:1
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作者 刘剑锋 王立贤 +1 位作者 张沅 张勤 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期773-777,共5页
利用Bayesian-MCMC方法对不同家系结构的畜禽远交群体的二级离散性状进行QTL连锁检测,在分析中,基于IBD方差组分的随机模型的定位策略,同时利用MCMC的3种不同抽样技术(Gibbs抽样、Metropolis抽样和ReversiblejumpMCMC抽样)产生相应QTL... 利用Bayesian-MCMC方法对不同家系结构的畜禽远交群体的二级离散性状进行QTL连锁检测,在分析中,基于IBD方差组分的随机模型的定位策略,同时利用MCMC的3种不同抽样技术(Gibbs抽样、Metropolis抽样和ReversiblejumpMCMC抽样)产生相应QTL参数的后验样本,在此基础上进行目标参数的Bayesian统计推断。结果表明:Bayesian-MCMC方法能够对QTL数目进行准确估计,并且在不同家系结构下得到较为理想的参数估计结果。 展开更多
关键词 复杂离散性状 QTL定位 Bayesian—MCMC方法 远交群 ibd方差组分随机模型
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利用Bayesian-MCMC方法进行畜禽复杂离散性状QTL定位 被引量:2
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作者 刘剑锋 张沅 +2 位作者 张勤 王立贤 张纪刚 《中国科学(C辑)》 CSCD 北大核心 2006年第3期240-246,共7页
复杂离散性状由于表型数据呈离散分布并且提供信息量过小,因此很难用常规的统计方法对此类性状的QTL进行定位研究.Bayesian-MCMC方法是复杂离散性状QTL定位的重要手段,该方法通过所有先验信息来推导QTL参数的后验分布并利用Markov Chai... 复杂离散性状由于表型数据呈离散分布并且提供信息量过小,因此很难用常规的统计方法对此类性状的QTL进行定位研究.Bayesian-MCMC方法是复杂离散性状QTL定位的重要手段,该方法通过所有先验信息来推导QTL参数的后验分布并利用Markov Chain随机过程进行抽样的方法对目标参数进行统计推断.利用Monte Carlo方法,针对畜禽远交群体模拟产生多个全同胞家系的2级分类复杂离散性状,然后基于IBD方差组分的随机模型的定位策略,同时利用MCMC的3种不同抽样技术(Gibbs抽样、Metropolis抽样和Reversible Jump MCMC抽样)产生相应QTL参数的后验样本,并进行了目标参数的Bayesian统计推断.结果表明:Bayesian-MCMC方法能够对不同家系结构和QTL效应水平下复杂离散性状QTL进行有效检测;当家系含量增加时, QTL定位的精确性和准确性提高,并可适用于效应更小QTL的检测. 展开更多
关键词 复杂离散性状 QTL定位 Bayesian-MCMC方法 远交群体 ibd方差组分随机模型
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