本研究利用NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库、在线工具SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)筛选含有IBR结构域的基因,然后通过MEGA7软件构建系统发生树,使用NCBI、PROSITE数据库分析水稻IBR...本研究利用NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库、在线工具SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)筛选含有IBR结构域的基因,然后通过MEGA7软件构建系统发生树,使用NCBI、PROSITE数据库分析水稻IBR基因家族结构,使用Plant-PLoc server软件预测水稻IBR蛋白的亚细胞定位,利用RiceXPro数据库分析水稻IBR家族基因的mRNA表达情况。结果表明,在水稻基因组中找到了124个含有IBR结构域的基因,这些基因在系统进化上被聚成A和B两大类别,其中A包括79个基因,B包括45个基因,每个类别又被分成两个亚族;玉米、大豆、高粱、拟南芥中的IBR蛋白嵌合到水稻系统发生树的4个分支内,含有IBR结构域的基因在水稻中进化更快;IBR结构域的N端RING finger结构域保守性高,水稻IBR家族是一类E3泛素连接酶;水稻IBR蛋白被定位在细胞核、高尔基体、叶绿体中,其中细胞核占96.8%;23个被检测到的IBR家族基因有15个至少在一个组织或器官中表达[FPKM(Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped)>1],其中12个显示了较高的mRNA表达水平(FPKM>3)。展开更多
The mixed-field effect at the hyperfine level of the rovibronic ground state of the^(127)I^(79)Br(X^(1)Σ,v=0,J=0)molecule is computed on the J-I uncoupled basis of|JM_(J)I_(1)M_(1)I_(2)M_(2)>,where J is the molecu...The mixed-field effect at the hyperfine level of the rovibronic ground state of the^(127)I^(79)Br(X^(1)Σ,v=0,J=0)molecule is computed on the J-I uncoupled basis of|JM_(J)I_(1)M_(1)I_(2)M_(2)>,where J is the molecular total angular momentum excluding nuclear spin,M_J is the projection number of J,I_(1) and I_(2) are the nuclear spins of the iodine and bromine atoms,and M_(1) and M_(2) are the projection numbers of I_(1) and I_(2),respectively.When the two applied electric and magnetic fields are parallel,the perturbations are rare and only one perturbation is observed in a relatively large field regime in our computation range.However,when the two fields are off-parallel,the perturbations increase significantly and some sublevels show the Feshbach-like resonance phenomenon.Therefore,such sublevels transit between weak-field seeking and strong-field seeking repeatedly,which can be utilized to enhance or suppress cold molecular collision and chemical reaction rates.Such behavior of the molecular hyperfine structure in the mixed off-parallel fields may also be utilized to construct an electric-field-assisted anti-Helmholtz magnetic trap for cold molecules and to realize evaporative cooling of cold molecules(sub-mK)into the ultracold regime(μK).展开更多
IBRS-2细胞出现分化变异影响使用,为不影响正常的科学研究,本研究采用单细胞克隆的方法重新提纯,用96孔板经过3周的独立培养后,将具有代表性的4株进行扩增,然后用已知毒价的口蹄疫病毒(foot and mouth disease virus,FM-DV)弱毒分别对...IBRS-2细胞出现分化变异影响使用,为不影响正常的科学研究,本研究采用单细胞克隆的方法重新提纯,用96孔板经过3周的独立培养后,将具有代表性的4株进行扩增,然后用已知毒价的口蹄疫病毒(foot and mouth disease virus,FM-DV)弱毒分别对其进行接毒试验和TCID50测定。结果表明,B1株克隆细胞的病变最为理想,其TCID50为7.60,比提纯前的4.52更接近实际毒价7.85,且和实际毒价无显著差异。展开更多
