基因芯片分析IFRD1表达沉默后肝癌细胞周期相关基因表达的变化

目的:分析IFRD1基因表达下调后人肝癌细胞周期中基因的改变,探讨该基因影响肝癌细胞增殖的机制。方法:采用RNA干扰技术下调目的基因表达,再用基因芯片检测人肝癌细胞表达谱的改变,重点分析细胞周期通路中基因的表达变化。结果:IFRD1干扰后,细胞周期蛋白和CDK表达上调,而抑制因子CKI以下调为主;G1/S期检测点p21、p57表达均下调;S期MCM蛋白复合体以下调为主,ORC表达均下调,而CDC6和CDC45表达也下调,提示染色体复制受阻。结论:IFRD1表达沉默后,细胞生长活跃,G1-S期转换顺利,而S期DNA合成受到抑制,有丝分裂检测点受阻,最终导致细胞增殖分裂受限。

RNAi检测IFRD1在肝癌增殖中的作用及不同中医治法的调节

目的:观察不同中医治法对大鼠肝癌干扰素相关发育调节因子1(IFRD1)表达的调控差异,以及IFRD1在人肝癌细胞增殖中的作用。方法:(1)采用二乙基亚硝胺(DEN)诱发大鼠肝癌,分别经中药健脾益气、清热解毒、活血化瘀等治疗后,Affymetrix rat 230A GeneChip arrays检测肝癌组织IFRD1表达的差异;(2)设计3个人IFRD1基因siRNA靶点,将重组质粒电转入SMMC-7721人肝癌细胞株,MTT法检测细胞生长增殖情况、Realtime-PCR检测该基因的表达差异。结果:(1)芯片结果显示,IFRD1基因在大鼠肝癌形成后表达显著增加,不同中医治法对其具有不同程度的下调作用,其中活血化瘀治法下调作用较明显,对照西药化疗反而具有上调作用;(2)采用MTT法筛选到1个IFRD1基因RNA干扰有效靶序列,转染144h后细胞的生长增殖得到了明显的抑制(与阴性对照组相比,P<0.01);(3)实时荧光定量PCR检测表明,转染72h后该基因的表达明显降低。结论:SMMC-7721肝癌细胞恶性增殖有赖于IFRD1基因的高表达,而中药活血化瘀治法对其具有下调作用。

IFRD1基因在房间隔缺损患者心房肌组织中表达的变化及意义

目的探讨IFRD1(interferonrelateddevelopmentalregulator1)基因mRNA在房间隔缺损(ASD)患者心房肌组织中表达水平的变化,分析IFRD1基因异常表达在ASD病因及病理生理学中的意义。方法获取10例单纯Ⅱ孔型ASD患者和8例正常人右房心耳肌组织标本,采用RTPCR技术检测心房肌组织中IFRD1基因mRNA的表达丰度。结果IFRD1基因在正常心房肌组织中的表达丰度为(60.56±22.07)%,在ASD患者心房肌组织中的表达丰度为(30.95±11.81)%,显著低于正常对照(t=3.6560,P<0.01)。结论IFRD1基因在心房肌组织中的异常表达可能与ASD的病因及病理生理学有关。

IFRD1基因表达下调对人肝癌细胞细胞株SMMC-7721基因表达谱的影响

目的探讨IFRD1表达下调后人肝癌细胞SMMC-7721基因表达谱的改变。方法采用脂质体lipo2000将构建的含目的基因shRNA的质粒转染入SMMC-7721细胞,并应用Affymetrix U133 plus 2.0 array基因芯片检测目的基因表达下调后,该细胞基因表达谱的变化。结果 RNA干扰抑制IFRD1基因表达后,基因芯片检测发现25476个基因中,表达量发生明显改变的有4221个(上下调大于等于1.5倍),上调的基因有1109个,下调的有3 112个;这些基因涉及到细胞周期、细胞凋亡、DNA复制等通路。结论 IFRD1基因表达下调后,人肝癌细胞SMMC-7721基因表达谱发生明显变化,与细胞生长增殖关系密切的细胞信号通路也发生了明显的改变。

