IGFBP-3基因多态性及其与中国美利奴羊部分羊毛性状的关联性分析

采用PCR-SSCP方法对中国美利奴羊和哈萨克羊中IGFBP-3基因的多态性进行了检测,并对不同基因型与中国美利奴羊部分羊毛性状间的关联性进行了分析。结果在位于内含子1区的一段178bp的扩增产物经SSCP分析后出现了3种基因型,基因型AA、AB和BB及等位基因A、B在中国美利奴羊中的频率分别为0.70、0.24、0.06和0.82、0.18;在哈萨克羊中的频率分别为0.87、0.13、0.00和0.93、0.07。序列分析发现:在该序列的122位碱基表现多态性(g.122G>T)。所研究的两个群体在该位点上均处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.01)。不同基因型对部分羊毛性状有一定的影响:不同基因型个体在剪毛后体重和净毛率上没有明显差异。AA、AB及BB基因型个体的羊毛伸直长度逐渐变短,其中AA与AB基因型之间差异极显著(P<0.01)。AA型个体的剪毛量和羊毛密度要明显低于AB型(P<0.01)和BB型个体(P<0.05);羊毛纤维直径则明显高于AB型(P<0.01)和BB型(P<0.05)个体。

IGFBP-3基因PCR-RFLP多态性与中国荷斯坦牛泌乳性状的相关分析

以胰岛素样生长因子结合蛋白3(IGFBP-3)基因作为中国荷斯坦牛部分泌乳性状的候选基因,在对61头中国荷斯坦牛进行PC R-R FLP分析的基础上,对中国荷斯坦牛群体中IGFBP-3基因座多态性与泌乳性状进行相关分析。结果表明:IGFBP-3基因座对产奶量、乳蛋白率和体细胞评分的影响显著(P<0.05),IGFBP-3 BB型个体的305 d产乳量显著(P<0.05)高于AA型和AB型,BB型个体的乳蛋白率和体细胞评分显著(P<0.05)低于AB型。

山羊IGFBP-3基因多态性与体重、屠体性状的关系

以波尔山羊及其杂交后代为实验材料,通过PCR-RFLP技术检测到每个群体均有X spⅠ多态,测序后发现A→G转换是导致出现多态性的原因。对该位点与体尺性状进行最小二乘分析时发现:该位点与断奶重和眼肌面积有关(P<0.05):AG型显著大于GG型(P<0.05),且有AG>AA>GG规律。

山羊IGFBP-3基因的遗传分析及其与经济性状的关系

用PCR-RFLP技术对7个山羊群体的501个个体进行了检测,结果发现:每个群体均存在XspⅠ多态,表现为3种基因型,均以杂合型AG居多,以GG最少,等位基因A和G在每个群体中基本稳定,7个群体均处于Hardy-weinberg平衡状态(P>0.05),且基因型在群体间的分布也不存在显著差异(P>0.05)。序列分析表明:扩增片段包括山羊IGFBP-3基因的部分exon2、完整intron2和exon3及部分intron3,与奶山羊、绵羊、奶牛相应序列的同源性依次为99.1%、98.1%、94.1%。同时与经济性状的最小二乘分析表明:波尔山羊及其杂交后代的该位点与断奶体质量和眼肌面积有关(P<0.05),对3月龄体长和胸围有极显著影响(P<0.01),与10月龄体长、胸围和12月龄体长相关(P<0.05),AG基因型均显著或极显著地大于GG型,且呈现AG>AA>GG的趋势。

西藏小型猪IGFBP-3基因甲基化与表达差异分析

为研究西藏小型猪类胰岛素生长因子结合蛋白3(IGFBP-3)基因甲基化及表达差异,对IGFBP-3基因的CpG岛甲基化程度、mRNA及蛋白表达水平进行分析,并以军牧一号猪为对照。结果表明:西藏小型猪肝脏组织中IGFBP-3基因CpG岛甲基化水平显著高于军牧一号猪(P<0.05);西藏小型猪不同组织中IGFBP-3mRNA表达量均显著高于军牧一号猪(P<0.05);同时肾脏中IGFBP-3蛋白含量显著高于军牧一号猪(P<0.05)。这为猪生长发育调控及促生长机制提供了分子依据。