牛传染性鼻气管炎(IBR)是牛的一种严重传染病,遍及世界各地,我国大部分地区有此病流行,其病原是一种α疱疹病毒.该病毒在自然界存在许多毒株,其差异可以通过 DNA 酶切图谱、多肽图谱及单克隆抗体加以区分.IBR 病毒 DNA 被两个反向重复...牛传染性鼻气管炎(IBR)是牛的一种严重传染病,遍及世界各地,我国大部分地区有此病流行,其病原是一种α疱疹病毒.该病毒在自然界存在许多毒株,其差异可以通过 DNA 酶切图谱、多肽图谱及单克隆抗体加以区分.IBR 病毒 DNA 被两个反向重复序列分割成一长的单一序列(LS)和一短的单一序列(SS),两个重复序列及夹在中间的 SS 序列可以沿轴旋转180度,使病毒 DNA 分子具有两种异构体.SS 区与病毒的致病性及免疫原性均有关系,因此,这一区域的变异将对病毒的弱化及疫苗株的培育具有重要意义.本试验将在 MDBK(牛肾)细胞上繁殖的 IBR 病毒 LA 株接种到猫肾传代细胞上连续传7代后,直接从感染的细胞中按 Pignatti 等的方法抽提病毒 DNA,用限制性内切酶展开更多
文摘本研究利用NCBI(National Center for Biotechnology Information)数据库、在线工具SMART(Simple Modular Architecture Research Tool)筛选含有IBR结构域的基因,然后通过MEGA7软件构建系统发生树,使用NCBI、PROSITE数据库分析水稻IBR基因家族结构,使用Plant-PLoc server软件预测水稻IBR蛋白的亚细胞定位,利用RiceXPro数据库分析水稻IBR家族基因的mRNA表达情况。结果表明,在水稻基因组中找到了124个含有IBR结构域的基因,这些基因在系统进化上被聚成A和B两大类别,其中A包括79个基因,B包括45个基因,每个类别又被分成两个亚族;玉米、大豆、高粱、拟南芥中的IBR蛋白嵌合到水稻系统发生树的4个分支内,含有IBR结构域的基因在水稻中进化更快;IBR结构域的N端RING finger结构域保守性高,水稻IBR家族是一类E3泛素连接酶;水稻IBR蛋白被定位在细胞核、高尔基体、叶绿体中,其中细胞核占96.8%;23个被检测到的IBR家族基因有15个至少在一个组织或器官中表达[FPKM(Fragments Per Kilobase of transcript per Million fragments mapped)>1],其中12个显示了较高的mRNA表达水平(FPKM>3)。
基金Project supported by the National Natural Science Foundation of China (Grant No.12004199)。
文摘The mixed-field effect at the hyperfine level of the rovibronic ground state of the^(127)I^(79)Br(X^(1)Σ,v=0,J=0)molecule is computed on the J-I uncoupled basis of|JM_(J)I_(1)M_(1)I_(2)M_(2)>,where J is the molecular total angular momentum excluding nuclear spin,M_J is the projection number of J,I_(1) and I_(2) are the nuclear spins of the iodine and bromine atoms,and M_(1) and M_(2) are the projection numbers of I_(1) and I_(2),respectively.When the two applied electric and magnetic fields are parallel,the perturbations are rare and only one perturbation is observed in a relatively large field regime in our computation range.However,when the two fields are off-parallel,the perturbations increase significantly and some sublevels show the Feshbach-like resonance phenomenon.Therefore,such sublevels transit between weak-field seeking and strong-field seeking repeatedly,which can be utilized to enhance or suppress cold molecular collision and chemical reaction rates.Such behavior of the molecular hyperfine structure in the mixed off-parallel fields may also be utilized to construct an electric-field-assisted anti-Helmholtz magnetic trap for cold molecules and to realize evaporative cooling of cold molecules(sub-mK)into the ultracold regime(μK).
文摘IBRS-2细胞出现分化变异影响使用,为不影响正常的科学研究,本研究采用单细胞克隆的方法重新提纯,用96孔板经过3周的独立培养后,将具有代表性的4株进行扩增,然后用已知毒价的口蹄疫病毒(foot and mouth disease virus,FM-DV)弱毒分别对其进行接毒试验和TCID50测定。结果表明,B1株克隆细胞的病变最为理想,其TCID50为7.60,比提纯前的4.52更接近实际毒价7.85,且和实际毒价无显著差异。
文摘牛传染性鼻气管炎(IBR)是牛的一种严重传染病,遍及世界各地,我国大部分地区有此病流行,其病原是一种α疱疹病毒.该病毒在自然界存在许多毒株,其差异可以通过 DNA 酶切图谱、多肽图谱及单克隆抗体加以区分.IBR 病毒 DNA 被两个反向重复序列分割成一长的单一序列(LS)和一短的单一序列(SS),两个重复序列及夹在中间的 SS 序列可以沿轴旋转180度,使病毒 DNA 分子具有两种异构体.SS 区与病毒的致病性及免疫原性均有关系,因此,这一区域的变异将对病毒的弱化及疫苗株的培育具有重要意义.本试验将在 MDBK(牛肾)细胞上繁殖的 IBR 病毒 LA 株接种到猫肾传代细胞上连续传7代后,直接从感染的细胞中按 Pignatti 等的方法抽提病毒 DNA,用限制性内切酶
