鸡IFITM/IFIT基因家族中与抗禽流感病毒相关的关键基因挖掘

为深入了解分析鸡IFITM/IFIT基因家族的特性,以禽流感病毒攻毒后的鸡RNA-seq数据为研究对象,通过加权基因共表达网络分析,构建了鸡的肺组织对不同亚型禽流感免疫反应的加权基因共表达网络,并对其模块进行了性状关联性分析与功能富集分析,进而筛选出鸡IFITM/IFIT基因家族中与抗禽流感病毒胁迫相关的枢纽基因。结果显示:鸡IFITM/IFIT基因家族成员中,IFITM2,IFITM3和IFIT5基因参与应答禽流感病毒诱发的免疫反应。其中,IFIT5基因属于H5N1病毒早期免疫应答模块的枢纽基因,在H5N1病毒诱发的早期免疫通路中发挥重要作用。

干扰素诱导的四肽重复序列(IFIT)基因家族蛋白抗病毒作用机制研究进展

机体在病毒感染后激活自身先天性免疫反应,表达大量干扰素(interferon, IFN),这些干扰素进一步激活JAK-STAT通路,从而诱导表达一类干扰素刺激基因(IFN stimulated genes, ISGs),干扰素诱导的四肽重复序列(interferon-induced proteins with tetratricopeptide repeats, IFIT)基因家族就是其中之一。IFIT基因家族蛋白可通过抑制病毒基因组复制和蛋白转录来发挥抗病毒活性,在保护宿主细胞正常生长、发育、代谢和繁殖方面发挥重要功能。本研究就目前IFIT基因家族的基因结构、蛋白特征和抗病毒作用机制的研究进展进行总结,为后续深入研究IFIT基因家族天然免疫机制,制定更加科学有效的思路提供参考。