不同传染性法氏囊病病毒分离株VP2基因部分核酸序列及其编码蛋白的比较

根据已报告的传染性法氏囊病病毒（ Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ） ｃ Ｄ Ｎ Ａ 序列，在病毒 Ｖ Ｐ２ 区域，设计 １ 对引物，并在 ２ 引物上分别加 Ｐｓｔ Ⅰ和 Ｅｃｏ Ｒ Ｉ酶切位点。对 ２ 个 Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ 分离株 Ｊ Ｓ３ 和 Ｊ Ｓ４，用异硫氰酸胍酚氯仿抽提一步法提取病毒 Ｒ Ｎ Ａ，然后进行逆转录和 Ｐ Ｃ Ｒ 扩增，将扩增片段经酶切纯化后克隆于 ｐ Ｕ Ｃ１８ 质粒载体中，以双脱氧链末端终止法测定 ｃ Ｄ Ｎ Ａ 序列。将测定的分离株与标准对照株（ Ｓ１） Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ Ｖ Ｐ２ 基因片段的核苷酸序列进行计算机分析比较， Ｊ Ｓ３ 与 Ｓ１ 的同源性为 ９７％ ， Ｊ Ｓ４ 与 Ｓ１ 的同源性为 ９７％ ， Ｊ Ｓ３ 与 Ｊ Ｓ４ 的同源性为 ９９％ 。推导编码蛋白氨基酸序列， Ｊ Ｓ３ 和 Ｓ１ 的同源性为 ９７％ ， Ｊ Ｓ４ 与 Ｓ１ 的同源性为 ９６％ ， Ｊ Ｓ３ 和 Ｊ Ｓ４ 的同源性为 ９８％ 。这表明在我国流行的 Ｉ Ｂ Ｄ Ｖ 毒株与标准毒株相比不仅在免疫学反应上有差异，而且在病毒核酸序列上有变异，这种变异是造成疫苗免疫失败或免疫逃避的分子基础。