IGFBP-3基因在两个品种鸡组织中的表达及其与生长性状的相关性分析

为研究IGFBP-3基因表达与鸡生长性状的相关性,以生长速度差异较大的花山麻鸡和清远麻鸡两个黄羽肉鸡品种为研究素材,用实时荧光定量PCR法检测胚胎期和出雏后两个品种鸡胸肌和肝脏中IGFBP-3基因的表达规律,并将其与体重、胸肌重和肝脏重进行相关性分析。结果表明,在9胚龄时两个品种鸡胸肌和肝脏中均可检测到IGFBP-3基因表达,同一胚龄或日龄品种内组织间比较,胚胎期两个品种鸡胸肌IGFBP-3 mRNA表达量均高于肝脏,出雏后肝脏IGFBP-3 mRNA表达量迅速上升,胸肌IGFBP-3 mRNA表达量下降,两个品种鸡肝脏IGFBP-3 mRNA表达量均极显著高于胸肌(P<0.01);组织中IGFBP-3 mRNA表达量与组织重量和体重相关研究表明,两个品种鸡肝脏IGFBP-3 mRNA表达量与其胸肌重、肝脏重和体重呈显著或极显著正相关(P<0.05;P<0.01),胸肌IGFBP-3 mRNA表达量与其胸肌重、肝脏重和体重均呈极显著负相关(P<0.01)。研究结果揭示,IGFBP-3 mRNA在鸡中的表达具有品种、年龄和组织特异性,出雏前肝脏并不是鸡产生IGFBP-3的主要器官,出雏后鸡IGFBP-3可能主要由肝脏合成,肝脏中IGFBP-3 mRNA水平差异是导致两个品种鸡出雏后体重和胸肌重差异的重要因素。

鸡IGFBP-3基因多态性及其与生产性能的相关性

为研究胰岛素样生长因子结合蛋白-3基因(IGFBP-3)多态性及其对鸡生产性能的影响,采用DNA测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技术分析了基因单核苷酸多态性,并与鸡的生产性能进行相关分析。结果显示,共发现2个SNPs位点(T160G和C1087T),其中C1087T位点导致MspⅠ酶切位点的改变,T160G和C1087T位点对鸡开产日龄具有显著影响(P<0.05),T160G位点还对鸡的生长性状具有显著影响(P<0.05),AB基因型个体初生质量显著高于BB基因型(P<0.05),8周龄体质量显著高于AA基因型(P<0.05)。研究结果初步显示,IGFBP-3基因可能是影响鸡生长繁殖性状的一个主效基因或是与之存在紧密遗传连锁的一个标记。

鸡IGF1R、IGFBP-3基因SNP位点之间互作效应分析

以IGF1R、IGFBP-3基因作为影响鸡生产性能的候选基因,采用DNA测序和PCR-SSCP技术分析了单核苷酸多态性(SNP),并对两基因SNP位点之间的互作效应进行相关分析。结果表明,在IGF1R和IGFBP-3基因中分别发现2个SNP位点(IGF1R基因的G26333A和G26336A,IGFBP-3基因的T160G和C1087T),其中IGF1R基因G26336A位点对鸡的生长性状具有显著的影响(P<0.05);G26336A位点DD基因型个体8周龄体质量显著高于CC基因型(P<0.05),DD基因型个体12周龄体质量显著高于CC和CD基因型(P<0.05);IGFBP-3基因C1087T位点GH基因型个体的开产日龄显著低于HH基因型(P<0.05)。IGF1R基因G26336A位点与IGFBP-3基因C1087T位点之间对12周龄体质量有互作效应。可见,IGF1R和IGFBP-3基因可能是影响鸡生产性状的主效基因。

IGFBP-3基因核苷酸变异与绵羊屠宰性状相关性分析

胰岛素样生长因子结合蛋白与动物的生长发育有密切的联系。为了探讨IGFBP-3基因作为绵羊屠宰性状候选基因的可能性,采用单链构象多态性结合测序方法检测592只甘肃高山细毛羊IGFBP-3基因的变异特征,并分析核苷酸变异与屠宰性状的相关性。结果表明,绵羊IGFBP-3第4外显子区检测到1个单核苷酸变异位点(g.87 A>C),A和B 2个等位基因(等位基因频率:56.76%,43.24%),表现为AA、AB和BB 3种基因型(基因型频率:29.73%,54.05%,16.22%),并且所研究的群体在该位点上处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。相关性结果表明,甘肃高山细毛羊IGFBP-3基因g.87 A>C处的变异对宰前活质量、热胴体质量有极显著影响(P<0.01);对眼肌面积、GR值、嫩度有显著影响(P<0.05)。表明等位基因B的绵羊群体具有更高的屠宰率,可以作为甘肃高山细毛羊屠宰性状选育的分子标记用于生产实践中。

不同绵羊品种IGFBP-3基因的PCR-SSCP分析

IGFBP-3是血清中IGFs的主要载体,对动物的生长发育具有重要的调节作用。本文针对在绵羊IGFBP-3基因内含子1处发现的一个SNP位点.利用PCR-SSCP方法,对我国不同地方品种和外来品种绵羊中进行了分析检测。

IGF-1和IGFBP-3基因多态性与非吸烟女性肺癌关联研究

目的：探讨胰岛素样生长因子-1（IGF-1）和胰岛素样生长因子结合蛋白-3（IGFBP-3）单核苷酸多态性与非吸烟女性肺癌发病的关系。方法：采用TaqMan单核苷酸多态性分型技术，检测287例中国汉族女性肺癌患者和281例正常女性对照者IGF-1和IGFBP-3基因位点的基因型。结果：IGF-1基因rs2946834位点的三种基因型（CC/CT/TT）在女性非吸烟肺癌患者和对照间的分布具有显著性差异（P〈0.001），与TT基因型相比，CC基因型显著降低女性肺癌的发病风险（OR=0.28，95%CI：0.15～0.54）。另外，在非吸烟女性中，IGF-1（rs1520220）GG基因型可降低晚期肺癌发病风险（OR=0.30，95%CI：0.09～0.96）。结论：IGF-1基因单核苷酸多态性可能与女性非吸烟肺癌的发病相关，这一结论有待于大样本以及功能学研究的进一步证实。