IFRD对牙科合金细菌粘附影响的实验研究

目的:研究氟化物控释装置(IFRD)对细菌在牙科常用合金表面粘附的影响。方法:将抛光后的Co-Cr合金和Ti合金试样各均分为8组,测定表面粗糙度后在无IFRD环境中(A、B、C、D组)和IFRD环境中(A1、B1、C1、D1组)进行细菌粘附实验,并分别于1 h、4 h、8 h、24 h取出,测定各组样本表面细菌粘附面积百分比并进行统计学检验。结果:Co-Cr合金A、B、C、D、A1、B1、C1、D1各组样本表面粗糙度分别为(0.171±0.012)μm、(0.169±0.013)μm、(0.171±0.015)μm、(0.172±0.012)μm、(0.170±0.011)μm、(0.168±0.009)μm、(0.174±0.015)μm、(0.172±0.010)μm,其细菌粘附面积比分别为(19.56±5.75)%、(30.12±6.48)%、(48.94±5.37)%、(79.28±8.19)%,(10.82±3.13)%、(13.04±4.36)%、(17.96±4.86)%、(24.38±5.89)%;钛合金A、B、C、D、A1、B1、C1、D1组表面粗糙度分别为(0.292±0.003)μm、(0.295±0.014)μm、(0.289±0.011)μm、(0.290±0.010)μm、(0.291±0.009)μm、(0.290±0.013)μm、(0.294±0.016)μm、(0.291±0.011)μm,其细菌粘附面积比分别为(24.36±5.59)%、(35.28±6.87)%、(51.45±5.82)%、(82.03±7.69)%.(16.15±4.31)%、(18.34±4.95)%、(22.59±6.90)%、(31.17±4.27)%。经统计学分析表明,无论是Ti合金还是Co-Cr合金使用IFRD后细菌粘附面积比均显著少于未使用IFRD组(P<0.01)。结论:IFRD对细菌在金属表面的粘附有明显的抑制作用,可减少菌斑的附着。

IFRD1基因在大鼠胚胎心脏发育中的表达

目的检测大鼠胚胎心脏发育过程中IFRD1基因mRNA及蛋白的表达。方法取大鼠胚胎12、15、19 d心脏,应用RT-PCR、Western-blot、免疫组织化学技术检测胚胎大鼠心脏IFRD1基因mRNA及蛋白表达。结果在大鼠胚胎12、15、19 d心脏中,IFRD1基因mRNA及蛋白均有表达,且呈逐渐下调趋势;其蛋白主要表达于心房、心室、肌小梁等处心肌组织,而在心内膜垫、瓣膜、流出道、大血管内层等处未见表达。结论IFRD1基因的表达随大鼠胚胎心脏的生长发育逐渐下调,且特异表达于大鼠胚胎心脏心房、心室、肌小梁等处心肌组织,可能与心脏发育密切相关。

转录调节因子IFRD1基因研究进展

干扰素相关发育调节因子1(interferon-related developmental regulator 1,IFRD1)基因编码一种与干扰素相关的蛋白质。在胚胎发育和组织再生过程中,该蛋白质可能作为一种转录共激活因子/抑制因子控制特定细胞类型的生长和分化。IFRD1基因在动物的肌肉发育、脂肪形成及小鼠肠道发育中发挥重要作用,为改善肉类品质提供了理论基础,同时也与其他系统发育及疾病发生相关。文章对IFRD1基因的结构特点、调控组织发育和疾病发生中的功能及其在畜禽方面的研究进展进行了综述,以期为该家族的后续研究提供新思路。

肠功能恢复汤对前列腺癌术后肠道功能恢复的影响

目的:探讨术后使用肠功能恢复汤(intestine function recovery decoction,IFRD)对前列腺癌术后早期肠道功能恢复的影响。方法:回顾性分析西安交通大学第一附属医院泌尿外科2012年10月至2017年6月完成前列腺癌手术患者的临床病理资料,共计144例,根据术后是否进行了灌肠治疗及灌肠使用的方法分为未灌肠组、肥皂水组和IFRD组,对比研究三组患者术后恢复情况及差异。多因素Logistic(逐步法)回归进一步研究影响前列腺癌术后胃肠道功能恢复的危险因素。结果:一般基线资料比较显示三组患者之间无显著差异(P>0.05);Logistic多因素回归分析显示,手术方式、术前新辅助治疗、年龄大于65岁、术后合并症是影响术后胃肠道功能恢复的危险因素(P<0.05);术后情况比较显示,术后腹腔引流量、留置引流管时间以及术后住院时间IFRD组均显著优于其他两组(P<0.05);术后首次排便时间及饮水时间IFRD组均明显优于其他两组(P<0.05);与传统的灌肠剂肥皂水比较,IFRD组术后首次排便时间、引流量及引流时间分别为(3.24±1.51)d、(15.10±3.36)ml、(3.86±1.16)d,均明显低于肥皂水组(4.44±1.78)d、(23.38±17.20)ml、(4.51±2.11)d(P<0.05)。结论:根治性前列腺癌术后给予IFRD灌肠可显著减少腹腔引流量及引流管留置时间;可促进患者胃肠道功能的恢复以及缩短术后住院时间,有助于促进患者术后排气排便,降低术后近期并发症。

