染色质免疫沉淀技术分析HePG2细胞TCF7L2蛋白与IDE基因转录启动子的结合

TCF7L2是一种重要的转录因子,通过Wnt信号途径,调节葡萄糖代谢.胰岛素降解酶(IDE)是细胞水平催化胰岛素降解的最关键的酶,与2型糖尿病(T2DM)高血糖、胰岛素抵抗、高胰岛素血症密切相关.为了检测HePG2细胞内转录因子TCF7L2与IDE基因启动子区的结合情况,采用染色质免疫沉淀技术结合PCR技术检测IDE基因启动子序列.结果表明,在特异性TCF7L2抗体免疫沉淀的DNA片段中扩增出IDE基因启动子序列,因此证实在HePG2细胞内,TCF7L2蛋白可与IDE基因转录启动子的特异区域结合,进而可能参与IDE基因的表达调控.

人IDE基因启动子生物信息学分析

对人IDE基因启动子进行生物信息学分析以获得人IDE基因启动子、CpG岛及转录因子结合位点特征.从UCSC基因组数据库成功获得人IDE基因5’调控区2 000bp序列.Promoter2.0、FPROM、NNPP预测人IDE基因分别有3个、2个、6个启动子.Relative profile score threshold选择80%、85%、90%、95%、100%时,JASPAR预测该序列存在5170、1771、454、87和5个可能的转录因子结合位点.Relative profile score threshold选择80%,搜索到6个潜在的TCF7L2转录因子结合位点.采用进化足迹法,LAGAN预测方法获得位于人和小鼠同源IDE基因启动子保守区域相同位置的转录因子结合位点为14个,包含转录因子SPI-1、cap、c-FOS、FREAC-3、c-ETS、Cdxa、HSF2等.发现一个CpG岛,位于1 303~1 705bp之间,大小为403bp.人IDE基因启动子、CpG岛及转录因子结合位点的生物学信息学分析,为下一步基因表达调控实验奠定了基础.

IDE基因的研究进展

胰岛素降解酶(IDE)基因的表达产物胰岛素降解酶能降解多种蛋白质和肽,其功能改变将导致底物如胰岛素、β淀粉样蛋白的代谢异常,引起机体病理性改变。IDE基因位于10q23q25,含25个外显子,全长约120kb,其异常与高胰岛素血症、2型糖尿病、阿尔茨海默病的发生有关。单核苷酸多态性研究发现,IDE基因的rs4646953、rs1887922、rs2251101多态性与2型糖尿病有关,rs1887922、rs2251101位点多态性分别对男性糖化血红蛋白、2h胰岛素水平有显著影响。

阿尔茨海默病遗传学病因的新发现

目前,许多人类染色体将面临加强对可能隐藏与阿尔茨海默病有关基因的研究。来自于基因组筛查研究的新数据表明,部分染色体(至少9个)可能与该疾病的发生有关。