IGFBP-3基因多态性与中国美利奴羊(新疆型)部分毛性状的关联性分析

【目的】寻找IGFBP-3基因在中国美利奴羊(新疆型)中的SNP位点,分析基因的多态性,并分析不同基因型个体在体重、油汗、光泽、毛长度评分、毛弯曲评分、毛弯曲数、毛细度评分、体格大小、剪毛量、平均直径、变异系数等经济性状上的差异显著性,为羊毛性状的候选基因提供理论基础。【方法】通过PCR-SSCP的方法,检测分析基因的多态性,用Excel软件进行数据的初步整理,用SAS8.1软件进行方差分析。【结果】得到两种基因型:AA和AB两种基因型,基因型频率分别为0.78和0.22,等位基因A和B的基因频率分别为0.89和0.11,A等位基因为优势等位基因,序列分析表明突变发生在序列片段的81碱基处且为G→C突变(g.81 G>C)。所研究绵羊群体在该位点为Hardy-Weinberg不平衡状态(0.01<P<0.05)。【结论】不同基因型的个体间在毛长性状上差异极显著,AA基因型要低于AB基因型(P<0.01);在毛细度评分上差异显著(0.01<P<0.05);在体重、油汗、光泽、弯曲数、体格大小、剪毛量、平均直径和变异系数上差异不显著(P>0.05)。IGFBP-3基因可以作为毛长度选择的一个候选基因。

IGFBP-3基因mRNA表达水平在胶质母细胞瘤患者预后评价中的意义

目的探讨IGFBP-3基因转录表达水平在胶质母细胞瘤（GBM）患者预后评价中的意义。方法采用训练-验证分组方式,利用GBM在线样本库TCGA、REMBRANDT和GSE16011中病例的临床资料和芯片数据,通过Kaplan-Meier法和Cox回归分析,探讨IGFBP-3 mRNA表达与GBM患者总生存时间（OS）的关系。结果在TCGA训练组中,IGFBP-3基因高表达患者的中位OS为14.3个月（95%CI：12.5~16.1个月）,显著差于低表达的15.9个月（95%CI：13.7~18.1个月）,差异具有统计学意义（P=0.002）;REMBRANDT病例组中,IGFBP-3高、低表达组患者的中位OS分别为13.2个月（95%CI：10.8~15.6个月）和16.8个月（95%CI：13.4~20.1个月）,差异具有统计学意义（P=0.036）;GSE16011病例组的中位OS分别为7.4个月（95%CI：6.6~8.3个月）和13.1个月（95%CI：9.2~17.0个月）,差异具有统计学意义（P〈0.001）。多因素Cox回归分析及亚型分层分析表明,IGFBP-3 mRNA表达分组的预后评价能力可能依赖于不同的GBM基因表达亚型。结论IGFBP-3 mRNA表达水平与GBM患者的临床预后密切相关,且可能与不同的基因表达亚型有关。

边鸡胰岛素生长因子结合蛋白-3基因外显子2 MspⅠ位点对繁殖性状的遗传效应分析

本研究采用PCR-RFLP技术检测边鸡类胰岛素生长因子结合蛋白-3(insulin-like growth factor binding proteins-3,IGFBP-3)基因外显子2 MspⅠ位点的单核苷酸多态性,并与边鸡的繁殖性状进行相关分析。结果表明,在边鸡IGFBP-3基因的1087bp处检测到1个C→T的突变,显示3种基因型(CC、CT和TT),C等位基因为优势等位基因。最小二乘分析结果表明,CT基因型的开产体重显著高于CC基因型(P<0.05)。不同基因型对其余4个繁殖性状(开产日龄、开产蛋重、300日龄产蛋数及300日龄蛋重)均无显著影响(P>0.05)。

鸡IGF1、IGF2基因的遗传互作效应

以IGF1、IGF2基因作为影响鸡生产性能的候选基因,采用DNA测序和PCR-SSCP技术分析2个基因的单核苷酸多态性及互作效应。结果表明,IGF1基因P1位点与IGF2基因P2位点对12、16周龄鸡的质量存在互作效应。

秦川牛高档牛肉产量的分子标记研究

以 IGFBP- 3基因作为侯选基因 ,对秦川牛群体中 IGFBP- 3位点与秦川牛高档牛肉产量的关系进行了分析。结果发现 ,不同基因型对秦川牛高档牛肉产出率有一定影响 ,AA、AB及 BB型个体的屠宰率、净肉率及西冷、牛柳、眼肉和嫩肩肉的产率逐渐降低 ,但差异不显著 (P>0 .0 5 ) ;AA型个体的眼肌面积大于 BB型个体 (P<0 .0 5 ) ,AB型和 BB型个体胴体脂肪含量高于 AA型个体 (P<0 .0 1)