氟化物控释装置对钛合金表面粗糙度影响的初步研究

目的:研究氟化物控释装置防龋对钛合金表面粗糙度的影响。方法:成品钛基台样本24个,随机均分4组。A、B、C组分别在加入2粒氟化物控释装置的20mL人工唾液中浸泡5、10、25d,D组在20mL人工唾液中浸泡25d作为空白对照。用干涉显微镜测量各组样本的表面粗糙度。结果:A、B、C组样本的表面粗糙度分别为(0.302±0.025)μm、(0.311±0.035)μm、(0.330±0.039)μm,D组的表面粗糙度为(0.292±0.030)μm。经统计学分析,空白对照组样本与其他各组样本表面粗糙度无显著性差异(P>0.05),A、B、C组样本两两之间亦无显著性差异(P>0.05)。结论:应用氟化物控释装置对钛合金表面无显著影响,表面粗糙度不随时间变化而变化。

陆地棉干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析

干扰素相关发育调节因子(interferon-related developmental regulator factor,IFRD)主要参与植物耐盐机制和-ABA-信号传导途径。为深入了解陆地棉IFRD基因家族功能,本研究通过对锦葵科植物陆地棉IFRD基因家族成员进行了染色体定位、亚细胞定位、构建进化树、基因结构可视化、motif序列检测、构建蛋白互作网络及表达模式等生物信息学分析,鉴定得到了15个陆地棉IFRD基因家族成员,分布在陆地棉的九条染色体上,根据系统发育树分析将其分为两个亚家族,亚家族Ⅰ成员与锦葵科植物同源性较高、亚家族Ⅱ成员与锦葵科和蔷薇科同源性较高;GhIFRD亚家族Ⅱ成员在陆地棉各组织中表达量比亚家族Ⅰ成员较高,推测其参与陆地棉生长发育的调控;GhIFRD亚家族Ⅰ、亚家族Ⅱ都有部分成员响应逆境胁迫。通过陆地棉蛋白互作发现陆地棉IFRD可能参与mRNA的剪切、核糖体的加工以及核糖体上蛋白起始翻译、DNA损伤修复过程。启动子分析显示:亚家族Ⅰ成员GhIFRD13具有较多的激素类调节元件与逆境响应元件,推测其在陆地棉逆境胁迫响应中起重要作用。研究表明陆地棉IFRD基因家族可能通过mRNA可变剪切、蛋白质合成参与陆地棉生长发育以及高温、低温、盐胁迫等逆境响应途径。本研究为进一步研究陆地棉IFRD基因家族功能提供了参考,为研究陆地棉响应逆境胁迫的分子机制提供了新方向。

水稻干扰素相关发育调节因子的生物信息学分析

干扰素相关发育调节因子(interferon-related developmental regulator factor, IFRD)在动物中有较深入研究,参与动物细胞发育和分化及多种疾病的发生,但是在植物中研究较少。为了挖掘植物IFRD基因的功能,本研究对禾本科模式作物水稻IFRD基因家族成员进行了系统的生物信息学分析。本研究鉴定得到5个水稻IFRD基因家族成员,分布在4条染色体上,根据进化树把它们分为2个亚家族,不同亚家族成员具有不同的基因组结构、蛋白质保守基序和表达模式。高温、盐胁迫处理后的转录组测序分析结果显示,该基因家族成员(OsIFRD3, OsIFRD4)对逆境的响应变化差异显著;蛋白质相互作用分析结果显示水稻IFRDs可能与mRNA可变剪接因子、甲硫氨酰t RNA合成酶、rRNA加工蛋白相互作用;启动子分析显示水稻IFRD启动子具有非生物胁迫和植物激素响应元件。综上表明水稻IFRD基因家族可能通过调控m RNA可变剪接和蛋白质的合成参与高温、盐胁迫逆境响应途径。本研究为深入解析水稻IFRD基因功能提供了重要信息。