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鳜传染性脾肾坏死病毒ICR489基因序列分析
被引量:
3
1
作者
邓敏
何建国
+2 位作者
翁少萍
吕玲
何华虹
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期64-67,共4页
报道了鳜鱼传染性脾肾坏死病毒 (ISKNV)的ICR489基因结构及其序列分析。对ISKNVDNAKpnⅠB酶切片段的序列分析结果发现该序列中含有完整的ICR489基因。ISKNVICR489基因完整读码框为 10 11bp ,GC含量为 5 6 97% ,等电点为 6 82 ,编码一...
报道了鳜鱼传染性脾肾坏死病毒 (ISKNV)的ICR489基因结构及其序列分析。对ISKNVDNAKpnⅠB酶切片段的序列分析结果发现该序列中含有完整的ICR489基因。ISKNVICR489基因完整读码框为 10 11bp ,GC含量为 5 6 97% ,等电点为 6 82 ,编码一个长为 337aa、相对分子质量为 382 70的推定蛋白。结构分析发现该基因起始密码子上游具有启动子元件TATAbox,有反向重复序列可形成茎环 ,并有一段回文序列。ISKNV与其它 3种虹彩病毒 (FV3、RRV和LCDV_1)的ICR489基因氨基酸序列具有一定的同源性 ,但ISKNV与它们的同源性不高 。
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关键词
虹彩病毒
传染性脾肾坏死病毒
icr489基因
序列分析
系统进化
鳜鱼
基因
结构
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职称材料
题名
鳜传染性脾肾坏死病毒ICR489基因序列分析
被引量:
3
1
作者
邓敏
何建国
翁少萍
吕玲
何华虹
机构
中山大学生命科学学院
出处
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2002年第1期64-67,共4页
基金
广东省自然科学基金资助项目 (990 2 5 5 )
文摘
报道了鳜鱼传染性脾肾坏死病毒 (ISKNV)的ICR489基因结构及其序列分析。对ISKNVDNAKpnⅠB酶切片段的序列分析结果发现该序列中含有完整的ICR489基因。ISKNVICR489基因完整读码框为 10 11bp ,GC含量为 5 6 97% ,等电点为 6 82 ,编码一个长为 337aa、相对分子质量为 382 70的推定蛋白。结构分析发现该基因起始密码子上游具有启动子元件TATAbox,有反向重复序列可形成茎环 ,并有一段回文序列。ISKNV与其它 3种虹彩病毒 (FV3、RRV和LCDV_1)的ICR489基因氨基酸序列具有一定的同源性 ,但ISKNV与它们的同源性不高 。
关键词
虹彩病毒
传染性脾肾坏死病毒
icr489基因
序列分析
系统进化
鳜鱼
基因
结构
Keywords
iridovirus
ISKNV
icr
489
gene
sequence analysis
phylogeny
分类号
S941.419 [农业科学—水产养殖]
Q754 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
鳜传染性脾肾坏死病毒ICR489基因序列分析
邓敏
何建国
翁少萍
吕玲
何华虹
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2002
3
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